| 摘要一 | 第3-5页 |
| ABSTRACT一 | 第5-8页 |
| 摘要二 | 第8-10页 |
| ABSTRACT二 | 第10-17页 |
| 缩略词 | 第17-18页 |
| 课题一 高效灵敏水稻生长素标记系统的建立及应用 | 第18-140页 |
| 第一章 综述 | 第18-58页 |
| 1.1 生长素的研究进展 | 第18-33页 |
| 1.1.1 生长素及其分类 | 第18-19页 |
| 1.1.2 生长素的合成途径 | 第19-21页 |
| 1.1.3 生长素的运输方式 | 第21-25页 |
| 1.1.4 生长素极性运输与局部非对称分布之间的联系 | 第25-30页 |
| 1.1.5 生长素的作用方式及信号转导途径 | 第30-33页 |
| 1.2 生长素的研究方法及定位分布 | 第33-43页 |
| 1.2.1 单双子叶模式植物(拟南芥,玉米以及水稻)的形态学差异 | 第33-36页 |
| 1.2.2 生长素在双子叶植物拟南芥中的研究方法及定位分布 | 第36-41页 |
| 1.2.3 生长素在单子叶模式植物玉米中的研究方法及定位分布 | 第41-42页 |
| 1.2.4 生长素在单子叶模式植物水稻中的研究方法及定位分布 | 第42-43页 |
| 1.3 当代农业现状和磷元素吸收 | 第43-47页 |
| 1.3.1 当今世界的水稻农业发展及研究现状 | 第43-44页 |
| 1.3.2 磷元素的分布和吸收特点 | 第44-45页 |
| 1.3.3 根系结构特征与磷元素获取和吸收之间的联系 | 第45-47页 |
| 1.4 根弯曲角度表型和aux1 突变体研究 | 第47-48页 |
| 1.5 AUX1 基因在根发育方面的功能研究 | 第48-54页 |
| 1.5.1 AUX1 载体家族的表达模式与功能 | 第48-50页 |
| 1.5.2 AUX1 基因与根尖内的生长素分布 | 第50页 |
| 1.5.3 AUX1 基因参与调控植物根毛发育 | 第50-51页 |
| 1.5.4 AUX1 基因参与调控植物根尖对重力的响应过程 | 第51-52页 |
| 1.5.5 AUX1 基因参与调控植物侧根发育 | 第52-54页 |
| 1.6 土壤根系表型观察以及无损伤X射线显微计算机断层扫描(Computed Tomography,CT)成像技术 | 第54-56页 |
| 1.7 研究目的和意义 | 第56-58页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第58-79页 |
| 2.1 实验材料 | 第58-59页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第58页 |
| 2.1.2 质粒载体 | 第58-59页 |
| 2.1.3 菌种 | 第59页 |
| 2.1.4 化学药物及抗体 | 第59页 |
| 2.2 实验方法 | 第59-79页 |
| 2.2.1 质粒构建与转化 | 第59-61页 |
| 2.2.2 质粒电转法转化农杆菌 | 第61-62页 |
| 2.2.3 质粒水浴热激法转化大肠杆菌 | 第62页 |
| 2.2.4 拟南芥转化 | 第62-63页 |
| 2.2.5 农杆菌侵染水稻愈伤组织 | 第63-64页 |
| 2.2.6 植物基因组DNA提取 | 第64-65页 |
| 2.2.7 基因转录水平分析 | 第65-69页 |
| 2.2.8 植物的种植与培养 | 第69-70页 |
| 2.2.9 植物材料制备与振动切片 | 第70页 |
| 2.2.10 激素或相关药物处理 | 第70-71页 |
| 2.2.11 根向重力性分析 | 第71页 |
| 2.2.12 进化分析、拓扑结构和启动子结合位点预测 | 第71页 |
| 2.2.13 芯片数据分析 | 第71-72页 |
| 2.2.14 免疫染色 | 第72-73页 |
| 2.2.15 水稻osaux1 突变体鉴定 | 第73页 |
