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高温胁迫诱导的可变剪切调控植物MicroRNA加工的研究

目录第1-11页
中文摘要第11-14页
Abstract第14-17页
1 前言第17-44页
   ·miRNA(microRNA)的发现及特征第17-21页
     ·miRNA 的发现第17-18页
     ·miRNA 的特征第18-19页
     ·miRNA 与其它小分子 RNA 的区别和联系第19-21页
   ·miRNA 的生物合成及加工第21-24页
     ·miRNA 的重要合成加工蛋白第21-22页
     ·miRNA 的合成过程第22-24页
   ·miRNA 的作用机制第24-26页
     ·靶基因 mRNA 的剪切降解第24页
     ·靶基因翻译水平的抑制第24-25页
     ·靶基因表观遗传学水平的调控第25-26页
   ·miRNA 对基因表达调控的作用第26-31页
     ·miRNA 对植物生长发育的调控第26-27页
     ·miRNA 对植物响应逆境胁迫的调控第27-31页
   ·miRNA 的自身调节机制第31-34页
     ·miRNA 加工复合体的调节第31-32页
     ·miRNA 自身反馈调节第32-33页
     ·miRNA 的模拟靶基因竞争调节第33-34页
   ·植物可变剪切的发现和特点第34-35页
     ·可变剪切的发现第34页
     ·可变剪切的特点第34-35页
   ·动植物 mRNA 剪切的序列特征第35-36页
   ·mRNA 剪切位点识别第36-37页
   ·可变剪切的种类第37-38页
   ·可变剪切过程中参与的重要蛋白第38-39页
   ·逆境胁迫影响可变剪切第39-40页
   ·miRNA 的可变剪切第40-42页
   ·本研究的目的及其意义第42-44页
2 材料与方法第44-60页
   ·实验材料第44-45页
     ·植物材料第44页
     ·菌株与质粒第44页
     ·酶与生化试剂第44页
     ·实验所用引物与寡核苷酸第44-45页
   ·方法第45-60页
     ·拟南芥基因组提取第45-46页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第46页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第46页
       ·大肠杆菌感受态细胞的转化第46页
     ·小量碱法提取大肠杆菌中的质粒第46-47页
     ·农杆菌 GV3101 感受态细胞的制备及转化第47-48页
       ·农杆菌 GV3101 感受态细胞的制备第47页
       ·农杆菌 GV3101 感受态细胞的转化第47-48页
     ·拟南芥的遗传转化第48页
     ·转基因拟南芥的鉴定第48页
     ·转基因植物的 GUS 组织化学染色分析第48-49页
     ·GUS 活性测定第49-50页
     ·RNA 提取第50页
     ·RNA 中基因组 DNA 的去除第50页
     ·反转录合成一链 cDNA第50-51页
     ·Real-Time PCR 体系及反应条件第51页
     ·农杆菌介导的本生烟瞬时侵染第51-52页
     ·Northern 杂交分析第52-54页
       ·RNA 电泳第52页
       ·转膜第52-53页
       ·杂交第53-54页
     ·Small RNA 的提取第54-56页
       ·Small RNA 实验准备第54-55页
       ·Small RNA 分离步骤第55-56页
     ·Small RNA 的 Northern 杂交分析第56-58页
       ·聚丙烯酰胺尿素变性凝胶与样品的制备第56-57页
       ·Small RNA 电泳检测第57页
       ·Small RNA 转膜第57页
       ·P32-ATP 标记的寡聚核苷酸探针合成第57页
       ·用寡核苷酸探针检测小 RNA第57-58页
     ·Small RNA 的 qRT-PCR 分析第58-60页
       ·miRNA 第一链合成第58-59页
       ·Mature miRNA 荧光定量检测第59-60页
3 结果与分析第60-95页
   ·拟南芥中胁迫相关 miRNA 的筛选鉴定第60-64页
     ·利用拟南芥 miRNA 芯片鉴定胁迫相关的 miRNA第60-61页
     ·miR400 序列分析第61-62页
     ·miR400 与宿主基因共转录第62-64页
   ·拟南芥 miR400 表达模式分析第64-66页
     ·启动子活性检测载体构建第64页
     ·转基因拟南芥 GUS 染色及活性分析第64-66页
   ·拟南芥 miR400 对低温胁迫的响应第66-69页
     ·低温胁迫诱导 miR400 及宿主基因表达第66-68页
     ·低温胁迫在转录水平上调控 miR400 及宿主基因表达第68-69页
   ·拟南芥 miR400 对高温胁迫的响应第69-72页
     ·高温胁迫诱导 miR400 原初转录物的表达第69-71页
     ·高温胁迫抑制 miR400 成熟体的表达第71-72页
   ·高温胁迫诱导 miR400 可变剪切的发生第72-75页
     ·高温胁迫诱导 miR400 可变剪切的分析第72-73页
     ·可变剪切的发生造成 miR400 前体转录物的积累第73-75页
   ·高温胁迫触发的可变剪切影响 miR400 成熟体的表达第75-78页
     ·可变剪切载体的构建第75-77页
     ·可变剪切对 miR400 成熟体的影响第77-78页
   ·剪切信号对 miR400 可变剪切的影响第78-81页
     ·高温胁迫下 miR400 剪切信号的变化第78-80页
     ·可变剪切信号对 miR400 加工的影响第80-81页
   ·可变剪切重要蛋白 SR 对 miR400 加工过程的影响第81-83页
   ·拟南芥 miR400 的功能研究第83-86页
     ·miR400 超表达载体构建与 miR400 突变体纯合体筛选第83-84页
     ·miR400 参与植物抵御高温胁迫的功能分析第84-86页
   ·拟南芥 miR400 靶基因的筛选和初步鉴定第86-88页
     ·miR400 靶基因筛选第86-87页
     ·miR400 靶基因鉴定第87-88页
   ·可变剪切调控 miRNA 机制的普遍性第88-89页
   ·拟南芥内含子 miRNA 分析第89-91页
   ·拟南芥受可变剪切调控 miRNA 筛选第91-92页
   ·玉米气生根发育相关 miRNA 的分离与鉴定第92-95页
4 讨论第95-99页
5 结论第99-101页
参考文献第101-110页
致谢第110-111页
攻读学位期间发表论文情况第111页

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