| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 1 前言 | 第8-11页 |
| ·土壤微生物的多样性 | 第8页 |
| ·土壤微生物总DNA 提取的意义 | 第8-9页 |
| ·土壤微生物总DNA 提取方法 | 第9页 |
| ·红树林土壤微生物多样性 | 第9页 |
| ·聚酮化合物筛选新途径 | 第9-10页 |
| ·研究目的意义 | 第10-11页 |
| 2 材料与方法 | 第11-21页 |
| ·样品的采集和保存 | 第11页 |
| ·土壤样品理化性质及养分含量的测定 | 第11-12页 |
| ·土壤样品含水量的测定 | 第11页 |
| ·土壤样品盐度测定 | 第11页 |
| ·土壤样品pH 值测定 | 第11-12页 |
| ·实验材料和实验设备 | 第12-13页 |
| ·主要试剂 | 第12页 |
| ·仪器设备 | 第12-13页 |
| ·土壤样品总DNA 提取 | 第13-18页 |
| ·直接提取法 | 第13-16页 |
| ·土壤样品预处理 | 第13页 |
| ·方法1：液氮－SDS－溶菌酶法 | 第13-14页 |
| ·方法2：玻璃珠－SDS－溶菌酶法 | 第14页 |
| ·方法3：SDS―GITC―PEG 法 | 第14-15页 |
| ·方法4：Bio 101 Kit 法 | 第15-16页 |
| ·方法5：SDS―GITC―FastPrep－PEG 法 | 第16页 |
| ·间接提取法 | 第16-18页 |
| ·方法6：Nycodenz 法 | 第16-17页 |
| ·方法7：Blending 法 | 第17页 |
| ·方法8：细胞包埋法 | 第17-18页 |
| ·DNA 的定量和纯度检测 | 第18页 |
| ·土壤DNA 的提取效率 | 第18页 |
| ·16S rDNA 扩增 | 第18-19页 |
| ·PCR 扩增所用引物 | 第18页 |
| ·PCR 扩增反应体系及反应条件 | 第18-19页 |
| ·红树林土壤Ⅰ型聚酮合酶基因探测 | 第19-21页 |
| ·PCR 扩增引物 | 第19页 |
| ·Ⅰ型聚酮合酶基因扩增条件条件优化 | 第19-20页 |
| ·引物退火温度梯度实验 | 第20页 |
| ·红树林土壤DNA 的I 型聚酮合成酶PCR 扩增 | 第20-21页 |
| 3 结果与讨论 | 第21-44页 |
| ·红树林土壤样品理化性质测定结果 | 第21页 |
| ·红树林土壤样品总DNA 的提取方法评估 | 第21-38页 |
| ·不同方法提取红树林土壤总DNA 的电泳检测结果 | 第21-28页 |
| ·方法1：液氮－SDS－溶菌酶法 | 第21-22页 |
| ·方法2：玻璃珠－SDS－溶菌酶法 | 第22-23页 |
| ·方法3：SDS―GITC―PEG 法 | 第23-24页 |
| ·方法4：Bio 101 Kit 法 | 第24-25页 |
| ·方法5：SDS―GITC―FastPrep－PEG 法 | 第25-26页 |
| ·方法6：Nycodenz 法 | 第26-27页 |
| ·方法7：Blending 法 | 第27页 |
| ·方法8：细胞包埋法 | 第27-28页 |
| ·不同提取方法提取出的红树林土壤DNA 纯度测定 | 第28-34页 |
| ·Biophoto meter 核酸蛋白测定仪测定红树林土壤DNA 纯度 | 第28-30页 |
| ·PCR 扩增检测土壤DNA 纯度 | 第30-34页 |
| ·不同提取方法土壤DNA 的提取效率 | 第34-37页 |
| ·不同提取方法土壤DNA 的提取得率 | 第34-35页 |
| ·不同提取方法土壤DNA 的提取效率 | 第35-37页 |
| ·提取方法重复性评价 | 第37页 |
| ·小结 | 第37-38页 |
| ·红树林土壤Ⅰ型聚酮合酶基因探测 | 第38-41页 |
| ·Ⅰ型聚酮合酶基因PCR 扩增条件优化 | 第38-40页 |
| ·引物KSLF/ KSLR 最适退火温度确定 | 第39页 |
| ·Taq 酶和Mg~(2＋)浓度条件的摸索 | 第39-40页 |
| ·红树林土壤DNA 的PKS-Ⅰ基因扩增 | 第40-41页 |
| ·红树林土壤DNA 的PKS-Ⅰ基因片断的二次PCR 扩增 | 第40-41页 |
| ·5 种红树林土壤DNA 的PKS Ⅰ基因的PCR 扩增 | 第41页 |
| ·讨论 | 第41-44页 |
| 4 结论 | 第44-45页 |
| 5 文献综述 | 第45-62页 |
| ·土壤DNA 提取和纯化方法研究进展 | 第45-55页 |
| ·引言 | 第45页 |
| ·土壤微生物DNA 的提取 | 第45-50页 |
| ·间接提取 | 第45-47页 |
| ·直接提取法 | 第47-49页 |
| ·物理破碎 | 第47-48页 |
| ·非物理破碎法 | 第48-49页 |
| ·细胞碎片的去除以及核酸沉淀 | 第49-50页 |
| ·DNA 的纯化 | 第50-52页 |
| ·氯化铯密度梯度超速离心法 | 第50页 |
| ·色谱法 | 第50-51页 |
| ·电泳法 | 第51页 |
| ·透析和过滤法 | 第51-52页 |
| ·商品试剂盒 | 第52页 |
| ·提取质量的评价 | 第52-53页 |
| ·小结 | 第53-55页 |
| ·宏基因组文库技术获得聚酮化合物 | 第55-62页 |
| ·聚酮化合物的生物合成 | 第56-58页 |
| ·环境中聚酮合成相关基因的获得 | 第58页 |
| ·聚酮化合物基因的异源表达 | 第58-60页 |
| ·宏基因组文库的筛选 | 第60-61页 |
| ·问题及展望 | 第61-62页 |
| 6 参考文献 | 第62-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 详细摘要 | 第74-80页 |