| 2.2.16 水稻根组织GUS染色 | 第73页 |
| 2.2.17 X射线显微CT和水稻根系成像 | 第73-75页 |
| 2.2.18 水稻根部高磷和低磷处理 | 第75-76页 |
| 2.2.19 IAA含量的生化测定 | 第76-77页 |
| 2.2.20 水稻生长素报告株系的建立和成像 | 第77页 |
| 2.2.21 SP5 激光共聚焦显微镜和双光子激光扫描显微镜(TLSM)观察 | 第77-79页 |
| 第三章 高效灵敏水稻生长素标记系统能够动态追踪水稻发育过程中生长素的响应调控 | 第79-118页 |
| 3.1 引言 | 第79-80页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第80-114页 |
| 3.2.1 水稻和拟南芥中生长素响应元件DR5 和结合结构域DII的保守性分析 | 第80-83页 |
| 3.2.2 水稻生长素标记系统在拟南芥组织中也能发挥功能 | 第83-84页 |
| 3.2.3 DR5-VENUS信号可以特异性地标记水稻生长素的响应位点及相对含量 | 第84-92页 |
| 3.2.4 生长素在水稻不同组织中的表达模式以及潜在功能 | 第92-104页 |
| 3.2.5 不同物种(拟南芥,玉米以及水稻)之间生长素响应模式的异同 | 第104-108页 |
| 3.2.6 水稻花器官中生长素转运载体基因参与促进生长素的重新分布 | 第108-114页 |
| 3.3 本章小结与讨论 | 第114-118页 |
| 3.3.1 DR5-VENUS标记系统在水稻中对生长素的响应能力更强 | 第114-115页 |
| 3.3.2 DII-VENUS能够标记生长素的细胞输入水平并对外界刺激作出快速反应 | 第115页 |
| 3.3.3 首次揭示了水稻根皮层细胞内的生长素积累在侧根形成机制中的重要作用 | 第115-116页 |
| 3.3.4 首次证明了生长素梯度分布参与决定水稻花序分枝和花器官的形成 | 第116-118页 |
| 第四章 生长素输入载体基因OsAUX1 参与调控水稻根毛对低磷环境的伸长响应 | 第118-136页 |
| 4.1 引言 | 第118页 |
| 4.2 实验结果与分析 | 第118-132页 |
| 4.2.1 水稻At AUX1 同源基因OsAUX1 的鉴定及特征分析 | 第118-122页 |
| 4.2.2 OsAUX1 基因突变能够导致根弯曲角度的改变 | 第122-123页 |
| 4.2.3 水稻根弯曲角度的改变不影响Osaux1 突变体的磷吸收率 | 第123-127页 |
| 4.2.4 低磷条件下OsAUX1 基因参与水稻根毛的伸长 | 第127-129页 |
| 4.2.5 水稻根尖和表皮细胞内的生长素响应和含量升高是低磷环境和OsAUX1 共同作用的结果 | 第129-132页 |
| 4.3 本章小结与讨论 | 第132-136页 |
| 4.3.1 OsAUX1 负调控重力刺激下的根弯曲角度 | 第132-133页 |
| 4.3.2 OsAUX1 和低磷条件对根毛生长具有正向调节作用 | 第133页 |
| 4.3.3 成熟区生长素水平的下降削弱了根尖对外源低磷刺激的敏感性 | 第133-134页 |
| 4.3.4 OsAUX1 参与介导低磷诱导的生长素运输 | 第134-136页 |
| 第五章 本课题总结与展望 | 第136-140页 |
| 5.1 主要结论 | 第136-137页 |
| 5.2 研究创新性 | 第137页 |
| 5.3 后续工作展望 | 第137-140页 |
| 课题二 人类UGT1 基因家族遗传多样性分析 | 第140-185页 |
| 第一章 综述 | 第140-157页 |
| 1.1 人类尿苷二磷酸葡糖醛酸转移酶1(UGT1)基因家族介绍 | 第140-148页 |
| 1.1.1 UGT超家族的组成成员及其基因结构 | 第140-142页 |
