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稻瘟病菌一个无毒基因簇的定位

摘要第1-10页
Abstract第10-11页
1 前言第11-22页
   ·稻瘟病菌基因组学的研究第11-15页
     ·稻瘟病菌分子标记的发展与利用第11-12页
     ·稻瘟病菌遗传图谱、物理图谱的构建第12-13页
     ·稻瘟病菌大片段基因组文库的构建第13-14页
     ·稻瘟病菌的全基因组测序第14-15页
   ·稻瘟病菌无毒基因的研究进展第15-22页
     ·稻瘟病菌无毒基因的遗传分析第15-18页
     ·稻瘟病菌无毒基因的克隆第18-20页
     ·稻瘟病菌无毒基因研究的意义第20-22页
2 材料与方法第22-36页
   ·供试菌株第22页
   ·供试植物第22页
   ·稻瘟病菌毒性/无毒性测定第22-23页
     ·分生孢子扩大培养第22页
     ·育苗和接种方法第22页
     ·调查和记载第22-23页
   ·BAC 亚克隆第23-26页
     ·供试菌株第23页
     ·亚克隆载体第23页
     ·BAC 亚克隆第23-26页
       ·小量制备质粒DNA第23页
       ·小量制备BAC DNA第23-24页
       ·质粒 DNA 酶切第24页
       ·pBluescript SK/SK(-)酶切产物的去磷酸化处理第24-25页
       ·去磷酸化后的pBluescript SK第25页
       ·大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备第25页
       ·连接产物的转化第25-26页
   ·SSR 方法第26-27页
     ·稻瘟病菌基因组DNA 的提取第26页
     ·稻瘟病菌SSR 引物第26页
     ·SSR 引物的筛选第26-27页
     ·PCR 扩增及检测第27页
   ·多态标记方法第27-28页
     ·多态标记引物第27页
     ·多态标记的筛选第27-28页
     ·多态标记的PCR 扩增及检测第28页
   ·遗传连锁图谱的构建第28页
   ·805L15 的序列分析第28-29页
     ·805L15 测序的Contig 拼接第28页
     ·基因预测第28页
     ·预测基因的功能预测第28-29页
   ·预测信号肽表达载体构建第29-32页
     ·酶切方法构建预测信号肽互补载体第29-31页
       ·质粒载体第29页
       ·预测信号肽的克隆第29页
       ·互补载体的构建第29-31页
     ·酵母同源重组方法构建预测信号肽过表达(OE)载体第31-32页
       ·载体及菌株第31-32页
       ·酵母同源重组第32页
   ·BAC 克隆子805L15 的Cosmid 文库构建第32-35页
     ·805L15 的酶切第32-33页
     ·大片段DNA 回收第33页
     ·回收片段和经酶切、去磷酸化载体的末端平滑化第33-34页
     ·连接载体第34页
     ·体外包装第34页
     ·重组子验证第34-35页
   ·稻瘟病菌的遗传转化第35-36页
     ·稻瘟病菌原生质体的制备第35页
     ·稻瘟病菌原生质体转化和转化子的验证第35-36页
3 结果与分析第36-63页
   ·BAC 亚克隆第36-40页
     ·BAC DNA 的酶切、与载体的连接、转化和亚克隆子的筛选第36-38页
     ·亚克隆子的测序及序列分析第38-40页
     ·根据亚克隆子序列开发标记第40页
   ·数据库序列的SSR 标记开发第40-43页
   ·805L15 的测序及序列分析第43-54页
     ·选择BAC 克隆子805L15 进行测序第43-44页
     ·多态性标记的筛选及PCR 扩增结果第44-48页
       ·标记L230 的PCR 扩增结果分析第44-45页
       ·标记L891-2 的PCR 扩增结果分析第45-46页
       ·标记L469-1 的PCR 扩增结果分析第46-47页
       ·标记L469-3 的PCR 扩增结果分析第47页
       ·标记L213-1 的PCR 扩增结果分析第47-48页
     ·BAC 805L15 序列的SSR 标记开发第48-49页
     ·805L15 序列Contig 的拼接第49-50页
     ·805L15 序列中基因的预测及基因的功能和细胞定位预测第50-54页
   ·81278 中的无毒基因簇与分子标记的遗传距离分析第54-57页
   ·预测信号肽表达载体的构建第57-58页
     ·酶切方法构建预测信号肽互补载体第57-58页
     ·酵母同源重组方法构建预测信号肽过表达载体第58页
   ·BAC 805L15 的Cosmid 文库构建及转化子验证第58-61页
     ·805L15 的Cosmid 文库构建第58-59页
     ·805L15 的Cosmid 转化子验证第59-61页
   ·稻瘟病菌的遗传转化第61-63页
     ·稻瘟病菌转化子的HygB 抗性筛选第61-62页
     ·转化子的致病性分析第62-63页
4 讨论第63-67页
   ·BAC 亚克隆序列分析第63页
   ·805L15 的测序及序列分析第63-64页
     ·多态标记的开发第63-64页
     ·805L15 序列中基因的预测及基因的功能和细胞定位预测第64页
   ·包含无毒基因簇与分子标记的遗传图谱的构建第64-65页
   ·BAC 克隆子805L15 的Cosmid 文库构建及转化子验证第65页
   ·稻瘟病菌的遗传转化第65-67页
参考文献第67-72页
附录第72-76页
致谢第76页

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