香菇栽培菌株重要农艺性状与分子标记的关联分析
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-19页 |
| 1.1 香菇概况 | 第11-14页 |
| 1.1.1 香菇生物学特性 | 第11页 |
| 1.1.2 香菇营养价值与保健功能 | 第11-12页 |
| 1.1.3 香菇风味物质 | 第12页 |
| 1.1.4 香菇栽培技术 | 第12-13页 |
| 1.1.5 香菇育种研究 | 第13-14页 |
| 1.2 关联分析 | 第14-18页 |
| 1.2.1 关联分析概述 | 第14-15页 |
| 1.2.2 关联分析的基础 | 第15-16页 |
| 1.2.3 关联分析方法与策略 | 第16页 |
| 1.2.4 关联分析在真菌中的应用 | 第16-18页 |
| 1.3 课题研究目的与意义及技术路线 | 第18-19页 |
| 1.3.1 研究目的与意义 | 第18页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-29页 |
| 2.1 实验材料 | 第19-22页 |
| 2.1.1 关联分析群体 | 第19-21页 |
| 2.1.2 供试培养基 | 第21-22页 |
| 2.2 农艺性状测定 | 第22-23页 |
| 2.2.1 菌丝体性状测定 | 第22页 |
| 2.2.2 子实体性状测定 | 第22-23页 |
| 2.3 基因型分型 | 第23-26页 |
| 2.3.1 香菇菌丝体DNA提取与检测 | 第23-25页 |
| 2.3.2 分子标记的筛选与扩增 | 第25页 |
| 2.3.3 PAGE电泳和银染检测 | 第25-26页 |
| 2.4 数据分析 | 第26-29页 |
| 2.4.1 农艺性状统计分析 | 第26页 |
| 2.4.2 遗传多样性分析 | 第26-27页 |
| 2.4.3 群体结构分析 | 第27页 |
| 2.4.4 亲缘关系分析 | 第27-28页 |
| 2.4.5 连锁不平衡分析 | 第28页 |
| 2.4.6 关联分析 | 第28页 |
| 2.4.7 优异位点及优异等位变异 | 第28-29页 |
| 3 结果与分析 | 第29-56页 |
| 3.1 农艺性状表型特征分析 | 第29-32页 |
| 3.2 简单相关和偏相关分析 | 第32-36页 |
| 3.3 关联群体内的群体结构 | 第36-39页 |
| 3.4 菌株间的亲缘关系 | 第39页 |
| 3.5 关联群体的遗传多样性 | 第39-41页 |
| 3.6 标记位点间的连锁不平衡及其衰减 | 第41页 |
| 3.7 香菇重要农艺性状的关联分析 | 第41-47页 |
| 3.7.1 生育期性状 | 第43-44页 |
| 3.7.2 子实体形态特征性状 | 第44-46页 |
| 3.7.3 产量性状 | 第46-47页 |
| 3.8 优异等位变异 | 第47-56页 |
| 3.8.1 生育期性状 | 第48-50页 |
| 3.8.2 子实体形态特征性状 | 第50-53页 |
| 3.8.3 产量性状 | 第53-56页 |
| 4 讨论 | 第56-64页 |
| 4.1 香菇栽培菌株农艺性状分析 | 第56-57页 |
| 4.2 香菇栽培菌株的遗传多样性 | 第57页 |
| 4.3 香菇栽培菌株的连锁不平衡 | 第57-58页 |
| 4.4 香菇栽培菌株的群体结构 | 第58页 |
| 4.5 与香菇农艺性状相关联的标记位点 | 第58-60页 |
| 4.6 影响香菇农艺性状的候选基因 | 第60-64页 |
| 参考文献 | 第64-70页 |
| 附录1 引物列表 | 第70-74页 |
| 附录2 位于关联位点上下游2kb区段内的基因 | 第74-79页 |
| 附录3 常用试剂配方 | 第79-80页 |
| 附录4 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第80-81页 |
| 致谢 | 第81页 |
