| 摘要 | 第1-14页 |
| ABSTRACT | 第14-17页 |
| 符号与缩略语 | 第17-18页 |
| 第一章 除草剂阿特垃津生物降解研究进展 | 第18-39页 |
| 1 概述 | 第18-20页 |
| 1．1 理化性质 | 第18页 |
| 1．2 毒性 | 第18-19页 |
| 1．3 应用范围 | 第19页 |
| 1．4 不同作物对阿特拉津的抗性 | 第19页 |
| 1．5 阿特拉津对作物的药害及分析 | 第19页 |
| 1．6 有关阿特拉津的一些标准 | 第19-20页 |
| 2 阿特拉津的微生物降解 | 第20-32页 |
| 2．1 简单的s-三嗪化合物的微生物代谢 | 第20页 |
| 2．2 阿特拉津的微生物代谢 | 第20-32页 |
| 参考文献 | 第32-39页 |
| 第二章 研究中所涉及的主要研究方法概述 | 第39-58页 |
| 1 常见鉴定分类方法概述 | 第39-45页 |
| 1．1 概述 | 第39-40页 |
| 1．2 表型多样性研究 | 第40-42页 |
| 1．3 遗传多样性研究 | 第42-45页 |
| 2 降解基因的克隆方法概述 | 第45-53页 |
| 2．1 根据已知序列克隆基因 | 第45-47页 |
| 2．2 新基因的克隆方法 | 第47-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 第三章 阿特拉津降解菌的富集、分离及鉴定 | 第58-81页 |
| 第一节 阿特拉津降解菌的富集和分离 | 第59-68页 |
| 1 材料与方法 | 第59-63页 |
| 1．1 培养基和仪器 | 第59页 |
| 1．2 土壤样品的富集 | 第59-60页 |
| 1．3 阿特拉津降解菌的分离 | 第60页 |
| 1．4 阿特拉津浓度的检测 | 第60页 |
| 1．5 BTAH1碳源、氮源和微生物利用 | 第60-61页 |
| 1．6 蛋白胨、酵母粉和NaCl浓度对BTAH1生长的影响 | 第61页 |
| 1．7 BTAH1在基础盐培养基和1／10LB培养基中生长曲线的测定 | 第61页 |
| 1．8 BTAH1最适生长条件的测定 | 第61页 |
| 1．9 BTAH1的生理尘化鉴定 | 第61-62页 |
| 1．10 BTAH1的16S rDNA序列的测定 | 第62-63页 |
| 2 结果与分析 | 第63-67页 |
| 2．1 阿特拉津降解菌的分离及其对阿特拉津的降解情况 | 第63页 |
| 2．2 菌株BTAH1对维生素、碳源和氮源的利用情况及蛋白胨浓度对BTAH1生长的影响 | 第63-64页 |
| 2．3 BTAH1在基础盐培养基和1／10 LB培养基中的生长曲线 | 第64-65页 |
| 2．4 温度、通气量和pH值对BTAH1生长的影响 | 第65-66页 |
| 2．5 BTAH1的生理生化鉴定 | 第66页 |
| 2．6 BTAH1基因组DNA的提取和16S rDNA的扩增 | 第66-67页 |
| 2．7 菌株BTAH1 16S rDNA序列的聚类分析 | 第67页 |
| 3 讨论 | 第67-68页 |
| 第二节 阿特拉津降解菌株BTAH1的鉴定 | 第68-77页 |
| 1 材料与方法 | 第68-72页 |
| 1．1 培养基 | 第68页 |
| 1．2 菌株 | 第68页 |
| 1．3 模式菌株的活化 | 第68-69页 |
| 1．4 碳源发酵实验 | 第69页 |
| 1．5 16S rDNA同源性分析 | 第69页 |
| 1．6 菌体的培养、收集及DNA的大量提取 | 第69页 |
| 1．7 用于DNA-DNA液相杂交的DNA浓度、纯度检查 | 第69-70页 |
| 1．8 Tm值及G+C mol％测定 | 第70-71页 |
