| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 流感与生物复杂网络研究进展 | 第11-22页 |
| ·甲型流感病毒的研究进展 | 第11-14页 |
| ·miRNA 研究进展 | 第14-16页 |
| ·生物复杂网络研究进展 | 第16-20页 |
| ·生物芯片技术 | 第17-18页 |
| ·miRNA 靶标预测 | 第18-19页 |
| ·网络聚类算法 | 第19-20页 |
| ·蛋白质互作数据库 | 第20页 |
| ·研究目的和意义 | 第20-22页 |
| 第二章 甲型 H1N1 流感病毒感染分子机制的系统生物学整合分析 | 第22-49页 |
| ·材料与方法 | 第22-28页 |
| ·miRNA 微阵列表达谱型 | 第22页 |
| ·mRNA 微阵列表达谱型 | 第22-23页 |
| ·功能富集分析 | 第23-24页 |
| ·miRNA 靶标预测 | 第24-25页 |
| ·蛋白质-蛋白质相互作用 | 第25页 |
| ·差异表达基因网络的拓扑属性 | 第25-26页 |
| ·网络聚类的建立 | 第26页 |
| ·识别 miRNA-miRNA 对以及构建 miRNAs 功能协同网络 | 第26-28页 |
| ·实验结果 | 第28-45页 |
| ·miRNA 芯片表达谱型 | 第28-29页 |
| ·mRNA 芯片表达谱型 | 第29-30页 |
| ·差异表达基因的注释分析 | 第30-34页 |
| ·miRNA 靶标预测 | 第34页 |
| ·miRNA 靶标功能分析 | 第34页 |
| ·差异表达基因的蛋白质互作网络 | 第34-38页 |
| ·网络聚类 | 第38-41页 |
| ·转录因子预测 | 第41-42页 |
| ·miRNA-miRNA 功能协同网络 | 第42-43页 |
| ·预测病毒基因组上宿主 miRNA 靶定位点 | 第43-44页 |
| ·综合网络 | 第44-45页 |
| ·讨论 | 第45-49页 |
| 总结 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-56页 |
| 附录 | 第56-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 作者简介 | 第61页 |