| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第14-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-27页 |
| 1.1 铜绿假单胞菌生物学特性 | 第15-16页 |
| 1.1.1 病原及致病特点 | 第15页 |
| 1.1.2 运动特点 | 第15-16页 |
| 1.2 水貂出血性肺炎流行病学研究 | 第16-17页 |
| 1.2.1 水貂出血性肺炎发病情况 | 第16页 |
| 1.2.2 流行特点 | 第16-17页 |
| 1.3 铜绿假单胞菌耐药性及耐药机制 | 第17-20页 |
| 1.3.1 动物源 PA 耐药性研究进展 | 第17页 |
| 1.3.2 耐药机制 | 第17-20页 |
| 1.4 铜绿假单胞菌毒力因子 | 第20-24页 |
| 1.4.1 定植因子 | 第20-21页 |
| 1.4.2 毒素 | 第21-22页 |
| 1.4.3 T6SS分泌系统和生物被膜 | 第22-23页 |
| 1.4.4 PA5155和ygfA基因功能 | 第23-24页 |
| 1.5 铜绿假单胞菌比较基因组学研究进展 | 第24-26页 |
| 1.5.1 比较基因组学 | 第24-25页 |
| 1.5.2 核心基因组进化 | 第25-26页 |
| 1.6 本研究的目的与意义 | 第26-27页 |
| 第二章 貂源铜绿假单胞菌生物学特性与致病性分析 | 第27-49页 |
| 2.1 材料和方法 | 第27-31页 |
| 2.1.1 实验动物与菌株 | 第27页 |
| 2.1.2 仪器试剂与测序 | 第27页 |
| 2.1.3 试剂配制 | 第27-28页 |
| 2.1.4 病料采集及细菌分离 | 第28页 |
| 2.1.5 细菌鉴定 | 第28-29页 |
| 2.1.6 血清分型 | 第29-30页 |
| 2.1.7 绿脓菌素生成检测 | 第30页 |
| 2.1.8 细菌运动能力检测 | 第30页 |
| 2.1.9 生物被膜形成能力检测 | 第30-31页 |
| 2.1.10 水貂感染模型的建立 | 第31页 |
| 2.1.11 LD_(50）测定 | 第31页 |
| 2.2 结果与分析 | 第31-48页 |
| 2.2.1 细菌分离和培养特性 | 第31-34页 |
| 2.2.2 分离菌株鉴定结果 | 第34-36页 |
| 2.2.3 分离菌血清分型结果 | 第36页 |
| 2.2.4 绿脓菌素 | 第36页 |
| 2.2.5 运动能力 | 第36-41页 |
| 2.2.6 生物被膜形成能力 | 第41-42页 |
| 2.2.7 水貂感染模型的建立 | 第42-46页 |
| 2.2.8 LD_(50）测定结果 | 第46-48页 |
| 2.3 讨论 | 第48-49页 |
| 第三章 水貂源铜绿假单胞菌的种群结构及遗传进化关系研究 | 第49-63页 |
| 3.1 材料和方法 | 第49-51页 |
| 3.1.1 菌株和试验动物 | 第49页 |
| 3.1.2 试剂和仪器 | 第49-50页 |
| 3.1.3 脉冲场凝胶电泳 | 第50页 |
| 3.1.4 多位点序列分型 | 第50-51页 |
| 3.1.5 菌株全基因组测序 | 第51页 |
| 3.2 结果与分析 | 第51-60页 |
| 3.2.1 脉冲场凝胶电泳结果分析 | 第51-53页 |
| 3.2.2 多位点序列分型结果分析 | 第53-57页 |
| 3.2.3 遗传进化关系分析 | 第57-60页 |
| 3.3 讨论 | 第60-63页 |
| 第四章 水貂源铜绿假单胞菌耐药性及耐药机制研究 | 第63-73页 |
| 4.1 材料和方法 | 第63-66页 |
| 4.1.1 菌株 | 第63页 |
| 4.1.2 主要试剂和仪器 | 第63页 |
