| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-21页 |
| ·生物信息学概述 | 第11-14页 |
| ·生物信息学的产生 | 第11-12页 |
| ·生物信息学的发展现状 | 第12-14页 |
| ·生物信息可视化技术 | 第14-18页 |
| ·可视化技术概述 | 第14-17页 |
| ·生物信息可视化技术发展现状 | 第17-18页 |
| ·本论文研究意义和研究内容 | 第18-21页 |
| ·论文研究意义 | 第18页 |
| ·论文研究内容 | 第18-21页 |
| 第二章 生物信息可视化理论基础 | 第21-29页 |
| ·DNA 序列概述 | 第21-22页 |
| ·DNA 序列组成 | 第21-22页 |
| ·DNA 序列可视化 | 第22页 |
| ·DNA 序列Z 曲线理论 | 第22-27页 |
| ·Z 变换 | 第23-24页 |
| ·基于包围盒的抽稀算法的设计与实现 | 第24-26页 |
| ·图形元素的选择 | 第26页 |
| ·拟合函数的选择 | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-29页 |
| 第三章 基于C/S 模式病毒基因组生物信息可视化系统的架构 | 第29-37页 |
| ·通用系统需求分析 | 第29-30页 |
| ·生物信息可视化系统工作流程 | 第30页 |
| ·系统总体框架模型 | 第30-33页 |
| ·C/S 模式介绍 | 第31页 |
| ·C/S 体系结构 | 第31-32页 |
| ·三层C/S 体系结构 | 第32-33页 |
| ·模型说明 | 第33-35页 |
| ·表示层（presentation layer） | 第33-34页 |
| ·应用层（application layer） | 第34页 |
| ·数据处理层（data process layer） | 第34-35页 |
| ·模型优点 | 第35-36页 |
| ·本章小结 | 第36-37页 |
| 第四章 NDV 生物信息可视化系统的设计与实现 | 第37-55页 |
| ·统一建模语言（UML） | 第37-38页 |
| ·系统分析 | 第38-45页 |
| ·系统需求提出 | 第38-39页 |
| ·可行性分析 | 第39-40页 |
| ·UML 用例建模 | 第40-45页 |
| ·系统设计 | 第45-48页 |
| ·系统设计的基本原则 | 第45-46页 |
| ·系统设计的目标 | 第46页 |
| ·系统总体结构设计 | 第46-48页 |
| ·系统基本功能 | 第48-51页 |
| ·数据管理 | 第48-49页 |
| ·序列处理 | 第49-50页 |
| ·曲线编辑 | 第50-51页 |
| ·Z 曲线图显示分析 | 第51页 |
| ·系统开发工作流程 | 第51-52页 |
| ·系统实现 | 第52-53页 |
| ·软硬件环境 | 第52页 |
| ·实现类图 | 第52-53页 |
| ·本章小结 | 第53-55页 |
| 第五章 NDV 生物信息可视化系统的应用 | 第55-71页 |
| ·系统主要界面 | 第55-56页 |
| ·NDV 生物信息数据库的建立 | 第56-57页 |
| ·DNA 序列文件的收集 | 第56页 |
| ·NDV 生物信息数据库的建立 | 第56页 |
| ·数据的查询与检索 | 第56-57页 |
| ·数据的更新与维护 | 第57页 |
| ·NDV 序列文件三维显示 | 第57-62页 |
| ·NDV 序列文件转换 | 第58-59页 |
| ·NDV 序列空间数据点抽稀 | 第59-60页 |
| ·NDV 序列Z 曲线图旋转 | 第60-61页 |
| ·NDV 序列Z 曲线图缩放 | 第61-62页 |
| ·NDV 序列文件可视化分析 | 第62-70页 |
| ·抽稀算法应用效果分析 | 第62-63页 |
| ·NDV 全基因组序列可视化分析 | 第63-64页 |
| ·NDV 不同基因序列可视化分析 | 第64-69页 |
| ·不同病毒属的全基因组序列可视化分析 | 第69-70页 |
| ·本章小结 | 第70-71页 |
| 第六章 总结与展望 | 第71-73页 |
| ·本文工作总结 | 第71-72页 |
| ·本文工作展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 攻读学位期间发表学术论文目录 | 第79页 |
| 攻读学位期间参与科研项目 | 第79-80页 |