| 1.1.2 UGT1A基因的功能 | 第142-144页 |
| 1.1.3 UGT1A基因的表达模式及表达水平调控 | 第144-148页 |
| 1.2 UGT1A遗传多样性的种类及产生机制[277] | 第148-151页 |
| 1.2.1 UGT1A基因剪切机制[278] | 第148-149页 |
| 1.2.2 UGT1A基因单核苷酸多态性 | 第149-150页 |
| 1.2.3 UGT1A基因拷贝数变异 | 第150页 |
| 1.2.4 UGT1A基因的表观遗传差异[282] | 第150-151页 |
| 1.3 UGT1A遗传多样性与临床疾病 | 第151-155页 |
| 1.3.1 UGT1A与高胆红素血症 | 第151-153页 |
| 1.3.2 UGT1A与癌症发生及治疗药物毒性 | 第153-155页 |
| 1.3.3 UGT1A与自身免疫疾病 | 第155页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第155-157页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第157-162页 |
| 2.1 实验材料 | 第157页 |
| 2.2 实验方法 | 第157-162页 |
| 2.2.1 人类全基因组DNA样品的制备 | 第157页 |
| 2.2.2 UGT1 基因簇片段扩增以及重测序 | 第157-160页 |
| 2.2.3 SNP位点以及连锁不平衡分析 | 第160页 |
| 2.2.4 单倍型重建和标签SNP筛选 | 第160-161页 |
| 2.2.5 不同民族之间的HapMap比较分析 | 第161-162页 |
| 第三章 中国人群中UGT1 基因簇可遗传变异和单倍型多样性的特征分析 | 第162-183页 |
| 3.1 引言 | 第162页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第162-178页 |
| 3.2.1 中国汉族人群中UGT1A基因簇内的SNP多样性分析 | 第162-165页 |
| 3.2.2 连锁不平衡分析和单倍型区块重建 | 第165-167页 |
| 3.2.3 UGT1A基因簇的单倍型重建和标签SNP选择 | 第167-168页 |
| 3.2.4 五个连锁不平衡区块的单倍型重建和标签SNP选择 | 第168-170页 |
| 3.2.5 九个UGT1A基因第一可变外显子内的单倍型重建和标签SNP选择 | 第170-172页 |
| 3.2.6 四个不同种族人群UGT1A基因簇的SNP多样性比对 | 第172-174页 |
| 3.2.7 四个不同种族人群UGT1A基因簇的连锁不平衡图谱比对 | 第174-176页 |
| 3.2.8 四个不同种族人群UGT1A基因簇的单倍型比对 | 第176-178页 |
| 3.3 本章小结与讨论 | 第178-183页 |
| 3.3.1 中国汉族人群体中UGT1A基因簇内的SNP位点异常丰富 | 第180页 |
| 3.3.2 中国汉族人群体中UGT1A基因簇内的稀有SNP位点分布情况及潜在应用 | 第180-181页 |
| 3.3.3 UGT1A1 致病性SNP位点在中国汉族群体中的分布情况 | 第181页 |
| 3.3.4 四个不同种族UGT1A基因簇内的SNP位点分布的异质性 | 第181页 |
| 3.3.5 四个不同种族UGT1A基因簇内的单倍型分布的种族特异性 | 第181-183页 |
| 第四章 本课题总结与展望 | 第183-185页 |
| 4.1 主要结论 | 第183页 |
| 4.2 研究创新性 | 第183-184页 |
| 4.3 后续工作展望 | 第184-185页 |
| 参考文献 | 第185-206页 |
| 附录 | 第206-217页 |
| 致谢 | 第217-219页 |
| 攻读博士期间已录用或待发表论文和专利情况 | 第219-221页 |
