利用“野生小家鼠来源的1号染色体替换系”进行血脂相关QTL定位及候选基因选取
摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-23页 |
1.1 血脂代谢的研究进展 | 第10-13页 |
1.1.1 血脂代谢机制 | 第10-12页 |
1.1.2 血脂代谢相关基因的研究进展 | 第12-13页 |
1.2 小鼠在遗传研究中的应用 | 第13-16页 |
1.2.1 小鼠在血脂代谢遗传研究上的优势 | 第13-14页 |
1.2.2 野生小家鼠来源的染色体替换系 | 第14-16页 |
1.3 二代测序技术和RNA-seq技术 | 第16-20页 |
1.3.1 二代测序技术 | 第16-18页 |
1.3.2 RNA-seq技术 | 第18-20页 |
1.4 研究简介 | 第20-23页 |
1.4.1 前期工作介绍 | 第20页 |
1.4.2 实验原理和技术路线 | 第20-21页 |
1.4.3 研究意义 | 第21-23页 |
第二章 实验材料和方法 | 第23-35页 |
2.1 材料 | 第23-25页 |
2.1.1 实验仪器和试剂 | 第23-25页 |
2.1.2 所用软件和数据库资源 | 第25页 |
2.2 方法 | 第25-35页 |
2.2.1 F2代小鼠群体构建 | 第25-26页 |
2.2.2 取血及血液生化指标测定 | 第26页 |
2.2.3 DNA的提取及Hi-SNP分型 | 第26-30页 |
2.2.4 二代测序数据分析 | 第30-31页 |
2.2.5 QTL定位及区间的缩小 | 第31页 |
2.2.6 肝脏RNA的提取及RNA-seq检测 | 第31-32页 |
2.2.7 RNA-seq数据分析 | 第32-33页 |
2.2.8 侯选基因的选取 | 第33-35页 |
第三章 结果和分析 | 第35-44页 |
3.1 表型分析结果 | 第35-37页 |
3.2 Hi-SNP分型结果 | 第37页 |
3.3 QTL定位结果 | 第37-39页 |
3.3.1 QTL初步定位结果 | 第37-39页 |
3.3.2 QTL区间缩小结果 | 第39页 |
3.4 候选基因的选取 | 第39-44页 |
3.4.1 功能突变基因选取结果 | 第39-41页 |
3.4.2 表达差异基因选取结果 | 第41-42页 |
3.4.3 候选基因进一步筛选结果 | 第42-44页 |
第四章 讨论 | 第44-47页 |
4.1 利用染色体替换系定位QTL的讨论 | 第44页 |
4.2 Hi-SNP分型技术的讨论 | 第44-45页 |
4.3 候选基因的讨论 | 第45-47页 |
第五章 结论与展望 | 第47-48页 |
参考文献 | 第48-53页 |
附录 | 第53-72页 |
课题来源 | 第72-73页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文目录 | 第73-74页 |
致谢 | 第74页 |