| 中文摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 动物线粒体基因组概述及鹿科动物的系统演化研究现状 | 第11-23页 |
| ·动物线粒体基因组的基本特征 | 第11-15页 |
| ·动物线粒体基因组的大小 | 第11页 |
| ·动物线粒体基因组的基因组成 | 第11-12页 |
| ·动物线粒体基因组的蛋白编码基因的特点 | 第12页 |
| ·蛋白编码基因密码子的特点 | 第12-13页 |
| ·tRNA基因 | 第13-14页 |
| ·rRNA基因 | 第14页 |
| ·非编码区 | 第14-15页 |
| ·线粒体DNA在分子系统学上的应用 | 第15页 |
| ·分子系统进化树的构建方法 | 第15-19页 |
| ·距离法(distance method) | 第15-18页 |
| ·最大简约法(maximum parsimonious,MP) | 第18页 |
| ·最大似然法(maximum likehood,ML) | 第18-19页 |
| ·贝叶斯法(Bayesian Inference,BI) | 第19页 |
| ·动物线粒体基因组全序列测定方法 | 第19页 |
| ·鹿科动物的系统演化研究现状 | 第19-20页 |
| ·鹿科动物在中国的分布 | 第20-21页 |
| ·本研究的意义 | 第21-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-30页 |
| ·材料 | 第23-30页 |
| ·样本的采集 | 第23页 |
| ·主要仪器 | 第23页 |
| ·主要试剂及溶液配制 | 第23-25页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第25-26页 |
| ·引物设计和PCR扩增 | 第26页 |
| ·PCR产物回收纯化、克隆和测序 | 第26-27页 |
| ·测序结果的拼接和分析 | 第27-28页 |
| ·分子进化树的构建 | 第28-30页 |
| 第三章 实验结果 | 第30-31页 |
| ·实验结果 | 第30-31页 |
| 第四章 海南坡鹿线粒体的结构及各基因分析 | 第31-43页 |
| ·基因组的基本结构特征及碱基组成 | 第31-33页 |
| ·蛋白编码基因 | 第33-34页 |
| ·密码子使用分析 | 第34-38页 |
| ·适应性进化分析 | 第38-39页 |
| ·rRNA和tRNA | 第39-40页 |
| ·非编码区 | 第40-43页 |
| 第五章 系统演化分析结果 | 第43-46页 |
| ·分子进化树 | 第43-46页 |
| 第六章 讨论 | 第46-50页 |
| ·线粒体基因组的结构 | 第46页 |
| ·蛋白编码基因的比较 | 第46-47页 |
| ·rRNA的结构分析 | 第47页 |
| ·分子系统演化分析 | 第47-49页 |
| ·小结 | 第49-50页 |
| 附录 | 第50-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第63-64页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第64页 |
