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骨调素和钙调素基因对京海黄鸡重要经济性状遗传效应的研究

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-13页
第一部分 文献综述第13-35页
 1 世界禽业生产现状第13-14页
 2 中国禽业生产现状第14-16页
 3 我国优质鸡的育种现状第16-17页
 4 分子标记在家禽育种中的研究现状第17-22页
   ·鸡基因组分子标记发展概况第18页
   ·影响鸡重要经济性状的主效基因和QTL第18-19页
   ·分子遗传标记在鸡育种中的应用第19-22页
     ·遗传标记辅助选择第19-21页
     ·检测与定位数量性状主基因第21-22页
 5 OPN第22-29页
   ·OPN分子结构第23-24页
   ·OPN基因结构第24页
   ·OPN基因表达调控第24-26页
   ·OPN生物学功能第26页
   ·OPN基因在畜禽生产上的研究现状第26-29页
     ·OPN与繁殖第26-28页
     ·OPN与蛋的形成第28-29页
 6 CAM第29-33页
   ·CAM分子结构第30-32页
   ·CAM表达与调控第32页
   ·CAM生理功能第32-33页
   ·CAM分子研究现状第33页
 7 京海黄鸡第33-34页
 8 本研究的目的和意义第34-35页
第二部分 材料和方法第35-48页
 1 材料第35-38页
   ·试验样本的收集第35-36页
   ·主要仪器和试剂第36-37页
   ·主要试剂的配置第37-38页
 2 实验方法第38-41页
   ·京海黄鸡屠宰性能测定第38-39页
   ·蛋壳质量性状测定第39-40页
   ·肉质测定第40页
   ·基因组 DNA 提取与检测第40-41页
   ·分析工具第41页
 3 PCR-SSCP 检测第41-46页
   ·引物设计第41-44页
   ·引物的合成与稀释第44页
   ·最佳 PCR 反应条件和反应体系的建立第44-45页
   ·扩增产物 SSCP 检测第45页
   ·产物测序第45-46页
 4 数据分析第46-48页
   ·等位基因频率和基因型频率第46页
   ·卡方适合性检验第46页
   ·遗传多态性分析第46页
   ·统计分析模型与软件第46-47页
   ·基因型对性状贡献率与基因主效应指数第47-48页
第三部分 结果和分析第48-132页
 1 基因组DNA 提取结果第48页
 2 京海黄鸡OPN 基因序列遗传效应分析第48-105页
   ·OPN 基因序列遗传多态性分析第48-63页
     ·OPN 基因不同引物的扩增结果第48-49页
     ·OPN 基因不同引物所分离基因片段的序列分析与鉴定第49-50页
     ·京海黄鸡OPN 基因PCR-SSCP 多态性检测结果与遗传学分析第50-57页
     ·京海黄鸡OPN 基因氨基酸序列分析第57-62页
     ·京海黄鸡OPN 基因群体遗传学分析第62-63页
   ·京海黄鸡OPN基因各种PCR-SSCP 变异与经济性状的关联分析第63-93页
     ·京海黄鸡OPN 基因OP2 座位不同基因型与经济性状的关联分析第63-66页
     ·京海黄鸡 OPN 基因 OP5 座位不同基因型与经济性状的关联分析第66-70页
     ·京海黄鸡 OPN 基因 OP6 座位不同基因型与经济性状的关联分析第70-76页
     ·京海黄鸡 OPN 基因 OP9 座位不同基因型与经济性状的关联分析第76-80页
     ·京海黄鸡OPN 基因OP12 座位不同基因型与经济性状的关联分析第80-88页
     ·京海黄鸡OPN 基因OP15 座位不同基因型与经济性状的关联分析第88-93页
   ·京海黄鸡OPN 基因6 个基因座不同基因型对经济性状的贡献率和主效应指数分析第93-105页
