棉花盐胁迫响应SNP发掘和分析
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第11-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-20页 |
| 1.1 棉花耐盐研究的意义 | 第12页 |
| 1.1.1 盐胁迫的危害 | 第12页 |
| 1.1.2 棉花的重要性 | 第12页 |
| 1.2 植物耐盐机理研究 | 第12-15页 |
| 1.2.1 信号转导机制 | 第12-13页 |
| 1.2.2 离子运输和渗透调节机制 | 第13-14页 |
| 1.2.3 耐盐与表观遗传修饰 | 第14页 |
| 1.2.4 耐盐相关基因 | 第14-15页 |
| 1.3 棉花耐盐研究进展 | 第15-16页 |
| 1.4 SNP研究进展 | 第16-19页 |
| 1.4.1 SNP及其功能 | 第16-17页 |
| 1.4.2 与植物抗逆相关的SNP | 第17-18页 |
| 1.4.3 SNP的检测方法 | 第18页 |
| 1.4.4 基因芯片技术 | 第18-19页 |
| 1.5 立题依据和技术路线 | 第19-20页 |
| 第二章 材料和方法 | 第20-24页 |
| 2.1 SNP检测 | 第20-22页 |
| 2.1.1 供试材料和处理 | 第20-21页 |
| 2.1.2 DNA提取和质量检测 | 第21页 |
| 2.1.3 SNP芯片检测和分型 | 第21-22页 |
| 2.2 转录组测序 | 第22页 |
| 2.3 数据分析 | 第22-24页 |
| 2.3.1 SNPv与耐盐候选SNP筛选 | 第22页 |
| 2.3.2 差异表达基因筛选 | 第22页 |
| 2.3.3 耐盐相关SNP筛选与分析 | 第22-23页 |
| 2.3.4 分析软件及网站 | 第23-24页 |
| 第三章 结果与分析 | 第24-39页 |
| 3.1 DNA质量检测 | 第24页 |
| 3.2 SNPV与耐盐相关候选SNP筛选 | 第24页 |
| 3.3 SNPV分析 | 第24-31页 |
| 3.3.1 不同材料的SNPv数目比较 | 第24-26页 |
| 3.3.2 不同材料SNPv位点分布 | 第26页 |
| 3.3.3 SNPv类型统计 | 第26-27页 |
| 3.3.4 SNPv所在基因功能分析 | 第27-28页 |
| 3.3.5 SNPv位点富集区与甲基化 | 第28-31页 |
| 3.4 耐盐相关SNP筛选 | 第31-39页 |
| 3.4.1 转录组测序结果 | 第31-32页 |
| 3.4.2 差异表达基因筛选和分析 | 第32-34页 |
| 3.4.3 耐盐相关SNP筛选和分析 | 第34-39页 |
| 第四章 讨论 | 第39-42页 |
| 4.1 ROS可能是SNPV产生的原因 | 第39页 |
| 4.2 SNPV可能与甲基化有关 | 第39页 |
| 4.3 耐盐相关SNP的筛选 | 第39-40页 |
| 4.4 耐盐相关SNP可能是对SNPV选择的结果 | 第40-42页 |
| 第五章 全文总结 | 第42-43页 |
| 5.1 SNPV的发掘和分析 | 第42页 |
| 5.2 耐盐相关SNP的筛选 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 作者简历 | 第53页 |
