| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第一篇 “弱化初级代谢提高抗生素产量”的改造策略 | 第16-94页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-34页 |
| 1.1 井冈霉素的研究现状 | 第16-25页 |
| 1.1.1 井冈霉素的生物合成研究进展 | 第17-21页 |
| 1.1.2 井冈霉素的发酵工程研究进展 | 第21-23页 |
| 1.1.3 井冈霉素产生菌组学研究进展 | 第23-25页 |
| 1.2 放线菌高产菌株代谢工程改造概述 | 第25-32页 |
| 1.2.1 阿维菌素高产菌株代谢工程改造 | 第25-27页 |
| 1.2.2 红霉素高产菌株代谢工程改造 | 第27-28页 |
| 1.2.3 匹马霉素高产菌株代谢工程改造 | 第28-30页 |
| 1.2.4 克拉维酸高产菌株代谢工程改造 | 第30-31页 |
| 1.2.5 林可霉素高产菌株代谢工程改造 | 第31-32页 |
| 1.3 研究的内容和目的 | 第32-34页 |
| 1.3.1 研究内容 | 第32-33页 |
| 1.3.2 研究目的 | 第33-34页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第34-55页 |
| 2.1 研究中所用菌株 | 第34-36页 |
| 2.2 研究中所用质粒 | 第36-38页 |
| 2.3 研究中所用引物 | 第38-46页 |
| 2.4 研究中所用培养基 | 第46-47页 |
| 2.5 研究中所用试剂和缓冲液 | 第47-48页 |
| 2.6 实验方法 | 第48-55页 |
| 第三章 “弱化初级代谢提高抗生素产量”假说的提出和验证 | 第55-66页 |
| 3.1 前言 | 第55页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第55-65页 |
| 3.2.1 三个大片段缺失起关键贡献 | 第55-57页 |
| 3.2.2 大片段缺失突变株产量和生物量变化呈负相关 | 第57-58页 |
| 3.2.3 Det-Ⅰ 和 Det-Ⅲ 区域关键基因的鉴定 | 第58-60页 |
| 3.2.4 大片段缺失突变株代谢物组分析 | 第60-62页 |
| 3.2.55008 及TL01 的定向高产改造 | 第62-65页 |
| 3.3 小结 | 第65-66页 |
| 第四章 多种抗生素产生菌株初级代谢的弱化改造 | 第66-83页 |
| 4.1 前言 | 第66页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第66-81页 |
| 4.2.1 红霉素产生菌Saccharopolyspora erythraea NRRL2338 改造 | 第66-70页 |
| 4.2.2 林可霉素产生菌Streptomyces lincolnensis LC-G改造 | 第70-72页 |
| 4.2.3 庆大霉素产生菌Micromonospora echinospora ATCC15838 改造 | 第72-75页 |
| 4.2.4 阿维菌素产生菌Streptomyces avermitilis76-5 改造 | 第75-81页 |
| 4.3 小结 | 第81-83页 |
| 第五章 链霉菌线型质粒pSHJG1 的功能研究 | 第83-94页 |
| 5.1 前言 | 第83页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第83-92页 |
| 5.2.1 TL01 中线型质粒pSHJG1 整体呈现低表达 | 第83-84页 |
| 5.2.2 线型质粒消除策略的建立和完善 | 第84-87页 |
| 5.2.3 线型质粒消除提高井冈霉素产量 | 第87-90页 |
| 5.2.4 线型质粒pSHJG1 中关键基因的确认 | 第90-91页 |
| 5.2.5 线型质粒 p HZ228 消除提高抗生素 FR008/杀念菌素产量 | 第91-92页 |
| 5.3 小结 | 第92-94页 |
| 第二篇 盐霉素产生菌基因组解析及定向高产改造 | 第94-148页 |
| 第六章 文献综述 | 第94-114页 |
| 6.1 盐霉素的研究现状 | 第94-103页 |
| 6.1.1 盐霉素的生物合成研究进展 | 第95-102页 |
| 6.1.2 盐霉素的发酵工程研究进展 | 第102-103页 |
| 6.2 PKS常用辅酶A类前体研究现状 | 第103-113页 |
| 6.2.1 丙二酰辅酶A(malonyl-CoA) | 第104-105页 |
| 6.2.2 甲基丙二酰辅酶A((2S)-methylmalonyl-CoA) | 第105-108页 |
| 6.2.3 乙基丙二酰辅酶A((2S)-ethylmalonyl-CoA) | 第108-110页 |
| 6.2.4 氯代乙基丙二酰辅酶A(chloroethylmalonyl-CoA) | 第110-111页 |
| 6.2.5 其他辅酶A类前体 | 第111-113页 |
| 6.3 研究内容 | 第113-114页 |
| 6.3.1 研究内容 | 第113-114页 |
| 第七章 实验材料与方法 | 第114-122页 |
| 7.1 研究中所用菌株 | 第114-115页 |
| 7.2 研究中所用质粒 | 第115-116页 |
| 7.3 研究中所用引物 | 第116-119页 |
| 7.4 研究中所用培养基 | 第119页 |
| 7.5 实验方法 | 第119-122页 |
| 第八章 白色链霉菌DSM41398 基因组完整图谱构建和解析 | 第122-138页 |
| 8.1 前言 | 第122-123页 |
| 8.2 结果与讨论 | 第123-137页 |
| 8.2.1 S.albus DSM41398 全基因组完整图谱的构建 | 第123-125页 |
| 8.2.2 S.albus DSM41398 全基因组的基本特征 | 第125-128页 |
| 8.2.3 S.albus DSM41398 中次级代谢生物合成基因簇的功能预测 | 第128-130页 |
| 8.2.4 参与盐霉素合成的前体代谢网络重构 | 第130-132页 |
| 8.2.5 S.albus DSM41398 豆油利用偏好性研究 | 第132-137页 |
| 8.3 小结 | 第137-138页 |
| 第九章 前体浓度微调整促进盐霉素产量提高 | 第138-148页 |
| 9.1 前言 | 第138页 |
| 9.2 结果与讨论 | 第138-147页 |
| 9.2.1 PKS生物合成基因簇的生物信息学分析 | 第138-139页 |
| 9.2.2 PKS生物合成基因簇的转录量分析 | 第139-140页 |
| 9.2.3 竞争基因簇中断促进产量提高 | 第140-141页 |
| 9.2.4 组合缺失突变株产量没有进一步的提高 | 第141-142页 |
| 9.2.5 乙基丙二酰辅酶A的供应是新的限速步骤 | 第142-143页 |
| 9.2.6 编码巴豆酰辅酶A还原酶基因的鉴定 | 第143-145页 |
| 9.2.7 超量表达ccr基因促进组合缺失突变株产量进一步提高 | 第145-146页 |
| 9.2.8 超量表达ccr基因促进高产菌株产量进一步提高 | 第146-147页 |
| 9.3 小结 | 第147-148页 |
| 第十章 总结与展望 | 第148-150页 |
| 10.1 总结 | 第148页 |
| 10.2 本研究的创新点 | 第148-149页 |
| 10.3 工作展望 | 第149-150页 |
| 参考文献 | 第150-162页 |
| 致谢 | 第162-164页 |
| 攻读博士期间的研究成果 | 第164页 |