     ·京海黄鸡OPN 基因6 个基因座不同基因型对经济性状的贡献率第93-100页
     ·京海黄鸡OPN 基因不同基因座对经济性状的主效应指数分析第100-105页
 3 京海黄鸡CAM 基因序列遗传效应分析第105-126页
   ·CAM 基因序列遗传多态性分析第105-109页
     ·CAM 基因不同引物的扩增结果第105页
     ·CAM 基因不同引物所分离基因片段的序列分析与鉴定第105-106页
     ·京海黄鸡CAM 基因PCR-SSCP 多态性检测结果与遗传学分析第106-108页
     ·京海黄鸡 CAM 基因氨基酸序列分析第108页
     ·京海黄鸡 CAM 基因群体遗传学分析第108-109页
   ·京海黄鸡 CAM 基因各种PCR-SSCP 变异与经济性状的关联分析第109-118页
     ·京海黄鸡CAM 基因CA2 不同基因型与经济性状的关联分析第109-114页
     ·CAM 基因CA5 座位不同基因型与经济性状的关联分析第114-118页
   ·京海黄鸡 CAM 基因不同基因型对经济性状的贡献率和主效应指数分析第118-126页
     ·京海黄鸡CAM 基因不同基因型对经济性状的贡献率第118-123页
     ·京海黄鸡CAM 基因不同基因座对经济性状的主效应指数第123-126页
 4 京海黄鸡 OPN 基因和 CAM 基因对经济性状的互作效应第126-129页
   ·京海黄鸡 OPN 基因与CAM 基因对生长性状的互作效应第126页
   ·京海黄鸡 OPN 基因与CAM 基因对繁殖性状的互作效应第126-127页
   ·京海黄鸡 OPN 基因与CAM 基因对蛋壳质量性状的互作效应第127页
   ·京海黄鸡 OPN 基因与CAM 基因对屠宰性状和肉质的互作效应第127-129页
 5 京海黄鸡 OPN 基因和 CAM 基因组合对繁殖性状的效应分析第129-132页
   ·京海黄鸡 OP6 和 CA2 座位组合对繁殖性状的效应第129页
   ·京海黄鸡 OP9 和 CA2 座位组合对繁殖性状的效应第129-132页
第四部分 讨论第132-144页
 1 样本含量第132页
 2 京海黄鸡OPN 基因和CAM 基因多态性检测第132-134页
   ·京海黄鸡 OPN 基因多态性检测第132-133页
   ·京海黄鸡CAM 基因多态性检测第133-134页
 3 京海黄鸡OPN 基因和CAM 基因多态性与经济性状的关联分析第134-138页
   ·京海黄鸡 OPN 基因多态性与经济性状的关联分析第134-137页
     ·京海黄鸡 OPN 基因多态性与生长性状的关联分析第134-135页
     ·京海黄鸡 OPN 基因多态性与繁殖性状的关联分析第135-136页
     ·京海黄鸡OPN 基因多态性与母鸡300 日龄蛋壳质量性状的关联分析第136-137页
     ·京海黄鸡 OPN 基因多态性与屠宰性状和肉质性状的关联分析第137页
   ·京海黄鸡CAM 基因多态性与经济性状的关联分析第137-138页
 4 京海黄鸡OPN 基因和CAM 基因的贡献率第138-140页
   ·京海黄鸡 OPN 基因贡献率第139-140页
   ·京海黄鸡 CAM 基因贡献率第140页
 5 京海黄鸡OPN 基因和CAM 基因的主效应指数第140-141页
   ·京海黄鸡 OPN 基因的主效应指数第140-141页
   ·京海黄鸡 CAM 基因的主效应指数第141页
 6 京海黄鸡 OPN 基因和 CAM 基因的互作效应第141-143页
 7 OPN 基因和 CAM 基因不同基因型间的组合效应分析第143-144页
第五部分 结论第144-146页
参考文献第146-160页
致谢第160-161页
攻读学位期间发表的学术论文第161页

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