| 4.1.3 最小抑菌浓度试验(MIC) | 第63-64页 |
| 4.1.4 细菌总DNA的提取 | 第64页 |
| 4.1.5 磷霉素fosA3、fosA、fosC2 基因的PCR扩增 | 第64-65页 |
| 4.1.6 磷霉素glpt基因变异分析 | 第65页 |
| 4.1.7 喹诺酮类药物PMQR及 MBL基因的扩增 | 第65页 |
| 4.1.8 喹诺酮类药物QRDR区变异分析 | 第65-66页 |
| 4.1.9 重测序耐药基因检测 | 第66页 |
| 4.2 结果与分析 | 第66-72页 |
| 4.2.1 MIC结果 | 第66-67页 |
| 4.2.2 磷霉素耐药基因fosA、fosA3、fosC的扩增 | 第67页 |
| 4.2.3 磷霉素耐药基因glpt基因的序列分析 | 第67-68页 |
| 4.2.4 喹诺酮类药物耐药基因检测结果 | 第68-71页 |
| 4.2.5 重测序基因检测结果 | 第71-72页 |
| 4.3 讨论 | 第72-73页 |
| 第五章 貂源铜绿假单胞菌的全基因组序列注释及比较基因组学分析 | 第73-112页 |
| 5.1 材料与方法 | 第73-77页 |
| 5.1.1 菌株 | 第73-75页 |
| 5.1.2 菌株全基因组测序 | 第75页 |
| 5.1.3 基因组组分分析 | 第75-76页 |
| 5.1.4 基因功能注释 | 第76-77页 |
| 5.1.5 比较基因组分析 | 第77页 |
| 5.2 结果与分析 | 第77-108页 |
| 5.2.1 基因组基本分析 | 第77-85页 |
| 5.2.2 基因组功能分析 | 第85-92页 |
| 5.2.3 基因组功能注释分析 | 第92-100页 |
| 5.2.4 比较基因组分析 | 第100-108页 |
| 5.3 讨论 | 第108-112页 |
| 第六章 铜绿假单胞菌HY-3 PA5155和ygfA基因功能分析 | 第112-129页 |
| 6.1 材料与方法 | 第112-118页 |
| 6.1.1 细胞、菌株和质粒 | 第112页 |
| 6.1.2 主要试剂和仪器 | 第112页 |
| 6.1.3 引物设计 | 第112-113页 |
| 6.1.4 PA5155 基因和ygfA基因缺失株的构建 | 第113-116页 |
| 6.1.5 PA5155基因和ygfA基因缺失株的互补株构建 | 第116-117页 |
| 6.1.6 生长曲线的测定 | 第117-118页 |
| 6.1.7 小鼠LD50测定 | 第118页 |
| 6.1.8 生物被膜形成能力检测 | 第118页 |
| 6.1.9 貂肺上皮细胞黏附能力检测 | 第118页 |
| 6.1.10 运动性检测 | 第118页 |
| 6.1.11 耐药性检测 | 第118页 |
| 6.2 结果与分析 | 第118-128页 |
| 6.2.1 PA5155基因缺失株的构建及鉴定 | 第118-121页 |
| 6.2.2 ygfA基因缺失株的构建及鉴定 | 第121-123页 |
| 6.2.3 PA5155和ygfA基因互补株的构建及鉴定 | 第123-125页 |
| 6.2.4 生长曲线测定结果 | 第125页 |
| 6.2.5 小鼠LD50检测结果 | 第125-126页 |
| 6.2.6 生被被膜形成能力 | 第126页 |
| 6.2.7 对貂肺上皮细胞黏附能力 | 第126-127页 |
| 6.2.8 运动性 | 第127-128页 |
| 6.2.9 耐药性 | 第128页 |
| 6.3 讨论 | 第128-129页 |
| 第七章 全文结论 | 第129-130页 |
| 参考文献 | 第130-142页 |
| 附录 | 第142-162页 |
| 致谢 | 第162-163页 |
| 作者简历 | 第163页 |
