| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 缩略词（Abbreviation） | 第13-15页 |
| 第1章 前言 | 第15-19页 |
| 第2章 材料和方法 | 第19-35页 |
| 2.1 材料 | 第19-22页 |
| 2.1.1 菌株来源 | 第19页 |
| 2.1.2 主要试剂及材料 | 第19-20页 |
| 2.1.3 主要溶液及配制 | 第20-21页 |
| 2.1.4 主要仪器设备 | 第21页 |
| 2.1.5 主要生物信息分析工具 | 第21-22页 |
| 2.2 方法 | 第22-35页 |
| 2.2.1 菌株复苏 | 第22-23页 |
| 2.2.2 提取基因组DNA（水煮法） | 第23页 |
| 2.2.3 Spoligotyping标准操作程序 | 第23-28页 |
| 2.2.4 MLVA标准操作程序 | 第28-31页 |
| 2.2.5 比例法药敏试验 | 第31-35页 |
| 第3章 结果 | 第35-59页 |
| 3.1 Spoligotyping分型结果 | 第35-39页 |
| 3.1.1 结果的重复性检测 | 第35-36页 |
| 3.1.2 各地区基因型菌株的组成 | 第36页 |
| 3.1.3 基因型的相关因素研究 | 第36-37页 |
| 3.1.4 南方四省基因型的比较 | 第37-39页 |
| 3.2 MIRU-VNTR分型结果 | 第39-44页 |
| 3.2.1 VNTR位点多态性检测 | 第39-40页 |
| 3.2.2 数据库建立 | 第40页 |
| 3.2.3 VNTR各位点的基因多态性评价 | 第40-41页 |
| 3.2.4 菌株成簇情况及相关性分析 | 第41-44页 |
| 3.3 药敏试验结果 | 第44-53页 |
| 3.3.1 总耐药情况 | 第44-48页 |
| 3.3.2 单耐药情况 | 第48-50页 |
| 3.3.3 多耐药情况 | 第50-51页 |
| 3.3.4 耐多药情况 | 第51-53页 |
| 3.4 基因型与耐药的相关分析 | 第53-56页 |
| 3.5 耐药状况的影响因素分析 | 第56-59页 |
| 3.5.1 任一耐药结果影响因素分析 | 第56页 |
| 3.5.2 耐多药影响因素分析 | 第56-59页 |
| 第4章 讨论 | 第59-67页 |
| 4.1 基因型相关的流行情况 | 第59-61页 |
| 4.2 结核病的耐药状况 | 第61-64页 |
| 4.3 基因分型与耐药及其相关因素 | 第64-65页 |
| 4.4 建议 | 第65-67页 |
| 第5章 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 文献综述 | 第77-93页 |
| 参考文献 | 第84-93页 |
| 作者攻读学位期间的科研成果 | 第93-95页 |
| 致谢 | 第95页 |