| 1．9 DNA-DNA杂交 | 第71-72页 |
| 2 结果与分析 | 第72-76页 |
| 2．1 BTAH1与四个模式菌株在形态学上的比较 | 第72-73页 |
| 2．2 BTAH1与四个模式菌株在碳源发酵产酸上的比较 | 第73-74页 |
| 2．3 五个菌株16S rDNA同源性的比较 | 第74-75页 |
| 2．4 菌株BTAH1的Tm值和G+C％含量及DNA-DNA液相杂交温度的确定 | 第75页 |
| 2．5 DNA-DNA液相杂交复性速率及DNA-DNA同源性 | 第75-76页 |
| 3 讨论 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-81页 |
| 第四章 菌株BTAH1对阿特拉津的降解特性与降解基因的研究 | 第81-113页 |
| 第一节 菌株BTAH1对阿特拉津降解特性的研究 | 第82-91页 |
| 1 材料与方法 | 第82-84页 |
| 1．1 培养基和药品 | 第82页 |
| 1．2 菌株BTAH1对阿特拉津的利用 | 第82-83页 |
| 1．3 培养基氮浓度及pH值测定 | 第83页 |
| 1．4 温度和pH对菌株BTAH1降解阿特拉津的影响 | 第83页 |
| 1．5 菌株BTAH1对阿特拉津的脱氯作用 | 第83页 |
| 1．6 菌株BTAH1降解中间产物的检测 | 第83-84页 |
| 1．7 菌株BTAH1降解谱的测定 | 第84页 |
| 2．结果与分析 | 第84-90页 |
| 2．1 菌株BTAH1对阿特拉津的利用 | 第84页 |
| 2．2 菌株BTAH1降解后培养基的氨浓度和pH值 | 第84-85页 |
| 2．3 温度和pH值对阿特拉津降解的影响 | 第85-86页 |
| 2．4 BTAH1对阿特拉津的脱氯作用 | 第86-87页 |
| 2．5 降解过程中羟基阿特拉津的检测 | 第87-89页 |
| 2．6 降解过程中氰尿酸的检测 | 第89页 |
| 2．7 BTAH1的降解谱 | 第89-90页 |
| 3 讨论 | 第90-91页 |
| 第二节 菌株BTAH1阿特拉津降解基因保守性的研究及降解基因的定位 | 第91-99页 |
| 1 材料与方法 | 第91-94页 |
| 1．1 培养基和试剂 | 第91页 |
| 1．2 菌株 | 第91页 |
| 1．3 基因组DNA的小量提取 | 第91页 |
| 1．4 阿特拉津降解基因保守片段的扩增 | 第91-92页 |
| 1．5 质粒DNA的小量提取 | 第92页 |
| 1．6 质粒DNA的小量酶切 | 第92页 |
| 1．7 BTAH1的阿特拉津降解基因的Southern杂交定位 | 第92-94页 |
| 2．结果与分析 | 第94-97页 |
| 2．1 阿特拉津降解基因保守片段的扩增 | 第94页 |
| 2．2 阿特拉津降解基因保守性的分析 | 第94-95页 |
| 2．3 菌株BTAH1中质粒的检测 | 第95-96页 |
| 2．4 菌株BTAH1中质粒的纯化和酶切比较 | 第96-97页 |
| 2．5 菌株BTAH1阿特拉津降解基因的定位 | 第97页 |
| 3 讨论 | 第97-99页 |
| 第三节 BTAH1质粒上阿特拉津降解相关片段的克隆 | 第99-110页 |
| 1．材料与方法 | 第99-103页 |
| 1．1 培养基和试剂 | 第99页 |
| 1．2 菌株与质粒 | 第99页 |
| 1．3 质粒DNA的提取和酶切 | 第99-100页 |
| 1．4 质粒DNA酶切产物的Southern杂交检测 | 第100页 |
| 1．5 质粒DNA酶切片段的回收 | 第100页 |
| 1．6 脱磷载体的制备 | 第100-101页 |
| 1．7 酶连 | 第101页 |
| 1．8 高效感受态细胞的制备和转化 | 第101页 |
