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PRRSV不同毒株感染MARC-145细胞的蛋白质组学分析及ZCYZ株感染性克隆的拯救

中文摘要第1-13页
Abstract第13-15页
1 引言第15-34页
   ·猪繁殖与呼吸综合征概述第15-26页
     ·病原学第16-22页
       ·PRRSV 的分类地位及生物学特性第16-17页
       ·PRRSV 的基因组结构第17-19页
       ·PRRSV 基因组编码的主要蛋白第19-22页
         ·PRRSV 基因组编码的非结构蛋白第19-20页
         ·PRRSV 基因组编码的结构蛋白第20-22页
     ·PRRSV 致病机制与免疫学第22-24页
       ·PRRSV 的致病机制第22-23页
       ·PRRSV 的免疫学第23-24页
     ·PRRSV 的流行病学第24页
     ·PRRSV 的实验室诊断技术第24-26页
       ·PRRSV 的抗原学诊断技术第24-25页
         ·病毒分离第24页
         ·RT-PCR 技术第24-25页
         ·免疫胶体金技术第25页
       ·PRRSV 的血清学诊断技术第25-26页
         ·间接免疫荧光试验(IFA)第25页
         ·免疫过氧化物酶单层试验第25页
         ·酶联免疫吸附试验第25-26页
   ·猪繁殖与呼吸综合征的蛋白质组学研究进展第26-31页
     ·蛋白质组学概述第26页
     ·蛋白质组学研究常用技术第26-30页
       ·双向电泳第26页
       ·双向差异凝胶电泳第26-27页
       ·iTRAQ 技术第27-29页
       ·基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱第29页
       ·高效液相色谱第29-30页
     ·蛋白质组学应用于 PRRSV 的研究第30-31页
   ·猪繁殖与呼吸综合征的感染性 cDNA 克隆研究进展第31-33页
     ·反向遗传学操作技术体系的提出第31页
     ·正链 RNA 病毒的感染性 cDNA 克隆构建的原理和方法第31-32页
     ·PRRSV 感染性 cDNA 克隆的研究进展第32页
     ·PRRSV 感染性 cDNA 克隆的应用第32-33页
   ·本研究的目的和意义第33-34页
2 材料与方法第34-56页
   ·实验材料第34-36页
     ·细胞、毒株和抗体第34页
     ·实验动物第34页
     ·主要试剂与药品第34页
     ·菌种和载体第34-35页
     ·主要试剂配制第35-36页
     ·主要设备及仪器第36页
   ·实验方法第36-56页
     ·病毒 TCID50测定第36页
     ·攻毒实验第36-37页
     ·体温的测量第37页
     ·血清抗体水平的检测第37页
     ·组织器官病理变化及病理学切片观察第37-38页
     ·病毒接种与收获细胞第38页
     ·间接免疫荧光实验(IFA)第38-39页
     ·蛋白样品处理第39-46页
       ·细胞收集第39页
       ·样品裂解与蛋白浓度测定第39-40页
       ·SDS-PAGE检测样品的制备第40页
       ·SDS-PAGE蛋白质电泳(参照分子克隆实验指南操作)(萨姆布鲁克,2002)第40-41页
       ·蛋白酶解第41页
       ·iTRAQ 标记第41页
       ·强离子交换分离第41页
       ·高效液相色谱-电喷雾串联质谱法分析和数据库检索第41-42页
       ·GO 分析第42页
       ·COG 注释第42页
       ·显著性Pathway分析第42-43页
       ·蛋白信号转导网络的构建第43-45页
       ·免疫印迹第45-46页
     ·引物设计及合成第46-48页
     ·RNA 提取及 RT-PCR第48-50页
     ·PRRSV 中间载体的构建第50-52页
       ·转化第50-51页
       ·阳性重组子的鉴定和测序(PCR 方法鉴定阳性重组子)第51页
       ·阳性重组子的鉴定和测序(质粒酶切鉴定阳性重组子)第51-52页
     ·PRRSV 基因组 B 片段 XhoI 位点的突变第52-54页
     ·全长 cDNA 克隆的构建第54页
     ·PRRSV ZCYZ 相关毒株序列的进化树分析第54-55页
     ·体外转染第55页
     ·PRRSV ZCYZ 株感染性克隆的鉴定第55页
     ·动物实验第55-56页
3 结果与分析第56-74页
   ·体温测定第56页
   ·攻毒后 PRRSV 抗体检测结果第56页
   ·攻毒后猪的病理解剖结果与组织学变化第56-59页
   ·PRRSV 分离株感染 MARC-145 细胞的 IFA第59-60页
   ·SDS-PAGE 蛋白质电泳结果第60页
   ·数据分析结果第60页
   ·GO 分析结果第60-61页
   ·COG 注释结果第61-62页
   ·显著性 Pathway 分析结果第62-65页
     ·SX-1 vs MARC-145 组差异蛋白显著性 Pathway第62-63页
     ·SD1 vs MARC-145 组差异蛋白显著性 Pathway第63-64页
     ·ZCYZ vs MARC-145 组差异蛋白显著性 Pathway第64-65页
     ·不同组别之间上调差异蛋白和下调差异蛋白参与的显著性 Pathway 统计第65页
   ·蛋白信号转导网络的构建第65-69页
     ·SX-1 vs MARC-145 组 Signal-Net第67-68页
     ·SD1 vs MARC-145 组 Signal-Net第68页
     ·ZCYZ vs MARC-145 组 Signal-Net第68-69页
   ·Western Blot 结果第69-70页
   ·ZCYZ 全基因组各段扩增结果第70页
   ·PRRSV ZCYZ 相关毒株序列和进化树分析结果第70-71页
   ·PRRSV 感染性 cDNA 克隆的拯救结果第71-73页
   ·动物实验结果第73-74页
4 讨论第74-78页
   ·SX-1 vs MARC-145 组第74-76页
   ·SD1 vs MARC-145 组第76页
   ·ZCYZ vs MARC-145 组第76页
   ·不同组别之间参与 Pathway 的比较第76页
   ·ZCYZ 感染性克隆的构建及拯救第76-78页
5 结论第78-79页
参考文献第79-86页
附录第86-120页
致谢第120-121页
攻读学位期间发表论文情况第121页

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