岩扇贝高通量转录组文库测序和分子标记开发
| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4-5页 |
| 第一章 文献综述 | 第7-12页 |
| 1 岩扇贝及其研究进展 | 第7-9页 |
| 1.1 岩扇贝的分类地位、习性及分布 | 第7页 |
| 1.2 经济品种扇贝的养殖现状及岩扇贝的研究价值 | 第7-9页 |
| 2 高通量转录组测序相关背景介绍 | 第9-10页 |
| 2.1 转录组介绍 | 第9-10页 |
| 2.2 高通量测序技术发展 | 第10页 |
| 3 微卫星标记在贝类遗传分析的应用 | 第10-12页 |
| 3.1 群体遗传学 | 第10-11页 |
| 3.2 亲缘关系鉴定 | 第11-12页 |
| 第二章 岩扇贝高通量转录组测序文库 | 第12-22页 |
| 1 材料与方法 | 第12-14页 |
| 1.1 实验材料 | 第12页 |
| 1.2 RNA提取,建库和测序 | 第12-13页 |
| 1.3 转录组生物信息分析流程 | 第13-14页 |
| 2 结果与讨论 | 第14-22页 |
| 2.1 RNA提取结果 | 第14页 |
| 2.2 岩扇贝转录组测序质量评估和组装数据 | 第14-17页 |
| 2.3 基因功能注释 | 第17-22页 |
| 第三章 岩扇贝微卫星标记开发 | 第22-31页 |
| 1 材料与方法 | 第22-27页 |
| 1.1 实验材料 | 第22页 |
| 1.2 实验试剂及器材 | 第22页 |
| 1.3 岩扇贝DNA提取 | 第22-24页 |
| 1.4 筛选引物 | 第24-25页 |
| 1.5 扩增产物用聚丙烯酰胺凝胶检测的方法 | 第25-26页 |
| 1.6 数据统计与分析 | 第26-27页 |
| 2 结果 | 第27-30页 |
| 2.1 岩扇贝DNA提取结果 | 第27页 |
| 2.2 从岩扇贝转录组文库中筛选微卫星序列 | 第27页 |
| 2.3 微卫星引物多态性检测结果及评估 | 第27-30页 |
| 3 讨论 | 第30-31页 |
| 第四章 岩扇贝在扇贝科中的分类地位 | 第31-38页 |
| 1 材料与方法 | 第31-32页 |
| 1.1 实验材料 | 第31页 |
| 1.2 实验方法 | 第31-32页 |
| 2 结果 | 第32-37页 |
| 2.1 岩扇贝COI和16S的DNA序列组成 | 第32-33页 |
| 2.2 系统发育树的物种鉴定 | 第33-35页 |
| 2.3 岩扇贝中16S基因的密码子偏好性 | 第35-37页 |
| 3 讨论 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-42页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第42-44页 |
| 致谢 | 第44页 |