| 1．9 阳性克隆的杂交法筛选 | 第101-103页 |
| 1．10 阳性克隆测序和序列分析 | 第103页 |
| 2 结果与分析 | 第103-109页 |
| 2．1 质粒DNA的酶切分析 | 第103页 |
| 2．2 质粒DNA的酶切产物的Southern杂交 | 第103-104页 |
| 2．3 脱磷载体的制备和质粒DNA的酶切产物回收 | 第104-105页 |
| 2．4 阳性克隆的筛选和酶切验证 | 第105页 |
| 2．5 阳性克隆的PCR验证 | 第105-106页 |
| 2．6 pBT24序列分析 | 第106页 |
| 2．7 pBT24序列与pADP-1、pAA1相关序列的比较 | 第106-107页 |
| 2．8 atzB基因序列的比较 | 第107-108页 |
| 2．9 pBT2和pBT24序列的酶切位点验证 | 第108-109页 |
| 3 讨论 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-113页 |
| 第五章 BTAH1在土壤中对阿特拉津的降解 | 第113-128页 |
| 第一节 菌株BTAH1在土壤中对阿特拉津的降解 | 第114-118页 |
| 1 材料与方法 | 第114-115页 |
| 1．1 培养基 | 第114页 |
| 1．2 供试菌株和植物 | 第114页 |
| 1．3 供试土壤 | 第114页 |
| 1．4 降解菌浓度和施用时间对土壤中阿特拉津降解的影响 | 第114-115页 |
| 1．5 降解菌的施用对敏感作物(小麦)生长的影响 | 第115页 |
| 2 结果与分析 | 第115-117页 |
| 2．1 降解菌BTAH1的使用浓度和施用时间对土壤中阿特拉津降解的影响 | 第115-116页 |
| 2．2 降解菌的修复作用对小麦长势的影响 | 第116-117页 |
| 2．3 降解菌的修复作用对小麦鲜重的影响 | 第117页 |
| 3 讨论 | 第117-118页 |
| 第二节 BTAH1的使用对土壤微生物群落结构的影响 | 第118-126页 |
| 1 材料与方法 | 第118-120页 |
| 1．1 供试土壤 | 第118页 |
| 1．2 供试菌株 | 第118-119页 |
| 1．3 除草剂阿特拉津和降解菌的施用 | 第119页 |
| 1．4 测定方法 | 第119页 |
| 1．5 土壤16S rDNA文库的建立及ARDRA分析 | 第119页 |
| 1．6 土壤细菌遗传多样性的统计分析 | 第119-120页 |
| 2 结果与分析 | 第120-125页 |
| 2．1 土壤中阿特拉津的降解情况 | 第120页 |
| 2．2 阿特拉津和降解菌的使用对呼吸强度、土壤微生物C和微生物N的影响 | 第120-121页 |
| 2．3 除草剂和降解菌的使用对土壤中主要微生物类群的数量的影响 | 第121-122页 |
| 2．4 四种土壤总DNA的提取、纯化和16S rDNA的扩增 | 第122-123页 |
| 2．5 四种土壤16S rDNA文库的RFLP分析 | 第123-124页 |
| 2．6 阿特拉津及降解菌的使用对土壤微生物多样性的影响 | 第124页 |
| 2．7 四种土壤酶切类型的两两比较及主要酶切类型克隆数的比较 | 第124-125页 |
| 3 讨论 | 第125-126页 |
| 参考文献 | 第126-128页 |
| 全文总结 | 第128-129页 |
| 附录一 文中所用试剂与培养基配方 | 第129-132页 |
| 附录二 相关DNA序列 | 第132-138页 |
| 致射 | 第138-139页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第139页 |
