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盐胁迫下甜瓜cDNA文库构建及NAC基因的功能分析

英文缩略词表第7-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-12页
第一章 前言综述第17-32页
    1.1 前言第17-18页
    1.2 盐胁迫对植物的伤害第18页
    1.3 植物应对盐胁迫的策略第18-21页
        1.3.1 渗透调节物质的合成与积累第19页
        1.3.2 离子转运与离子平衡第19-20页
        1.3.3 清除自由基类的相关酶第20页
        1.3.4 转录因子调节第20页
        1.3.5 植物激素调节第20-21页
        1.3.6 信号转导第21页
    1.4 植物盐胁迫响应基因的筛选与鉴定第21-25页
        1.4.1 cDNA-AFLP第21-22页
        1.4.2 cDNA 微阵列第22-23页
        1.4.3 抑制差减杂交技术第23-24页
        1.4.4 转录组测序第24-25页
    1.5 植物 NAC 研究第25-30页
        1.5.1 NAC 基因的结构第25-28页
        1.5.2 NAC 基因家族在植物中的分析第28-29页
        1.5.3 NAC 的功能研究进展第29-30页
    1.6 目的意义及研究内容第30-31页
    1.7 实验技术路线第31-32页
第二章 甜瓜盐胁迫下差减文库的构建第32-44页
    2.1 引言第32页
    2.2 材料和方法第32-40页
        2.2.1 材料种植与实验处理第32-33页
        2.2.2 总 RNA 提取及 mRNA 的分离第33-34页
        2.2.3 mRNA 的纯化第34-35页
        2.2.4 第一链 cDNA 的合成第35页
        2.2.5 第二链 cDNA 合成第35-36页
        2.2.6 RsaI 酶切第36页
        2.2.7 接头的连接第36-37页
        2.2.8 第一次杂交第37页
        2.2.9 第二次杂交第37-38页
        2.2.10 二次 PCR 扩增第38-39页
        2.2.11 PCR 产物的 TA 克隆第39页
        2.2.12 差减文库的构建与插入片段检测第39-40页
    2.3 结果与分析第40-42页
        2.3.1 RNA 质量检测及双链 cDNA 酶切效果第40-41页
        2.3.2 差减文库构建第41-42页
        2.3.3 插入片段检测第42页
    2.4 讨论第42-44页
第三章 差减文库 EST 的生物信息学与盐胁迫下的表达分析第44-60页
    3.1 引言第44页
    3.2. 生物信息学分析第44页
    3.3 甜瓜盐胁迫下相关 EST 的表达模式分析第44-48页
        3.3.1 RNA 抽提第44-46页
        3.3.2 cDNA 的合成第46-48页
    3.4 不同品种盐响应基因功能分类与比较第48-49页
    3.5 结果与分析第49-56页
        3.5.0 ESTs 的拼接与组装第49页
        3.5.1 Real time PCR 鉴定甜瓜盐胁迫下 EST 的表达第49-54页
        3.5.2 两个文库 EST 的比对与分析第54-56页
    3.6 讨论第56-60页
第四章 甜瓜转录因子 NAC 基因家族的综合分析第60-87页
    4.1 引言第60-61页
    4.2 材料与方法第61-68页
        4.2.1 NAC 序列数据库检索第61页
        4.2.2 甜瓜 NAC 基因序列比对进化分析、染色体定位与跨膜预测第61-62页
        4.2.3 甜瓜盐胁迫下 cDNA 文库、转录组和拟南芥盐响应 NAC 预测甜瓜盐响应 NAC基因第62页
        4.2.4 甜瓜盐胁迫下 9 个 NAC 基因表达分析第62-63页
        4.2.5 CmNAC34 和 CmNAC14 在酵母中的表达第63-68页
    4.3 结果第68-85页
        4.3.1 甜瓜 NAC 基因的鉴定以及染色体的分布第68-73页
        4.3.2 CmNAC 蛋白结构分析与系统进化树构建第73-77页
        4.3.3 预测甜瓜盐胁迫响应的 NAC 基因第77-79页
        4.3.4 甜瓜盐胁迫下 9 个甜瓜 CmNAC 基因的表达分析第79-80页
        4.3.5 CmNAC34 和 CmNAC14 增强酵母对盐分的敏感性第80-85页
    4.4 讨论第85-87页
        4.4.1 甜瓜 NAC 基因的鉴定与结构分析第85页
        4.4.2 依据进化关系、转录组测序数据库、cDNA 文库预测甜瓜盐响应的 NAC 基因第85-86页
        4.4.3 通过表达模式鉴定 CmNAC 基因是否与盐响应有关第86页
        4.4.4 甜瓜 CmNAC34 和 CmNAC14 基因增加酵母对盐分胁迫的敏感第86-87页
第五章 甜瓜 CmNAC14 的克隆、表达模式及亚细胞定位分析第87-104页
    5.1 前言第87页
    5.2 材料与方法第87-95页
        5.2.1 植物材料第87-88页
        5.2.2 CmNAC14 的 RACE 克隆第88-94页
        5.2.3 QRT-PCR 分析 CmNAC14 的组织表达分析及逆境胁迫下的表达第94-95页
        5.2.4 甜瓜 CmNAC14 基因的亚细胞定位第95页
    5.3 结果与分析第95-102页
        5.3.1 基因克隆 CmNAC14 全长第95-97页
        5.3.2 CmNAC14 的基因生物信息学分析第97-99页
        5.3.3 CmNAC14 的组织表达性差异第99-100页
        5.3.4 不同逆境对 CmNAC14 表达的影响第100-101页
        5.3.5 CmNAC14 在烟草表皮上的定位第101-102页
    5.4 讨论第102-104页
第六章 甜瓜 NAC 在拟南芥中的超量表达和功能分析第104-120页
    6.1 引言第104页
    6.2 材料与方法第104-112页
        6.2.1 植物材料第104页
        6.2.2 植物表达载体构建第104-107页
        6.2.3 拟南芥转化第107-109页
        6.2.4 转基因拟南芥植株的鉴定第109-110页
        6.2.5 转基因拟南芥植株 CmNAC14 基因的表达第110页
        6.2.6 转基因拟南芥逆境胁迫测评第110-111页
        6.2.7 CmNAC14 基因在耐盐性不同的甜瓜品种中的表达差异第111-112页
    6.3 结果与分析第112-117页
        6.3.1 CmNAC14-PHB 表达载体的鉴定第112-113页
        6.3.2 转 CmNAC14 基因拟南芥的基因检测与表达检测第113-114页
        6.3.3 转 CmNAC14 基因对拟南芥在逆境下表型、生化指标及基因表达的影响第114-117页
        6.3.4 盐胁迫下 CmNAC14 基因在不同耐盐性甜瓜品种表达分析第117页
    6.4 讨论第117-120页
第七章 总结与展望第120-123页
    7.1 研究总结第120-121页
    7.2 创新之处第121页
    7.3 展望第121-123页
攻读博士学位期间完成的科研论文与专利第123-124页
参考文献第124-132页
致谢第132-133页

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