摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
前言 | 第12-14页 |
第一章 文献综述 | 第14-24页 |
1 单核苷酸多态性研究 | 第14-17页 |
1.1 单核苷酸多态性的发生和特点 | 第14-15页 |
1.1.1 单核苷酸多态性的发生 | 第14-15页 |
1.1.2 单核苷酸多态性的特点 | 第15页 |
1.2 单核苷酸多态性的检测方法 | 第15-16页 |
1.2.1 直接测序法 | 第15页 |
1.2.2 以构象为基础的检测法 | 第15-16页 |
1.2.3 基于PCR、酶切的检测法 | 第16页 |
1.2.4 基于杂交的检测方法 | 第16页 |
1.3 单核苷酸多态性在水产动物遗传育种研究中的应用 | 第16-17页 |
2 DNA甲基化研究 | 第17-21页 |
2.1 DNA甲基化与基因的表达调控 | 第17-18页 |
2.1.1 DNA甲基化修饰 | 第17-18页 |
2.1.2 DNA甲基化表达调控机制 | 第18页 |
2.2 甲基化研究方法学 | 第18-19页 |
2.3 DNA甲基化在鱼类中的研究进展 | 第19-20页 |
2.3.1 DNA甲基化在胚胎发育中的作用 | 第19页 |
2.3.2 影响DNA甲基化模式的因素 | 第19-20页 |
2.4 DNA甲基化与分子标记 | 第20-21页 |
3 鱼类GH/IGF-I轴相关基因SNP和DNA甲基化研究 | 第21-23页 |
3.1 鱼类GHR基因SNP和DNA甲基化研究进展 | 第21-22页 |
3.2 鱼类GH基因SNP研究进展 | 第22页 |
3.3 鱼类GH基因启动子SNP研究进展 | 第22-23页 |
4 本研究的立项依据与研究意义 | 第23-24页 |
第二章 雄性半滑舌鳎GHR基因多态性及与生长性状相关性分析 | 第24-34页 |
1 材料和方法 | 第24-28页 |
1.1 主要实验试剂 | 第24-25页 |
1.2 实验鱼和数据获取 | 第25页 |
1.3 血浆中激素含量的测定 | 第25-26页 |
1.4 基因组DNA的提取 | 第26页 |
1.5 PCR-SSCP检测 | 第26页 |
1.6 数据分析 | 第26-28页 |
2 结果 | 第28-32页 |
2.1 基因组DNA提取结果 | 第28页 |
2.2 GHR基因外显子的多态性 | 第28-30页 |
2.2.1 GHR外显子的PCR扩增结果 | 第28-29页 |
2.2.2 SSCP、硝酸银染色及测序结果 | 第29-30页 |
2.3 两个SNP位点与所测性状的相关性分析 | 第30-32页 |
3 讨论 | 第32-33页 |
4 小结 | 第33-34页 |
第三章 雄性半滑舌鳎GHR基因突变位点的甲基化水平及基因表达水平分析 | 第34-45页 |
1 材料和方法 | 第34-37页 |
1.1 实验鱼 | 第34页 |
1.2 基因组DNA提取 | 第34-35页 |
1.3 基因组DNA的亚硫酸转化 | 第35-36页 |
1.4 甲基化特异性PCR | 第36页 |
1.5 RNA提取、反转录聚合酶链式反应(RT-PCR) | 第36-37页 |
1.6 实时定量PCR | 第37页 |
2 结果 | 第37-42页 |
2.1 基因组DNA提取结果 | 第37-38页 |
2.2 DNA甲基化水平 | 第38-40页 |
2.2.1 特异性甲基化PCR扩增结果 | 第38页 |
2.2.2 L1三种基因型扩增产物测序结果 | 第38-39页 |
2.2.3 L1三种基因型甲基化比率 | 第39-40页 |
2.3 GHR基因表达水平 | 第40-42页 |
2.3.1 目的基因(GHR)与内参基因(β-actin)的扩增效率 | 第40-41页 |
2.3.2 标准曲线 | 第41-42页 |
2.3.3 L1位点与肝脏中GHR基因表达的相关性分析 | 第42页 |
3 讨论 | 第42-44页 |
4 小结 | 第44-45页 |
第四章 雄性半滑舌鳎GH基因的编码区及其启动子多态性及与生长性状相关性分析 | 第45-56页 |
1 材料和方法 | 第46-47页 |
1.1 主要实验试剂 | 第46页 |
1.2 实验鱼和数据获取 | 第46页 |
1.3 血浆中激素含量的测定 | 第46页 |
1.4 PCR-SSCP检测 | 第46-47页 |
1.5 数据分析 | 第47页 |
1.6 蛋白质结构预测 | 第47页 |
1.7 转录因子预测 | 第47页 |
2 结果 | 第47-54页 |
2.1 GH基因外显子及其启动子区域的多态性 | 第47-51页 |
2.1.1 PCR扩增结果 | 第47-49页 |
2.1.2 SSCP、硝酸银染色及测序结果 | 第49-51页 |
2.2 SNP位点与所测性状的相关性分析 | 第51-52页 |
2.3 突变前后蛋白质结构 | 第52-53页 |
2.4 转录因子预测结果 | 第53-54页 |
3 讨论 | 第54-55页 |
4 小结 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-64页 |
附录 | 第64-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
个人简历 | 第66页 |
发表的学术论文 | 第66-67页 |