橡胶树野生种质SSR标记与表型的关联分析
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 引言 | 第9-22页 |
| 1.1 橡胶树简介 | 第9-10页 |
| 1.1.1 橡胶树起源 | 第9页 |
| 1.1.2 橡胶树的形态及应用 | 第9页 |
| 1.1.3 橡胶树育种现状 | 第9-10页 |
| 1.2 作物育种概念及方法 | 第10-11页 |
| 1.2.1 作物育种的概念 | 第10页 |
| 1.2.2 作物育种的方法及特点 | 第10-11页 |
| 1.3 分子标记辅助育种及在巴西橡胶树中的应用 | 第11-16页 |
| 1.3.1 分子标记概述 | 第11页 |
| 1.3.2 分子标记分类及主要特点 | 第11页 |
| 1.3.3 常用的分子标记技术 | 第11-14页 |
| 1.3.4 分子标记辅助育种及其特点 | 第14页 |
| 1.3.5 分子标记技术在橡胶树上的研究进展 | 第14-16页 |
| 1.4 关联分析方法 | 第16-20页 |
| 1.4.1 关联分析的概念 | 第16页 |
| 1.4.2 关联分析的类型 | 第16页 |
| 1.4.3 关联分析的步骤 | 第16页 |
| 1.4.4 关联分析的优势 | 第16-17页 |
| 1.4.5 关联分析影响因素 | 第17-18页 |
| 1.4.6 LD的度量及描述方法 | 第18页 |
| 1.4.7 关联分析的研究进展 | 第18-20页 |
| 1.5 技术路线 | 第20-21页 |
| 1.6 研究目的及意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第22页 |
| 2.2 实验所用试剂 | 第22-25页 |
| 2.3 实验所用仪器设备 | 第25-26页 |
| 2.4 基因组DNA提取及SSR-PCR扩增 | 第26-27页 |
| 2.4.1 基因组DNA的提取试剂配制 | 第26页 |
| 2.4.2 基因组DNA提取步骤 | 第26-27页 |
| 2.4.3 PCR反应体系及程序 | 第27页 |
| 2.5 SSR-PCR产物检测 | 第27-29页 |
| 2.5.1 聚丙烯酰胺凝胶制备试剂 | 第27页 |
| 2.5.2 聚丙烯凝胶电泳和银染 | 第27-29页 |
| 2.6 实验材料表型性状数据统计 | 第29-30页 |
| 2.7 SSR分子标记数据库构建 | 第30页 |
| 2.7.1 SSR分子标记数据库构建 | 第30页 |
| 2.7.2 遗传多样性分析 | 第30页 |
| 2.8 基于structure的群体结构分析 | 第30页 |
| 2.9 LD分析及Kinship分析 | 第30页 |
| 2.10 关联分析 | 第30-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-48页 |
| 3.1 表型性状调查 | 第32-36页 |
| 3.2 SSR标记检测 | 第36页 |
| 3.2.1 基因组DNA电泳检测结果 | 第36页 |
| 3.2.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果 | 第36页 |
| 3.3 遗传多样性分析 | 第36-42页 |
| 3.4 基于structure的群体结构分析 | 第42-45页 |
| 3.4.1 K值的选择 | 第42-44页 |
| 3.4.2 Q矩阵的获得 | 第44-45页 |
| 3.5 LD分析结果 | 第45-47页 |
| 3.6 SSR标记与表型性状的关联分析 | 第47-48页 |
| 4 讨论 | 第48-51页 |
| 4.1 供试橡胶树野生种质遗传多样性评价 | 第48-49页 |
| 4.1.1 橡胶树种质的遗传多样性 | 第48页 |
| 4.1.2 供试橡胶树表型性状的评价 | 第48-49页 |
| 4.2 供试橡胶树群体的LD水平评价 | 第49页 |
| 4.3 供试橡胶树群体结构评价 | 第49页 |
| 4.4 SSR分子标记与表型的关联分析 | 第49-51页 |
| 5 结论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 附录 | 第57-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
