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基于蛋白质组学的白颖苔草盐胁迫下应激调控机理的研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 研究综述第11-25页
    1.1 土壤盐碱化的形成和分布第11页
    1.2 盐胁迫对植物的影响第11-14页
        1.2.1 植物因盐胁迫所受到的胁迫危害第11-12页
        1.2.2 植物盐胁迫下生理的变化第12-13页
        1.2.3 植物盐胁迫下生化的变化第13-14页
    1.3 草坪草抗逆研究进展第14-23页
        1.3.1 草坪草的抗逆性评价和筛选第15-16页
        1.3.2 草坪草的逆境应答和抵抗机制第16-18页
        1.3.3 草坪草抗逆遗传与育种第18-19页
        1.3.4 外源施加物质提高草坪草抗逆性第19-21页
        1.3.5 组学方法研究草坪草抗逆性第21-23页
    1.4 本研究的目的意义第23-25页
第二章 白颖苔草盐胁迫下的生长及生理生化变化第25-43页
    2.1 实验材料第25-26页
        2.1.1 植物材料第25页
        2.1.2 实验仪器第25页
        2.1.3 药品及试剂第25-26页
    2.2 实验方法第26-28页
        2.2.1 植物材料的培养及处理第26页
        2.2.2 草坪质量的评定第26-27页
        2.2.3 相对含水量的测定第27页
        2.2.4 相对电导率的测定第27页
        2.2.5 光化学效率的测定第27页
        2.2.6 脯氨酸含量的测定第27页
        2.2.7 生化代谢物质的测定第27-28页
        2.2.8 离子(钙、钾、钠)含量的测定第28页
        2.2.9 数据处理第28页
    2.3 结果与分析第28-41页
        2.3.1 白颖苔草在盐胁迫下的生长情况第28-32页
        2.3.2 白颖苔草在盐胁迫下相对含水量的变化第32-33页
        2.3.3 白颖苔草在盐胁迫下相对电导率的变化第33-34页
        2.3.4 白颖苔草在盐胁迫下光化学效率的变化第34-35页
        2.3.5 白颖苔草在盐胁迫下脯氨酸含量的变化第35-36页
        2.3.6 白颖苔草在盐胁迫下活性氧的变化第36-37页
        2.3.7 白颖苔草在盐胁迫下非酶类氧化剂的变化第37-38页
        2.3.8 白颖苔草在盐胁迫下抗氧化酶活的变化第38-39页
        2.3.9 白颖苔草在盐胁迫下几种代谢物质的变化第39-40页
        2.3.10 白颖苔草在盐胁迫下离子(钙、钾、钠)含量的变化第40-41页
    2.4 小结第41-43页
第三章 白颖苔草盐应答转录组的测序第43-63页
    3.1 实验材料第43-44页
        3.1.1 植物材料第43页
        3.1.2 实验仪器第43页
        3.1.3 药品及试剂第43-44页
    3.2 实验方法第44-48页
        3.2.1 植物材料的培养及处理第44页
        3.2.2 RNA的提取和质量检测第44-45页
        3.2.3 转录组测序第45-46页
            3.2.3.1 文库构建第45页
            3.2.3.2 上机测序第45页
            3.2.3.3 数据前期处理和 novo组装第45页
            3.2.3.4 基因功能注释及代谢通路分析第45-46页
            3.2.3.5 差异表达基因(DEGs)分析第46页
        3.2.4 Real-time qPCR( RT-qPCR)的验证分析第46-48页
            3.2.4.1 RNA的提取和浓度、质量检测第46-47页
            3.2.4.2 cDNA的合成第47页
            3.2.4.3 RT-qPCR引物设计第47页
            3.2.4.4 RT-qPCR实验第47-48页
    3.3 结果与分析第48-60页
        3.3.1 RNA质量检测结果第48-49页
        3.3.2 转录组测序原始数据统计分析第49-50页
        3.3.3 转录组de novo组装第50-51页
        3.3.4 Unigene的功能注释第51-52页
        3.3.5 UniGene的功能分类第52-55页
        3.3.6 差异基因(DEGs)的表达评估第55-56页
