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不同方法检测江淮大豆育种种质群体农艺性状QTL的效果分析

目录第1-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第11-23页
 1 作物数量性状基因/QTL定位方法研究现状第11-17页
   ·连锁分析方法第11-13页
   ·关联分析方法第13-17页
   ·两类方法的比较第17页
 2 大豆产量、农艺性状QTL定位与利用研究概况第17-20页
   ·连锁分析第17-18页
   ·关联分析第18-19页
   ·育种利用第19-20页
 3 我国江淮地区大豆育种亲本创制和利用研究进展第20-21页
   ·大豆育种目标与主要进展第20-21页
   ·大豆育种优异亲本的发掘和利用第21页
 4 本研究的目的及意义第21-23页
第二章 材料和方法第23-29页
 1 试验材料第23页
 2 田间试验、性状调查与数据分析第23页
 3 分子标记基因型及群体结构分析第23-25页
   ·InDel标记多样性分析第23-24页
   ·群体结构分析第24页
   ·材料间基于标记的亲本系数(Kinship)计算第24页
   ·群体连锁不平衡分析第24-25页
 4 不同关联方法检测效果的模拟分析第25-26页
   ·模拟数据的生成方法第25页
   ·关联定位方法(模型)的选择第25-26页
   ·不同关联方法检测功效和假发现率的比较第26页
 5 YHSBGP群体农艺性状QTL的关联定位研究第26页
   ·基于MLM模型的关联分析第26页
   ·基于逐步回归方法的关联分析第26页
   ·关联定位结果的比较第26页
 6 早熟大粒优异亲本的遗传解析和组配研究第26-29页
   ·标记效应值的估计第27页
   ·候选亲本的筛选第27页
   ·子代效应值的估计第27-29页
第三章 YHSBGP群体遗传结构和群体农艺性状遗传变异分析第29-37页
 1 YHSBGP群体INDEL标记多样性分析第29-32页
 2 群体结构分析第32页
 3 基于标记对群体内个体间的亲缘关系估计第32-33页
 4 YHSBGP群体连锁不平衡分析第33-35页
 5 群体表型数据的描述性统计和方差分析第35-36页
 6 讨论第36-37页
第四章 不同关联分析方法检测效果的模拟分析第37-43页
 1 模拟数据的生成第37页
 2 模拟数据的关联定位结果分析第37-39页
   ·GLM模型的关联定位结果分析第38页
   ·MLM_K和MLM_Q+K模型的关联定位结果分析第38页
   ·基于逐步回归的关联定位结果分析第38-39页
 3 关联分析方法效果的比较第39-41页
 4 讨论第41-43页
第五章 YHSBGP群体5个农艺性状的关联分析第43-61页
 1 基于MLM_Q+K模型的关联分析第43-46页
   ·5个农艺性状关联定位结果第43-44页
   ·与已报道QTL的比较第44-46页
 2 基于逐步回归方法的关联分析第46-54页
   ·5个农艺性状关联定位结果第46-53页
   ·与已报道QTL的比较第53-54页
 3 两种关联方法结果的比较第54-57页
   ·百粒重第54-55页
   ·生育期性状第55-56页
   ·株高与主茎节数第56-57页
 4 讨论第57-61页
   ·关联分析的优劣第57-58页
   ·两种方法关联结果的比较第58-61页
第六章 早熟大粒优异亲本的遗传解析和组配研究第61-67页
 1 大粒品系的筛选与组配研究第61-63页
   ·百粒重关联等位变异的效应值估计第61-62页
   ·大粒材料的筛选第62页
   ·子代效应值的估计第62-63页
   ·优异亲本的选配第63页
 2 早熟品系的筛选与组配研究第63-66页
   ·全生育期关联等位变异的效应值估计第63-64页
   ·早熟材料的筛选第64-65页
   ·子代效应值的估计第65页
   ·优异亲本的选配第65-66页
 3 讨论第66-67页
全文结论及创新之处第67-69页
参考文献第69-75页
附表第75-89页
致谢第89页

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