| 中文摘要 | 第7-8页 |
| ABSTRACT | 第8页 |
| 缩略语 | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第11-22页 |
| 1.1 D-木糖的在微生物体内的代谢与运输 | 第11-15页 |
| 1.1.1 D-木糖在微生物体内的代谢 | 第11-12页 |
| 1.1.2 D-木糖在微生物体内的运输 | 第12-15页 |
| 1.2 细菌中XylR转录因子的研究概况 | 第15-18页 |
| 1.2.1 转录因子概况 | 第15页 |
| 1.2.2 ROK家族转录因子 | 第15-16页 |
| 1.2.3 XylR转录因子及其对木糖操纵子的调控机制 | 第16-18页 |
| 1.3 分枝杆菌细胞壁结构特征 | 第18-20页 |
| 1.3.1 分枝杆菌细胞壁 | 第18-19页 |
| 1.3.2 分枝杆菌耐药性与细胞壁结构存在密切关系 | 第19-20页 |
| 1.4 耻垢分枝杆菌作为模式菌株的意义 | 第20-21页 |
| 1.5 本研究的总体思路及技术路线 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-42页 |
| 2.1 实验材料与试剂 | 第22-29页 |
| 2.1.1 供试菌株与质粒 | 第22-25页 |
| 2.1.2 培养基 | 第25页 |
| 2.1.3 抗生素、酶与试剂 | 第25-26页 |
| 2.1.4 引物 | 第26-27页 |
| 2.1.5 其它主要试剂配方 | 第27-29页 |
| 2.2 实验方法 | 第29-42页 |
| 2.2.1 基因克隆 | 第29-32页 |
| 2.2.2 蛋白质表达纯化及透析 | 第32-33页 |
| 2.2.3 抗体制备 | 第33页 |
| 2.2.4 染色质免疫沉淀 | 第33-34页 |
| 2.2.5 细菌单杂交 | 第34页 |
| 2.2.6 凝胶阻滞实验 | 第34-35页 |
| 2.2.7 xbpR敲除菌株构建及验证 | 第35-39页 |
| 2.2.8 β-半乳糖苷酶活测定 | 第39页 |
| 2.2.9 等温滴定量热实验 | 第39-41页 |
| 2.2.10 耻垢分枝杆菌生长曲线测定 | 第41-42页 |
| 3 结果与分析 | 第42-59页 |
| 3.1 xbpR概况及功能分析 | 第42页 |
| 3.2 xbpR的基因克隆与蛋白质表达纯化 | 第42-44页 |
| 3.2.1 基因克隆 | 第42-43页 |
| 3.2.2 蛋白质表达与纯化 | 第43-44页 |
| 3.3 xbpR基因敲除 | 第44-47页 |
| 3.3.1 xbpR敲除载体的构建及敲除菌株的筛选 | 第44-46页 |
| 3.3.2 敲除菌株的Southern blot验证 | 第46-47页 |
| 3.4 XbpR结合自身启动子调控木糖操纵子的表达 | 第47-52页 |
| 3.4.1 细菌单杂交实验(B1H)探测XbpR与自身启动子的结合 | 第47-49页 |
| 3.4.2 染色质免疫沉淀实验(ChIP)证实XbpR与自身启动子的结合 | 第49-50页 |
| 3.4.3 凝胶阻滞实验(EMSA)证实XbpR与自身启动子的结合 | 第50-51页 |
| 3.4.4 β-半乳糖苷酶活性实验证实XbpR是一个抑制子 | 第51-52页 |
| 3.5 等温滴定量热实验(ITC)证实XbpR与D-木糖直接相互作用 | 第52-53页 |
| 3.6 D-木糖解除XbpR的抑制活性 | 第53-56页 |
| 3.6.1 D-木糖抑制XbpR的DNA结合活性 | 第53-54页 |
| 3.6.2 D-木糖阻止XbpR的转录抑制 | 第54-56页 |
| 3.7 XbpR调控耻垢分枝杆菌的药物抗性 | 第56-59页 |
| 4 总结与讨论 | 第59-63页 |
| 4.1 总结 | 第59-60页 |
| 4.2 讨论 | 第60-63页 |
| 参考文献 | 第63-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
