| 目录 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-35页 |
| §1.1 研究背景 | 第9-11页 |
| §1.1.1 研究意义 | 第9-11页 |
| §1.1.2 研究现状 | 第11页 |
| §1.2 蛋白质简介 | 第11-22页 |
| §1.2.1 蛋白质的结构 | 第11-18页 |
| §1.2.2 蛋白质的性质 | 第18-20页 |
| §1.2.3 蛋白质的功能 | 第20-22页 |
| §1.3 碳纳米管简介 | 第22-26页 |
| §1.3.1 碳纳米管的结构 | 第22-24页 |
| §1.3.2 碳纳米管的性质 | 第24-25页 |
| §1.3.3 碳纳米管的生物功能 | 第25-26页 |
| §1.4 蛋白质和碳纳米管相互作用 | 第26-31页 |
| §1.4.1 实验方面的研究 | 第26-27页 |
| §1.4.2 理论方面的研究 | 第27-31页 |
| 参考文献 | 第31-35页 |
| 第二章 分子动力学与系综理论 | 第35-53页 |
| §2.1 分子动力学方法 | 第35-46页 |
| §2.1.1 经典多粒子系统内部的相互作用 | 第35-39页 |
| §2.1.2 经典多粒子系统与外界的相互作用 | 第39-41页 |
| §2.1.3 经典力学的描述 | 第41-42页 |
| §2.1.4 分子动力学模拟的步骤 | 第42-44页 |
| §2.1.5 常用力场介绍 | 第44页 |
| §2.1.6 分子动力学的元胞和周期性边界 | 第44-46页 |
| §2.2 系综理论 | 第46-52页 |
| §2.2.1 系综定义 | 第46-47页 |
| §2.2.2 相空间 刘维尔定理 | 第47-49页 |
| §2.2.3 微正则系综、正则系综和巨正则系综 | 第49-52页 |
| 参考文献 | 第52-53页 |
| 第三章 碳纳米管诱导下Aβ25-35低聚体形成的β桶结构 | 第53-77页 |
| §3.1 引言 | 第53-54页 |
| §3.2 理论模型和方法 | 第54-56页 |
| §3.2.1 模型 | 第54-55页 |
| §3.2.2 模拟参数 | 第55-56页 |
| §3.3 结果和讨论 | 第56-69页 |
| §3.3.1 数据分析 | 第56-57页 |
| §3.3.2 碳管表面的两个β平行折叠的四聚体 | 第57-58页 |
| §3.3.3 碳管表面的两个β反平行/平行混合折叠的四聚体 | 第58-64页 |
| §3.3.4 碳管表面的两个β折叠五聚体 | 第64-69页 |
| §3.4 结论 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-77页 |
| 第四章 刚性蛋白质及刚性纳米颗粒自组装的热力学机理研究 | 第77-93页 |
| §4.1 引言 | 第77-78页 |
| §4.2 模型和方法 | 第78-80页 |
| §4.3 计算过程 | 第80-83页 |
| §4.4 分析与讨论 | 第83-88页 |
| §4.4.1 水分子间相互作用对自组装行为的影响 | 第83-84页 |
| §4.4.2 大分子的亲水性对自组装行为的影响 | 第84-85页 |
| §4.4.3 水分子间相互作用驱使的自组装 | 第85-86页 |
| §4.4.4 解离-组装两相的相图 | 第86-88页 |
| §4.5 结论 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-93页 |
| 第五章 碳纳米管中的受限水在外场下的相变行为 | 第93-107页 |
| §5.1 引言 | 第93-94页 |
| §5.2 计算细节 | 第94-95页 |
| §5.3 结果与讨论 | 第95-102页 |
| §5.3.1 受限水随温度和电场变化时的相变行为 | 第95-97页 |
| §5.3.2 相变过程中水分子的物理特性分析 | 第97-99页 |
| §5.3.3 电场在受限水相变行为中的驱使作用 | 第99-101页 |
| §5.3.4 关于电场和温度的E-T相图 | 第101-102页 |
| §5.4 结论 | 第102-104页 |
| 参考文献 | 第104-107页 |
| 第六章 总结与展望 | 第107-109页 |
| 论文列表及其它 | 第109-111页 |
| 致谢 | 第111-112页 |
