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三种豆科作物菜豆普通花叶病毒分离物的分子鉴定及全基因组序列测定和分析

中文摘要第1-8页
Abstract第8-10页
1 前言第10-21页
   ·菜豆普通花叶病毒简介第10-15页
     ·菜豆普通花叶病毒的发生第10页
     ·菜豆普通花叶病毒的寄主范围第10-11页
     ·菜豆普通花叶病毒的传播第11页
     ·菜豆普通花叶病毒的症状表现第11-12页
     ·BCMV 的株系划分第12-13页
     ·BCMV 的基因组结构和组成第13-14页
     ·BCMV 的分子检测第14页
     ·BCMV 全基因组序列的研究第14-15页
   ·植物病毒的遗传变异第15-16页
   ·大豆、扁豆、绿豆在我国的种植情况及主要病害第16-20页
     ·我国大豆的种植情况及主要病害第16-17页
       ·我国大豆的种植情况第16-17页
       ·我国大豆的主要病害第17页
     ·我国扁豆的种植情况及主要病害第17-19页
       ·我国扁豆的种植情况第17-18页
       ·我国扁豆的主要病害第18-19页
     ·我国绿豆的种植情况及主要病害第19-20页
       ·我国绿豆的种植情况第19页
       ·我国绿豆的主要病害第19-20页
   ·本研究的目的和意义第20-21页
2 材料与方法第21-38页
   ·材料第21-22页
     ·样品的采集第21页
     ·菌株和载体第21页
     ·生化及分子生物学试剂第21页
     ·主要实验仪器第21-22页
     ·实验所需试剂及配制第22页
     ·寡核苷酸引物的合成第22页
   ·实验方法第22-36页
     ·植物总 RNA 的提取第22-24页
     ·引物的设计第24-28页
       ·BCMV 大豆分离物(BCMV-SB)的引物设计第24-26页
       ·BCMV 扁豆分离物(BCMV-HB)的引物设计第26-27页
       ·BCMV 绿豆分离物(BCMV-MB)的引物设计第27-28页
     ·反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)第28-32页
       ·反转录第28页
       ·聚合酶链式反应(PCR)第28-32页
     ·PCR 产物的克隆第32-34页
       ·琼脂糖凝胶电泳第32-33页
       ·PCR 产物回收第33-34页
     ·回收产物的连接反应第34页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第34-35页
     ·连接产物转化大肠杆菌第35页
     ·碱裂解法提取质粒 DNA (参照《分子克隆》第三版)第35-36页
     ·重组质粒鉴定第36页
   ·序列的测定、拼接与分析第36-38页
     ·DNA 序列的测定第36页
     ·DNA 序列的拼接及分析第36-38页
3 结果第38-85页
   ·全基因组序列的克隆第38-39页
     ·扩增策略第38页
     ·扩增结果第38-39页
       ·BCMV-SB 的扩增结果第38页
       ·BCMV-HB 的扩增结果第38页
       ·BCMV-MB 的扩增结果第38-39页
   ·重组质粒的电泳鉴定及 PCR 鉴定第39-41页
   ·全基因组核酸及氨基酸序列分析第41-69页
     ·BCMV-SB 的全基因组核酸及氨基酸序列分析第41-50页
     ·BCMV-HB 的全基因组核酸及氨基酸序列分析第50-59页
     ·BCMV-MB 全基因组核酸及氨基酸序列分析第59-69页
   ·三个分离物与其他 BCMV 株系全基因组的一致率分析比较第69-72页
     ·BCMV-SB 与其他 BCMV 株系全基因组的一致率分析比较第69页
     ·BCMV-HB 与其他 BCMV 株系全基因组的一致率分析比较第69-71页
     ·BCMV-MB 与其他 BCMV 株系全基因组的一致率分析比较第71页
     ·BCMV-SB、HB、MB 分离物之间的一致率比较第71-72页
   ·重组分析第72-81页
     ·BCMV-SB 与其他 BCMV 株系的重组分析第72-75页
     ·BCMV-HB 与其他 BCMV 株系的重组分析第75-78页
     ·BCMV-MB 与其他 BCMV 株系的重组分析第78-81页
   ·系统进化分析第81-85页
4 讨论第85-88页
5 结论第88-89页
参考文献第89-96页
攻读硕士学位期间发表论文情况第96-97页
致谢第97-98页
附件第98页

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