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DNA序列比对结果的存储与压缩

摘要第5-6页
Abstract第6页
第一章 绪论第7-13页
    1.1. 选题背景和意义第7-9页
        1.1.1. 生物信息学第7-8页
        1.1.2. DNA序列数据的管理第8-9页
        1.1.3. DNA序列比对第9页
    1.2. 项目背景第9-11页
    1.3. 论文研究内容第11页
    1.4. 本文组织结构第11-13页
第二章 基本知识与相关术语第13-18页
    2.1. DNA第13-14页
        2.1.1. DNA概念第13-14页
        2.1.2. DNA序列数据特性第14页
    2.2. 基本术语第14-15页
    2.3. DNA序列比对第15-18页
        2.3.1. 比对的概念第15页
        2.3.2. 比对工具第15-16页
        2.3.3. 比对结果的存储格式第16-18页
第三章 相关研究与产品第18-22页
    3.1. DNA序列压缩算法第18-19页
        3.1.1. 压缩算法概述第18页
        3.1.2. 压缩算法分类第18-19页
        3.1.3. 典型压缩算法第19页
    3.2. 相关产品第19-22页
        3.2.1. SAMtools的概况第19页
        3.2.2. SAMTools的典型命令第19-22页
第四章 功能模块解析第22-43页
    4.1. 软件体系结构第22页
    4.2. 文件输入模块第22-23页
    4.3. 基于位点的存储模块第23-30页
        4.3.1. 存储的基本思想第23-25页
        4.3.2. Read重编码第25-28页
        4.3.3. 表头索引机制第28-30页
    4.4. 区间合并压缩模块第30-37页
        4.4.1. 区间合并的主要思路第30-31页
        4.4.2. 确定ACGT顺序的种类第31页
        4.4.3. 压缩过程第31-32页
        4.4.4. 目标文件格式第32-34页
        4.4.5. 压缩后的随机访问第34-35页
        4.4.6. 存储空间对比第35-37页
    4.5. 字母长度压缩模块第37-41页
        4.5.1. 字母长度压缩的主要思路第37页
        4.5.2. 字母长度压缩的优点第37-38页
        4.5.3. 压缩过程第38页
        4.5.4. 目标文件格式第38-39页
        4.5.5. 压缩后的随机访问第39-40页
        4.5.6. 存储空间对比第40-41页
    4.6. 存储结果显示模块第41-43页
第五章 软件操作方式及实验结果介绍第43-51页
    5.1. 软件运行环境第43-44页
        5.1.1. 介绍第43-44页
        5.1.2. 安装配置第44页
    5.2. 界面介绍第44-51页
        5.2.1. 文件输入第44-46页
        5.2.2. 基于位点的存储第46-48页
        5.2.3. 压缩第48-49页
        5.2.4. 存储结果第49-51页
第六章 结束语第51-53页
    6.1. 总结第51页
    6.2. 展望第51-53页
参考文献第53-57页
致谢第57-58页

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