中文摘要 | 第1-12页 |
ABSTRACT | 第12-16页 |
常用词语缩写 | 第16-17页 |
第一章 文献综述 | 第17-42页 |
1 禽类生长性状候选基因研究进展 | 第17-22页 |
·生长激素基因研究进展 | 第18-19页 |
·生长激素受体基因研究进展 | 第19-20页 |
·类胰岛素样生长因子(IGFS)基因研究进展 | 第20-21页 |
·生长素(Ghrelin)基因的研究进展 | 第21-22页 |
2 垂体特异性转录因子(PIT-1)及PIT-1 基因研究进展 | 第22-29页 |
·垂体特异性转录因子的发现及命名 | 第22页 |
·垂体特异性转录因子的结构 | 第22-23页 |
·PIT-1 基因的结构 | 第23-24页 |
·PIT-1 基因的表达 | 第24-26页 |
·PIT-1 基因的转录 | 第26页 |
·PIT-1 基因的生物学效应 | 第26-28页 |
·调节胚胎分化和相关细胞系的发育 | 第26-27页 |
·对动物的生长发育的影响 | 第27页 |
·协同作用 | 第27-28页 |
·PIT-1 基因的多态性研究 | 第28-29页 |
3 遗传标记辅助选择 | 第29-33页 |
·遗传标记 | 第30-31页 |
·单核苷酸多态性 | 第31-33页 |
·SNPs 的检测方法 | 第31-32页 |
·SNPs 在鹅遗传变异分析中的应用 | 第32-33页 |
4 实时荧光定量PCR 分析技术 | 第33-38页 |
·实时荧光定量PCR 的原理 | 第35页 |
·实时荧光定量PCR 的定量方法 | 第35-36页 |
·标准曲线法的相对定量 | 第36页 |
·标准曲线法的绝对定量 | 第36页 |
·比较Ct 法的相对定量 | 第36页 |
·荧光定量PCR 技术的应用 | 第36-38页 |
5 生物信息学研究内容与方法 | 第38-39页 |
6 本试验选用的6 个群体简介 | 第39-40页 |
7 本研究的目的与意义 | 第40-42页 |
第二章 鹅PIT-1 基因编码区和部分内含子序列的克隆及生物信息学分析 | 第42-69页 |
1 引言 | 第42页 |
2 试验材料 | 第42页 |
3 试剂与仪器 | 第42-44页 |
·主要试剂与仪器 | 第42-43页 |
·主要试剂的配制 | 第43-44页 |
·主要分子生物学软件 | 第44页 |
4 试验方法 | 第44-52页 |
·鹅基因组DNA 提取 | 第44-45页 |
·鹅垂体组织总RNA 的提取 | 第45-46页 |
·提取RNA 前的准备工作 | 第45页 |
·Trizol 一步法提取组织总RNA | 第45-46页 |
·RNA 检测 | 第46页 |
·反转录 | 第46-47页 |
·引物设计 | 第47-48页 |
·目的片段的扩增 | 第48-49页 |
·DNA 片段的克隆测序 | 第49-52页 |
·DNA 片段的回收 | 第49页 |
·感受态细胞的制备(CaCL_2 法) | 第49-50页 |
·PCR 产物的T 载体连接 | 第50页 |
·转化 | 第50页 |
·碱裂解法质粒DNA 的小规模提取 | 第50-51页 |
·重组质粒的鉴定和测序 | 第51-52页 |
5 结果与分析 | 第52-66页 |
·RNA 质量 | 第52页 |
·PCR 和RT-PCR 的扩增结果 | 第52-54页 |
·鹅PIT-1 基因外显子1 和2 的扩增结果 | 第52-53页 |
·鹅PIT-1 基因内含子2 和2a 的扩增结果 | 第53-54页 |
·PIT-1 基因部分编码区RT-PCR 扩增结果 | 第54页 |
·鹅PIT-1 基因编码区的生物信息学分析 | 第54-63页 |
·PIT-1 基因编码区序列拼接及比对结果 | 第54页 |
·鹅PIT-1 基因的编码区序列与其它物种的比较 | 第54-58页 |
·鹅 PIT-1 基因编码区序列的碱基组成 | 第58页 |
·鹅 PIT-1 基因编码区密码子使用分析 | 第58-60页 |
·磷酸化位点预测 | 第60页 |
·疏水性分析 | 第60-61页 |
·蛋白质的跨膜螺旋特征 | 第61-62页 |
·鹅 Pit-1 蛋白质二级结构的预测 | 第62页 |
·鹅 PIT-1 基因保守结构域预测 | 第62-63页 |
·鹅 PIT-1 基因内含子 2 和 2a 序列的测定及同源性分析 | 第63-66页 |
6 讨论 | 第66-69页 |
·鹅PIT-1 基因序列的克隆 | 第66-67页 |
·蛋白质结构特性分析 | 第67-68页 |
·保守区域分析 | 第68-69页 |
第三章 鹅PIT-1 基因的遗传变异及其遗传效应分析 | 第69-94页 |
