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细菌来源的α-葡糖苷酶HaG的三维立体结构解析及催化反应机理分析

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第14-30页
    1.1 α-葡糖苷酶的研究现状第14-17页
        1.1.1 α-葡糖苷酶的定义与来源第14页
        1.1.2 α-葡糖苷酶的分类第14-15页
        1.1.3 α-葡糖苷酶的催化原理第15-17页
    1.2 α-葡糖苷酶在生产中的重要应用第17-18页
        1.2.1 工业生产低聚异麦芽糖第17页
        1.2.2 嗜热 α-葡糖苷酶在酒精生产中的应用第17页
        1.2.3 催化合成糖基化产物第17-18页
        1.2.4 α-葡糖苷酶抑制剂治疗糖尿病第18页
    1.3 α-葡糖苷酶HaG的研究背景第18-21页
    1.4 研究生物大分子的最重要方法——蛋白质单晶X射线衍射第21-26页
        1.4.1 结构生物学的研究方法第21-23页
        1.4.2 单晶XRD解析蛋白质立体结构第23-26页
        1.4.3 蛋白质结晶学的重要意义第26页
    1.5 本论文的研究背景和研究内容第26-30页
        1.5.1 研究背景第26-29页
        1.5.2 主要研究内容第29页
        1.5.3 研究意义第29-30页
第二章 α-葡糖苷酶 HaG 的体外表达及其分离纯化第30-47页
    2.1 引言第30-31页
    2.2 实验仪器及材料第31-32页
        2.2.1 仪器设备第31页
        2.2.2 主要实验材料与试剂第31-32页
    2.3 实验方法第32-38页
        2.3.1 HaG的异源表达载体的构建第32-33页
        2.3.2 HaG重组蛋白的诱导表达与大量制备第33-35页
        2.3.3 渗透休克法提取周质蛋白第35-36页
        2.3.4 阴离子交换柱层析分离重组蛋白第36-37页
        2.3.5 分子排阻色谱纯化重组蛋白第37-38页
        2.3.6 高纯度重组蛋白的透析第38页
    2.4 结果与讨论第38-46页
        2.4.1 HaG的蛋白质序列分析第38-40页
        2.4.2 HaG重组蛋白诱导表达检验第40-42页
        2.4.3 HaG重组蛋白的分离纯化第42-46页
    2.5 本章小结第46-47页
第三章 葡糖苷酶HaG的蛋白质单晶制备研究第47-56页
    3.1 引言第47页
    3.2 实验仪器及材料第47-48页
        3.2.1 仪器设备第47-48页
        3.2.2 主要实验材料与试剂第48页
    3.3 实验方法第48-50页
        3.3.1 结晶前蛋白质样品的准备第48-49页
        3.3.2 HaG蛋白质结晶条件初筛第49页
        3.3.3 In-house X射线衍射初步鉴定第49-50页
        3.3.4 HaG蛋白质结晶条件的优化与高质量晶体的制备第50页
    3.4 结果与讨论第50-55页
        3.4.1 结晶初筛结果第50-52页
        3.4.2 X射线衍射初步鉴定第52-54页
        3.4.3 HaG蛋白质结晶条件的优化结果与单晶鉴定第54-55页
    3.5 本章小结第55-56页
第四章 野生型 HaG 晶体的衍射数据采集和结构解析第56-75页
    4.1 引言第56-57页
    4.2 实验仪器及材料第57-58页
        4.2.1 仪器设备第57页
        4.2.2 主要实验材料与试剂第57-58页
    4.3 实验方法第58-63页
        4.3.1 蛋白晶体的冻结第58-59页
        4.3.2 HaG蛋白晶体X射线衍射的数据采集第59-60页
        4.3.3 HaG蛋白质晶体数据处理第60-61页
        4.3.4 分子置换法确定HaG蛋白质结构的相位第61-62页
        4.3.5 HaG蛋白质结构的优化第62页
        4.3.6 HaG蛋白质结构的分析与图片绘制第62-63页
    4.4 结果与讨论第63-74页
        4.4.1 HaG蛋白质晶体的数据采集第63-64页
        4.4.2 HaG蛋白分子结构解析过程第64-68页
        4.4.3 野生型HaG蛋白质的立体结构分析第68-74页
    4.5 本章小结第74-75页
第五章 α-葡糖苷酶突变体建构、表达及其复合体晶体制备与结构解析第75-96页
    5.1 引言第75-76页
    5.2 实验仪器及材料第76-77页
        5.2.1 仪器设备第76页
        5.2.2 主要实验材料与试剂第76-77页
    5.3 实验方法第77-81页
        5.3.1 活性缺失突变体的制备第77-78页
        5.3.2 复合体晶体筛选与制备第78-79页
        5.3.3 HaG及其突变体的复合体晶体的数据采集及处理第79-80页
        5.3.4 HaG及其突变体的复合体结构解析第80-81页
        5.3.5 圆二色谱测定突变体二级结构的无序程度第81页
    5.4 结果与讨论第81-94页
        5.4.1 复合体晶体的制备第81-82页
        5.4.2 复合体晶体的结构解析第82-85页
        5.4.3 复合体立体结构分析第85-94页
    5.5 本章小结第94-96页
第六章 HaG 的底物特异性和催化机理的分子机制第96-112页
    6.1 引言第96页
    6.2 实验仪器及材料第96-97页
        6.2.1 仪器设备第96页
        6.2.2 主要实验材料与试剂第96-97页
    6.3 实验方法第97-100页
        6.3.1 HaG片段缺失突变体的制备第97-98页
        6.3.2 HaG片段缺失突变体(HaG-LD)的酶活测定第98-99页
        6.3.3 HaG复合体与其他糖苷水解酶的结构对比第99-100页
    6.4 结果与讨论第100-110页
        6.4.1 HaG片段缺失突变体的制备过程第100-102页
        6.4.2 HaG片段缺失突变体的酶学性质分析第102-104页
        6.4.3 HaG底物特异性的结构学分析第104-108页
        6.4.4 α-葡糖苷酶HaG催化反应机理分析第108-110页
    6.5 本章小结第110-112页
结论与展望第112-116页
参考文献第116-126页
攻读博士学位期间取得的研究成果第126-127页
致谢第127-128页
附件第128页

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