基于调控网络的生物功能模块挖掘算法研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-18页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-15页 |
| 1.2.1 生物网络中的模块 | 第13页 |
| 1.2.2 单一网络上的模块挖掘 | 第13-14页 |
| 1.2.3 融合网络上的模块挖掘 | 第14-15页 |
| 1.3 本文主要工作 | 第15-16页 |
| 1.4 本文组织结构 | 第16-18页 |
| 第2章 生物网络上的模块挖掘方法简述 | 第18-25页 |
| 2.1 引言 | 第18页 |
| 2.2 构建生物网络所用数据库 | 第18-20页 |
| 2.3 单一网络上的模块挖掘 | 第20-22页 |
| 2.3.1 蛋白质相互作用网络上的模块挖掘 | 第20-21页 |
| 2.3.2 调控网络上的模块挖掘 | 第21-22页 |
| 2.4 融合网络上的模块挖掘 | 第22-23页 |
| 2.4.1 基因网络及调控网络的融合 | 第22-23页 |
| 2.4.2 共调控网络上的模块挖掘 | 第23页 |
| 2.5 生物网络模块挖掘算法的评价指标 | 第23-24页 |
| 2.6 小结 | 第24-25页 |
| 第3章 MicroRNA调控网络上的随机游走算法 | 第25-39页 |
| 3.1 引言 | 第25页 |
| 3.2 相关定义 | 第25-29页 |
| 3.2.1 基因相互作用网络及调控网络图定义 | 第25-26页 |
| 3.2.2 网络融合 | 第26页 |
| 3.2.3 生物功能模块 | 第26-27页 |
| 3.2.4 图的桥节点 | 第27-29页 |
| 3.3 RWRB算法描述 | 第29-32页 |
| 3.4 实验数据及预处理 | 第32-33页 |
| 3.4.1 实验数据 | 第32页 |
| 3.4.2 数据的预处理 | 第32-33页 |
| 3.5 实验方法与结果分析 | 第33-38页 |
| 3.5.1 实验方法 | 第33-34页 |
| 3.5.2 实验结果与分析 | 第34-38页 |
| 3.6 小结 | 第38-39页 |
| 第4章 共调控网络上的随机游走算法 | 第39-46页 |
| 4.1 引言 | 第39页 |
| 4.2 相关定义 | 第39-40页 |
| 4.2.1 转录因子 | 第39页 |
| 4.2.2 共调控网络 | 第39-40页 |
| 4.3 RWRBC算法描述 | 第40-42页 |
| 4.4 实验数据 | 第42页 |
| 4.5 实验方法与结果分析 | 第42-44页 |
| 4.5.1 实验方法 | 第42页 |
| 4.5.2 实验结果与分析 | 第42-44页 |
| 4.6 小结 | 第44-46页 |
| 结论 | 第46-49页 |
| 一、本文工作总结 | 第46-47页 |
| 二、进一步工作展望 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-56页 |
| 附录 攻读学位期间参加的科研项目 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
