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实时荧光定量PCR在凡纳滨对虾病原VPAHPND及SHIV检测中的应用

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
第一章 引言第12-22页
    1.1 对虾常见病原的介绍第12-15页
        1.1.1 白斑综合征病毒(white spot syndrome virus, WSSV)第12-13页
        1.1.2 传染性皮下及造血组织坏死病毒 (infectious hypodermal andhematopoietic necrosis virus, IHHNV)第13页
        1.1.3 传染性肌肉坏死病毒(infectious myonecrosis virus,IMNV)第13-14页
        1.1.4 桃拉病毒(taura syndrome virus,TSV)第14页
        1.1.5 黄头病毒(yellow head virus,YHV)第14-15页
    1.2 急性肝胰腺坏死病(acute hepatopancreatic necrosis disease, AHPND)第15-16页
        1.2.1 急性肝胰腺坏死病的简介第15-16页
        1.2.2 急性肝胰腺坏死病的检测方法第16页
    1.3 虾血细胞虹彩病毒(shrimp hemocyte iridescent virus,SHIV)第16-18页
        1.3.1 虹彩病毒简介第16-17页
        1.3.2 虹彩病毒的诊断与检测方法第17-18页
            1.3.2.1 电镜观察第17-18页
            1.3.2.2 PCR技术第18页
    1.4 人工感染试验第18-19页
    1.5 组织病理学观察第19页
    1.6 实时荧光定量PCR第19-20页
    1.7 本研究目的和意义第20-22页
第二章 凡纳滨对虾感染VP_(AHPND)的定量分析第22-35页
    2.1 实验材料与方法第22-27页
        2.1.1 实验材料第22页
        2.1.2 实验仪器第22页
        2.1.3 实验试剂第22-23页
        2.1.4 实验用对虾的病原检测第23-24页
        2.1.5 重组质粒pVpPirA-1构建第24-25页
        2.1.6 标准曲线制作第25页
        2.1.7 实时荧光定量PCR反应程序和体系第25页
        2.1.8 20130629002S01菌液制备第25-26页
        2.1.9 菌株20130629002S01对凡纳滨对虾的毒力检测第26页
        2.1.10 人工感染试验第26页
        2.1.11 组织病理学观察第26-27页
        2.1.12 样本采集和qPCR检测第27页
    2.2 结果第27-33页
        2.2.1 实验用虾的检测第27页
        2.2.2 qPCR标准曲线第27页
        2.2.3 VP_(AHPND)菌株20130629002S01对凡纳滨对虾的毒力检测第27-28页
        2.2.4 感染实验中对虾死亡率第28-30页
        2.2.5 组织病理观察第30-32页
        2.2.6 感染进程中VP_(AHPND)20130629002S01在凡纳滨对虾不同组织中的分布第32-33页
    2.3 讨论第33-35页
第三章 SHIV实时荧光定量PCR方法的建立第35-44页
    3.1 实验材料与方法第35-38页
        3.1.1 实验材料第35页
        3.1.2 实验仪器第35页
        3.1.3 实验试剂第35-36页
        3.1.4 对虾样品来源以及DNA提取第36页
        3.1.5 引物与TaqMan探针的设计第36页
        3.1.6 引物和探针浓度优化第36-37页
        3.1.7 质粒构建与标准曲线制作第37页
        3.1.8 特异性试验第37页
        3.1.9 灵敏度试验第37-38页
        3.1.10 临床对虾样品检测第38页
    3.2 结果第38-42页
        3.2.1 实时荧光定量PCR反应程序与反应体系第38页
        3.2.2 特异性试验第38-39页
        3.2.3 灵敏度试验第39-41页
        3.2.4 临床对虾样品检测第41-42页
    3.3 讨论第42-44页
第四章 SHIV在凡纳滨对虾不同组织中的定量检测第44-49页
    4.1 实验材料及方法第44-46页
        4.1.1 实验材料第44页
        4.1.2 实验仪器第44页
        4.1.3 实验试剂第44页
        4.1.4 实验用对虾的病原检测第44-45页
        4.1.5 人工感染试验病料处理第45页
        4.1.6 人工感染试验和样本采集第45页
        4.1.7 对虾样品DNA提取第45页
        4.1.8 实时荧光定量PCR反应程序与反应体系第45-46页
        4.1.9 质粒构建和标准曲线制作第46页
        4.1.10 实时荧光定量PCR检测样品第46页
    4.2 结果第46-47页
        4.2.1 实验用虾的检测第46页
        4.2.2 凡纳滨对虾不同组织的SHIV检测结果第46-47页
    4.3 讨论第47-49页
参考文献第49-57页
致谢第57页

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