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两种热带作物锈菌LAMP分子检测技术的建立与应用

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
1. 文献综述第11-20页
    1.1 前言第11页
    1.2 锈菌的寄主范围及危害特点第11-12页
    1.3 锈菌及植物病原真菌常用检测方法第12-18页
        1.3.1 田间传统诊断第12页
        1.3.2 DNA探针技术第12-13页
        1.3.3 常规PCR技术第13页
        1.3.4 巢式PCR技术第13-14页
        1.3.5 qRT-PCR技术第14页
        1.3.6 环介导等温扩增技术第14-18页
    1.4 本研究目的及意义第18-19页
    1.5 技术路线第19-20页
2. 甘蔗褐锈病菌的LAMP检测体系建立与优化第20-42页
    2.1 引言第20-21页
    2.2 材料与方法第21-28页
        2.2.1 菌株第21页
        2.2.2 供试试剂第21-22页
        2.2.3 仪器设备第22页
        2.2.4 供试培养基第22-23页
        2.2.5 甘蔗褐锈病病叶DNA提取第23页
        2.2.6 其它真菌DNA的提取第23-24页
        2.2.7 甘蔗褐锈病菌ITS序列重组质粒的构建第24-25页
        2.2.8 引物设计与合成第25-26页
        2.2.9 LAMP初始反应体系及反应条件第26页
        2.2.10 LAMP反应产物的观察与鉴定第26页
        2.2.11 甘蔗褐锈病菌LAMP扩增引物组筛选第26页
        2.2.12 LAMP反应条件及体系优化第26-27页
        2.2.13 LAMP引物的特异性分析第27页
        2.2.14 灵敏度效果评价第27-28页
        2.2.15 不同检测技术在甘蔗田间病样中的应用第28页
    2.3 结果与分析第28-40页
        2.3.1 甘蔗褐锈病菌ITS基因序列分析第28-32页
        2.3.2 甘蔗褐锈病菌LAMP扩增引物组筛选第32-33页
        2.3.3 甘蔗褐锈病菌LAMP反应条件及体系优化第33-37页
        2.3.4 甘蔗褐锈病菌LAMP检测引物组特异性分析第37-38页
        2.3.5 三种检测技术的灵敏度效果评价第38-39页
        2.3.6 不同检测技术对甘蔗田间病样的检出频率第39-40页
    2.4 小结与讨论第40-42页
3. 咖啡叶锈病菌的LAMP检测体系建立与优化第42-62页
    3.1 引言第42-43页
    3.2 材料与方法第43-47页
        3.2.1 菌株第43页
        3.2.2 主要试剂及配制第43页
        3.2.3 仪器设备第43-44页
        3.2.4 供试培养基第44页
        3.2.5 咖啡叶锈病菌DNA的大量提取第44页
        3.2.6 其他真菌DNA的提取第44页
        3.2.7 ITS序列重组质粒的构建第44页
        3.2.8 引物设计与合成第44-45页
        3.2.9 LAMP初始反应体系与反应条件第45页
        3.2.10 LAMP反应产物的观察与鉴定第45页
        3.2.11 咖啡叶锈病菌LAMP扩增引物组筛选第45页
        3.2.12 咖啡叶锈病菌LAMP反应条件及体系优化第45-46页
        3.2.13 LAMP检测咖啡叶锈病菌的特异性分析第46页
        3.2.14 灵敏度效果评价第46-47页
        3.2.15 不同检测技术在咖啡田间病样中的应用第47页
    3.3 结果与分析第47-60页
        3.3.1 咖啡叶锈病菌ITS基因序列分析与LAMP引物组设计第47-51页
        3.3.2 咖啡叶锈病菌LAMP扩增引物组筛选第51-52页
        3.3.3 咖啡叶锈病菌LAMP反应条件及体系优化第52-55页
        3.3.4 LAMP检测咖啡叶锈病菌的特异性分析第55-56页
        3.3.5 三种检测技术的灵敏度效果评价第56-57页
        3.3.6 不同检测技术对咖啡田间病样的检出频率第57-60页
    3.4 小结与讨论第60-62页
4. 结论与展望第62-64页
    4.1 主要结论第62页
    4.2 研究展望第62-64页
参考文献第64-71页
附录第71-72页
基金项目资助第72-73页
攻读硕士期间发表的论文与申报的专利第73-74页
致谢第74页

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