| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-29页 |
| 1.1 面粉及其制品颜色性状的影响因素 | 第13-14页 |
| 1.1.1 色素含量 | 第13页 |
| 1.1.2 氧化还原酶 | 第13-14页 |
| 1.1.3 其他因素 | 第14页 |
| 1.2 黄色素 | 第14-18页 |
| 1.2.1 黄色素的遗传特性 | 第14页 |
| 1.2.2 类胡萝卜素生物合成途径 | 第14-17页 |
| 1.2.3 小麦类胡萝卜素合成途径基因克隆及功能标记开发 | 第17-18页 |
| 1.3 QTL定位 | 第18-19页 |
| 1.3.1 QTL定位原理 | 第18页 |
| 1.3.2 QTL定位策略 | 第18页 |
| 1.3.3 QTL作图群体 | 第18页 |
| 1.3.4 分子标记 | 第18-19页 |
| 1.3.5 QTL定位方法 | 第19页 |
| 1.4 关联分析 | 第19-22页 |
| 1.4.1 关联分析概念 | 第19-20页 |
| 1.4.2 关联分析步骤 | 第20-21页 |
| 1.4.3 关联分析的影响因素 | 第21页 |
| 1.4.4 全基因组关联分析在植物中应用 | 第21-22页 |
| 1.4.5 连锁分析与关联分析 | 第22页 |
| 1.5 基因功能研究 | 第22-27页 |
| 1.5.1 基因功能研究方法及其优缺点 | 第22-23页 |
| 1.5.2 RNAi技术 | 第23-24页 |
| 1.5.3 TILLING技术 | 第24-27页 |
| 1.6 转录组测序 | 第27页 |
| 1.6.1 转录组的概念 | 第27页 |
| 1.6.2 基于高通量测序技术的转录组测序 | 第27页 |
| 1.7 本研究目的和意义 | 第27-28页 |
| 1.8 技术路线 | 第28-29页 |
| 第二章 面粉颜色相关性状QTL定位 | 第29-59页 |
| 2.1 实验材料 | 第29页 |
| 2.2 实验方法 | 第29-32页 |
| 2.2.1 表型测定 | 第29-30页 |
| 2.2.2 基因型检测 | 第30-31页 |
| 2.2.3 遗传图谱构建及QTL定位 | 第31页 |
| 2.2.4 候选基因挖掘 | 第31页 |
| 2.2.5 统计分析 | 第31-32页 |
| 2.3 结果分析 | 第32-55页 |
| 2.3.1 面粉颜色性状表型分析 | 第32-35页 |
| 2.3.2 遗传图谱构建 | 第35-37页 |
| 2.3.3 面粉颜色性状QTL分析 | 第37-52页 |
| 2.3.4 面粉颜色性状的QTL簇 | 第52页 |
| 2.3.5 候选基因发掘 | 第52-55页 |
| 2.4 讨论 | 第55-59页 |
| 2.4.1 基于SNP标记的QTL定位 | 第55-56页 |
| 2.4.2 与前人研究相比较 | 第56页 |
| 2.4.3 面粉颜色性状候选基因 | 第56-59页 |
| 第三章 面粉颜色相关性状全基因组关联分析 | 第59-77页 |
| 3.1 实验材料 | 第59页 |
| 3.2 实验方法 | 第59-60页 |
| 3.2.1 表型测定 | 第59页 |
| 3.2.2 统计分析 | 第59页 |
| 3.2.3 基因型检测 | 第59-60页 |
| 3.2.4 全基因组关联分析 | 第60页 |
| 3.2.5 候选基因挖掘 | 第60页 |
| 3.3 结果分析 | 第60-75页 |
| 3.3.1 面粉颜色相关性状表型分析 | 第60-63页 |
| 3.3.2 群体结构分析 | 第63-64页 |
| 3.3.3 面粉颜色相关性状全基因组关联分析 | 第64-73页 |
| 3.3.4 与面粉颜色多个性状相关联的SNP标记 | 第73-74页 |
| 3.3.5 候选基因分析 | 第74页 |
| 3.3.6 面粉颜色相关基因关联分析 | 第74-75页 |
| 3.4 讨论 | 第75-77页 |
| 3.4.1 高效率的QTL定位 | 第75页 |
| 3.4.2 候选基因 | 第75页 |
| 3.4.3 连锁分析与关联分析比较 | 第75-77页 |
| 第四章 Psy1功能分析 | 第77-99页 |
| 4.1 实验材料 | 第77-78页 |
| 4.2 实验方法 | 第78-83页 |
| 4.2.1 RNAi转基因植株鉴定 | 第78页 |
| 4.2.2 Psy1基因表达量测定 | 第78页 |
| 4.2.3 籽粒黄色素含量测定 | 第78-79页 |
| 4.2.4 转录组测序与分析 | 第79-80页 |
| 4.2.5 EMS突变体筛选 | 第80-81页 |
| 4.2.6 突变位点功能分析 | 第81-82页 |
| 4.2.7 PSY1功能结构域和三级结构预测 | 第82页 |
| 4.2.8 可变剪接 | 第82-83页 |
| 4.2.9 统计分析 | 第83页 |
| 4.3 结果与分析 | 第83-95页 |
| 4.3.1 RNAi转基因植株基因表达及籽粒黄色素含量分析 | 第83-84页 |
| 4.3.2 Psy1基因表达下调对转录组影响 | 第84-89页 |
| 4.3.3 EMS突变体筛选 | 第89页 |
| 4.3.4 突变位点功能分析 | 第89-93页 |
| 4.3.5 PSY1功能结构域及三级结构预测 | 第93-95页 |
| 4.4 讨论 | 第95-99页 |
| 4.4.1 Psy1功能验证及遗传调控 | 第95页 |
| 4.4.2 Psy1基因解析 | 第95-96页 |
| 4.4.3 选择性剪接 | 第96-97页 |
| 4.4.4 分子育种 | 第97-99页 |
| 第五章 全文结论 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-113页 |
| 致谢 | 第113-115页 |
| 附录 | 第115-129页 |
| 作者简介 | 第129页 |