        3.3.7 DEGs的GO分类第56-57页
        3.3.8 DEGs的KEGG分类第57-60页
        3.3.9 DEGs表达水平的验证(RT-qPCR)第60页
    3.4 小结第60-63页
第四章 白颖苔草盐应答蛋白的鉴定分析第63-83页
    4.1 实验材料第63-64页
        4.1.1 植物材料第63页
        4.1.2 实验仪器第63页
        4.1.3 药品及试剂第63-64页
    4.2 实验方法第64-67页
        4.2.1 植物材料的培养及处理第64页
        4.2.2 样品制备第64页
        4.2.3 酶解和肽段定量第64-65页
        4.2.4 肽段标记第65页
        4.2.5 SCX分级第65页
        4.2.6 质谱分析第65页
        4.2.7 数据分析第65-66页
        4.2.8 差异蛋白(DEPs)的筛选、功能注释和分类第66页
        4.2.9 转录水平验证分析(RT-qPCR)第66-67页
            4.2.9.1 RNA的提取和浓度、质量检测第66页
            4.2.9.2 cDNA的合成第66-67页
            4.2.9.3 RT-qPCR引物设计第67页
            4.2.9.4 RT-qPCR实验第67页
        4.2.10 蛋白水平验证分析(PRM)第67页
    4.3 结果与分析第67-81页
        4.3.1 蛋白提取检测结果第67-69页
        4.3.2 蛋白质鉴定数据总览第69-70页
        4.3.3 差异蛋白(DEPs)的表达评估第70-72页
        4.3.4 DEPs的GO分类第72-73页
        4.3.5 DEPs的KEGG分类第73页
        4.3.6 DEPs的主要功能分类分析第73-79页
        4.3.7 DEPs的转录水平验证(RT-qPCR)第79-81页
        4.3.8 DEPs的蛋白表达水平验证(PRM方法)第81页
    4.4 小结第81-83页
第五章 候选蛋白的转录水平表达模式分析第83-91页
    5.1 实验材料第83页
        5.1.1 植物材料第83页
        5.1.2 实验仪器第83页
        5.1.3 药品及试剂第83页
    5.2 实验方法第83-84页
        5.2.1 植物材料的培养及处理第83-84页
        5.2.2 RNA的提取和浓度、质量检测第84页
        5.2.3 cDNA的合成第84页
        5.2.4 RT-qPCR引物设计第84页
        5.2.5 RT-qPCR实验第84页
    5.3 结果与分析第84-89页
        5.3.1 抗氧化剂相关蛋白转录表达模式分析第84-85页
        5.3.2 Ca~(2+)信号相关蛋白转录表达模式分析第85-86页
        5.3.3 植物激素应答信号相关蛋白转录表达模式分析第86-87页
        5.3.4 苯丙素代谢相关蛋白转录表达模式分析第87-89页
    5.4 小结第89-91页
第六章 全文讨论第91-101页
    6.1 黄骅白颖苔草为耐盐表型第91页
    6.2 各途径中DEPs在叶和根中于盐胁迫下的作用第91-97页
        6.2.1 碳水化合物和能量代谢相关的DEPs第91-92页
        6.2.2 光合作用和电子传递链相关的DEPs第92-93页
        6.2.3 信号感应和转导相关的DEPs第93-94页
        6.2.4 蛋白合成相关的DEPs第94-95页
        6.2.5 次级代谢相关的DEPs第95-96页
        6.2.6 逆境抵抗和其他逆境应答相关的DEPs第96-97页
    6.3 候选蛋白转录水平表达模式分析揭示耐盐机理第97-101页
        6.3.1 抗氧化相关蛋白第97页
        6.3.2 Ca~(2+)信号相关蛋白第97-98页
        6.3.3 植物激素应答信号相关蛋白第98页
        6.3.4 苯丙素代谢相关蛋白第98-101页
第七章 结论和展望第101-103页
    7.1 主要结论第101页
    7.2 研究创新点第101-102页
    7.3 工作展望第102-103页
附件第103-113页
参考文献第113-129页
致谢第129-131页
作者简介第131-133页

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