1 引言 | 第69页 |
第一节 鹅PIT-1 基因插入/缺失多态性分析及其与生产性能的关联 | 第69-79页 |
1 试验材料 | 第69-73页 |
·试验群体 | 第69-70页 |
·主要仪器 | 第70-71页 |
·主要试剂的配制 | 第71页 |
·引物设计及PCR 扩增 | 第71-72页 |
·电泳判型 | 第72页 |
·多态片段的序列测定 | 第72页 |
·数据统计分析 | 第72-73页 |
(1) 基因频率、基因型频率在各群体中分布的差异检验 | 第72-73页 |
(2) 关联分析 | 第73页 |
2 结果与分析 | 第73-79页 |
·鹅PIT-1 基因插入/缺失多态性分析 | 第73-74页 |
·不同基因型序列的比对 | 第74-75页 |
·不同群体基因型分布及等位基因频率 | 第75-76页 |
·鹅PIT-1 基因插入/缺失突变与性状的相关 | 第76-79页 |
第二节 鹅PIT-1 基因的SNPS 筛查及其与生产性能相关 | 第79-89页 |
1 试验材料 | 第79-80页 |
·试验群体 | 第79页 |
·主要仪器及试剂配制 | 第79页 |
·引物设计 | 第79-80页 |
2 试验方法 | 第80-81页 |
·基因组DNA 的提取 | 第80页 |
·PCR 扩增 | 第80页 |
·SSCP 分析 | 第80-81页 |
·多态片段的序列测定 | 第81页 |
·数据统计与分析 | 第81页 |
·相关软件 | 第81页 |
·统计方法 | 第81页 |
3 结果与分析 | 第81-89页 |
·鹅PIT-1 基因SNPS 筛查结果 | 第81-85页 |
·鹅PIT-1 基因遗传变异的基因频率及在各群体内的基因型分布 | 第85-87页 |
·鹅PIT-1 基因遗传变异与5 个群体早期体重的相关性分析 | 第87页 |
·鹅PIT-1 基因遗传变异与3 个群体11 周龄屠宰性能的相关性分析 | 第87-89页 |
第三节 讨论 | 第89-94页 |
1 PIT-1 基因的多态性研究 | 第89-91页 |
·PIT-1 基因内含子1 的多态分析 | 第89-90页 |
·PIT-1 基因单核苷酸多态分析 | 第90-91页 |
2 鹅PIT-1 基因与性能的相关 | 第91-94页 |
第四章 鹅PIT-1 基因、GH 基因和PRL 基因早期表达规律的研究 | 第94-124页 |
1 引言 | 第94页 |
2 试验材料 | 第94-95页 |
·试验动物 | 第94-95页 |
·主要试剂及仪器 | 第95页 |
·试剂配制 | 第95页 |
3 试验方法 | 第95-100页 |
·引物合成 | 第95-96页 |
·组织总RNA 的提取 | 第96页 |
·反转录 | 第96-97页 |
·目的片段的PCR 扩增 | 第97页 |
·扩增片段的回收和克隆测序 | 第97页 |
·重组质粒的提取 | 第97-98页 |
·实时荧光定量PCR | 第98-99页 |
·统计分析 | 第99-100页 |
·荧光定量计算方法 | 第99-100页 |
·引物扩增效率的计算 | 第100页 |
4 结果与分析 | 第100-117页 |
·常规PCR 及测序结果 | 第100-101页 |
·目的基因与内参基因的标准曲线及溶解曲线 | 第101-106页 |
·皖西白鹅PIT-1 基因不同发育阶段的表达规律 | 第106-108页 |
·GH 基因的表达规律 | 第108-114页 |
·皖西白鹅垂体内GH 基因不同发育阶段的变化 | 第108-111页 |
·皖西白鹅下丘脑内GH 基因不同发育阶段的变化 | 第111-114页 |
·PRL 基因的表达规律 | 第114-117页 |
·皖西白鹅母鹅垂体内PRL 基因的发育性变化 | 第114-115页 |
·皖西白鹅母鹅下丘脑内 PRL 基因的发育性变化 | 第115页 |
·皖西白鹅母鹅卵巢内 PRL 基因的发育性变化 | 第115-116页 |
·皖西白鹅母鹅不同组织内 PRL 变化趋势的比较 | 第116-117页 |
·皖西白鹅垂体内 3 种基因的表达变化 | 第117页 |
5 讨论 | 第117-124页 |
·相对定量方法 | 第117-119页 |
·PIT-1 基因的表达 | 第119-120页 |
·GH 基因的表达 | 第120-121页 |
·PRL 基因的表达 | 第121-122页 |
·基因的协同表达 | 第122-124页 |
全文结论 | 第124-126页 |
参考文献 | 第126-139页 |
致谢 | 第139-141页 |
攻读学位期间发表学术论文目录 | 第141-143页 |