| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 符号和缩略语说明 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-29页 |
| 1. 木质纤维素 | 第11-16页 |
| 1.1 木质纤维素资源 | 第11-12页 |
| 1.2 木质纤维素结构 | 第12-16页 |
| 2. 木质纤维素降解微生物 | 第16-18页 |
| 2.1 纤维素降解微生物 | 第17页 |
| 2.2 半纤维素和木质素降解微生物 | 第17-18页 |
| 3. 木质纤维素酶及作用机制 | 第18-21页 |
| 3.1 纤维素降解酶及作用机制 | 第18-20页 |
| 3.2 半纤维素降解酶及作用机理 | 第20页 |
| 3.3 木质素降解酶及作用机理 | 第20-21页 |
| 4. 细菌基因组的测序技术 | 第21-27页 |
| 4.1 一代测序技术 | 第21-22页 |
| 4.2 高通量测序技术(Next Generation Sequencing,NGS) | 第22-23页 |
| 4.3 三代测序技术(单分子测序) | 第23-24页 |
| 4.4 高通量测序的基因组学应用 | 第24-27页 |
| 5. 假黄单胞菌属基因组研究现状 | 第27-29页 |
| 第二章 纤维素降解菌的分离、筛选和菌株鉴定 | 第29-39页 |
| 1.前言 | 第29页 |
| 2. 材料与方法 | 第29-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第29-30页 |
| 2.2 纤维素降解菌株的分离和纯化 | 第30-31页 |
| 2.3 纤维素降解菌菌株的鉴定 | 第31-33页 |
| 3. 结果与分析 | 第33-36页 |
| 3.1 纤维素降解菌株的分离和纯化 | 第33-34页 |
| 3.2 纤维素降解菌株的鉴定 | 第34-36页 |
| 4. 讨论 | 第36-37页 |
| 5. 本章小结 | 第37-39页 |
| 第三章 纤维素酶活力测定及产酶条件初步优化 | 第39-51页 |
| 1. 前言 | 第39页 |
| 2. 材料与方法 | 第39-43页 |
| 2.1 实验材料 | 第39-40页 |
| 2.2 标准曲线的制作 | 第40-41页 |
| 2.3 接种液的制备 | 第41页 |
| 2.4 粗酶液制备 | 第41页 |
| 2.5 纤维素酶活力测定[122-124] | 第41-42页 |
| 2.6 菌株J1的产酶条件初步优化 | 第42-43页 |
| 3. 结果与分析 | 第43-48页 |
| 3.1 标准曲线的绘制 | 第43-44页 |
| 3.2 细菌纤维素相关酶活力测定 | 第44-45页 |
| 3.3 菌株J1的内切纤维素酶产酶优化 | 第45-48页 |
| 4. 讨论 | 第48-49页 |
| 5. 本章小结 | 第49-51页 |
| 第四章 纤维素降解菌的全基因组测序及分析 | 第51-69页 |
| 1. 前言 | 第51页 |
| 2. 材料与方法 | 第51-55页 |
| 2.1 实验材料 | 第51-52页 |
| 2.2 gDNA的提取和含量测定 | 第52-53页 |
| 2.3 构建测序文库 | 第53-54页 |
| 2.4 细菌基因组草图的拼接和补空缺 | 第54页 |
| 2.5 细菌基因组完成图的注释 | 第54页 |
| 2.6 细菌基因组完成图基本分析 | 第54-55页 |
| 2.7 细菌基因组完成图的进化和比较基因组分析 | 第55页 |
| 2.8 细菌基因组完成图的木质纤维素降解相关分析 | 第55页 |
| 3. 结果与分析 | 第55-66页 |
| 3.1 菌株J1的全基因组测序 | 第55-56页 |
| 3.2 菌株J1的全基因组注释 | 第56-57页 |
| 3.3 菌株J1的进化分析 | 第57-58页 |
| 3.4 假黄单胞菌基因组比较分析 | 第58-63页 |
| 3.5 菌株J1的木质素酶基因预测 | 第63-64页 |
| 3.6 菌株J1的纤维素降解代谢通路 | 第64-66页 |
| 4. 讨论 | 第66-67页 |
| 5. 本章小结 | 第67-69页 |
| 全文总结 | 第69-71页 |
| 本文创新之处 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-81页 |
| 附录 | 第81-85页 |
| 致谢 | 第85页 |