| 中文摘要 | 第1-13页 |
| 英文摘要 | 第13-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-30页 |
| ·变形菌视紫质的研究进展 | 第15-21页 |
| ·变形菌视紫质与视紫质超家族 | 第15-17页 |
| ·变形菌视紫质的功能 | 第17-19页 |
| ·变形菌视紫质在全球海洋的分布及生态意义 | 第19-20页 |
| ·变形菌视紫质的光谱多样性及与环境的关系 | 第20-21页 |
| ·含有变形菌视紫质的可培养细菌 | 第21页 |
| ·拟杆菌门概况 | 第21-24页 |
| ·拟杆菌门的主要特征 | 第21-22页 |
| ·拟杆菌门对有机物质的利用 | 第22-23页 |
| ·拟杆菌门在海洋中的分布 | 第23页 |
| ·黄杆菌类群 | 第23-24页 |
| ·海洋微生物生态学研究的相关分子生物学技术 | 第24-29页 |
| ·环境基因组学技术 | 第24-25页 |
| ·分子系统发育分析 | 第25-26页 |
| ·实时荧光定量PCR技术 | 第26-29页 |
| ·本论文的研究思路，内容和意义 | 第29-30页 |
| 第二章 材料与方法 | 第30-39页 |
| ·材料 | 第30-34页 |
| ·方法 | 第34-39页 |
| 第三章 变形菌视紫质基因在全球海洋的多样性分布 | 第39-45页 |
| ·变形菌视紫质基因引物的设计 | 第39-40页 |
| ·克隆文库的组成和系统发育分析 | 第40-43页 |
| ·变形菌视紫质基因在不同海域的多样性及与环境的关系 | 第43页 |
| ·小结与讨论 | 第43-45页 |
| 第四章 拟杆菌类群的视紫质基因在中国典型海域的生态分布特征 | 第45-61页 |
| ·特异性引物的设计 | 第45-46页 |
| ·中国典型海域采样区的环境概况 | 第46-48页 |
| ·东海及长江口的环境概况 | 第46-47页 |
| ·南海及珠江口的环境概况 | 第47-48页 |
| ·拟杆菌类群的视紫质基因在中国典型海域的克隆文库组成与系统发育分析 | 第48-53页 |
| ·克隆文库的比较及海区环境因子对基因多样性的影响分析 | 第53-57页 |
| ·东海与南海克隆文库的比较 | 第53页 |
| ·近岸与外海表层水克隆文库的比较 | 第53-55页 |
| ·不同水层克隆文库的比较 | 第55-56页 |
| ·不同粒级克隆文库的比较 | 第56-57页 |
| ·温度对拟杆菌类群的视紫质基因多样性的影响分析 | 第57-59页 |
| ·小节和讨论 | 第59-61页 |
| 第五章 拟杆菌类群的视紫质基因在中国典型海域的丰度估计 | 第61-71页 |
| ·丰度调查方法的选择 | 第61页 |
| ·实时荧光定量 PCR的结果分析 | 第61-66页 |
| ·标准曲线的构建和qPCR的灵敏性 | 第61-62页 |
| ·qPCR扩增的特异性及熔解曲线分析 | 第62-64页 |
| ·拟杆菌类群的视紫质基因在中国典型海域的丰度估计 | 第64-66页 |
| ·不同环境样品中拟杆菌类群的视紫质基因丰度的比较 | 第66-69页 |
| ·近岸与外海表层水数量的比较 | 第66-67页 |
| ·不同深度数量的比较 | 第67-68页 |
| ·不同粒级数量的比较 | 第68-69页 |
| ·小节与讨论 | 第69-71页 |
| 第六章 结论与展望 | 第71-73页 |
| ·结论 | 第71页 |
| ·创新点 | 第71-72页 |
| ·展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-81页 |
| 硕士期间完成论文情况 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
