| 致谢 | 第6-12页 |
| 摘要 | 第12-15页 |
| ABSTRACT | 第15-18页 |
| 缩略语表 | 第19-29页 |
| 楔子 | 第29页 |
| 第一部分 绪论 | 第29-55页 |
| 1 文献综述、研究内容和技术路线 | 第29-55页 |
| 1.1 芍药的引种栽培 | 第31-32页 |
| 1.2 芍药的抗性研究 | 第32-33页 |
| 1.3 植物的抗性评价和生长适应性评价 | 第33-35页 |
| 1.3.1 隶属函数法和主成分分析法 | 第33-34页 |
| 1.3.2 层次分析法、灰色关联度法和心理物理学法 | 第34-35页 |
| 1.4 需冷量和休眠生理生化机理 | 第35-42页 |
| 1.4.1 需冷量 | 第36-39页 |
| 1.4.2 芍药的花期调控 | 第39-40页 |
| 1.4.3 休眠生理生化 | 第40-42页 |
| 1.5 芽休眠的分子机理 | 第42-49页 |
| 1.5.1 环境响应基因 | 第43-45页 |
| 1.5.2 代谢相关基因 | 第45-48页 |
| 1.5.3 细胞生长发育相关基因 | 第48-49页 |
| 1.6 芍药的杂交育种研究 | 第49-51页 |
| 1.6.1 芽变选种 | 第49-50页 |
| 1.6.2 实生苗选种 | 第50页 |
| 1.6.3 杂交育种 | 第50-51页 |
| 1.7 研究目的、主要内容、技术路线和研究意义 | 第51-55页 |
| 1.7.1 研究目的和主要内容 | 第51-53页 |
| 1.7.2 技术路线 | 第53-54页 |
| 1.7.3 研究的主要意义 | 第54-55页 |
| 第二部分 芍药在杭州的园林应用、引种栽培、耐热性和生长适应性评价研究 | 第55-145页 |
| 2 杭州的芍药园林应用现状和“芍药南移”的重新思考 | 第55-75页 |
| 2.1 材料与方法 | 第55-56页 |
| 2.2 结果、分析与讨论 | 第56-74页 |
| 2.2.1 杭州市芍药的园林应用现状 | 第56-63页 |
| 2.2.2 杭州市芍药与牡丹的园林应用对比 | 第63-66页 |
| 2.2.3 “芍药南移”的主要困难及育种方向 | 第66-70页 |
| 2.2.4 “芍药南移”能够实现的科学依据 | 第70-72页 |
| 2.2.5 “芍药南移”的育种途径、科研方向和产业化生产 | 第72-74页 |
| 2.3 小结 | 第74-75页 |
| 3 三十个芍药品种的引种栽培和4年生长适应性观测 | 第75-97页 |
| 3.1 材料与方法 | 第75-79页 |
| 3.1.1 品种基本信息 | 第75-77页 |
| 3.1.2 生长发育观测 | 第77-79页 |
| 3.2 结果与分析 | 第79-94页 |
| 3.2.1 萌芽期观测 | 第79-81页 |
| 3.2.2 茎叶生长观测 | 第81-85页 |
| 3.2.3 花期观测 | 第85-92页 |
| 3.2.4 结果期观测 | 第92-93页 |
| 3.2.5 绿叶期与枯萎期观测 | 第93-94页 |
| 3.3 讨论 | 第94-96页 |
| 3.4 小结 | 第96-97页 |
| 4 芍药在杭州栽培的耐热性研究和相关生理生化测定 | 第97-120页 |
| 4.1 材料与方法 | 第98-101页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第98页 |
| 4.1.2 芍药30个品种耐热性的初步评价 | 第98-100页 |
| 4.1.3 十个代表性品种在高温胁迫下的生理生化响应 | 第100页 |
| 4.1.4 夏季高温结束后芍药的叶绿素荧光特性 | 第100-101页 |
| 4.2 结果与分析 | 第101-112页 |
| 4.2.1 杭州地区30个芍药品种的耐热性观测和评价 | 第101-108页 |
| 4.2.2 夏季高温期间10个代表性品种的生理生化测定及耐热性验证 | 第108-110页 |
| 4.2.3 夏季高温结束后8个芍药品种的叶绿素荧光特性及耐热性验证 | 第110-112页 |
| 4.3 讨论 | 第112-119页 |
| 4.3.1 不同芍药品种的耐热初步评价及园林应用前景 | 第112-114页 |
| 4.3.2 高温胁迫与叶片失绿、渗透调节和生物膜系统受损 | 第114-116页 |
| 4.3.3 芍药高温胁迫下生理生化实验中值得关注的2个问题 | 第116-117页 |
| 4.3.4 芍药高温胁迫下的叶绿素荧光特性 | 第117-119页 |
| 4.4 小结 | 第119-120页 |
| 5 芍药在杭州栽培的耐热性单项评价和生长适应性综合评价 | 第120-145页 |
| 5.1 材料与方法 | 第120-128页 |
| 5.1.1 耐热性单项评价 | 第120-123页 |
| 5.1.2 生长适应性综合评价 | 第123-128页 |
| 5.2 结果与分析 | 第128-137页 |
| 5.2.1 耐热性评价 | 第128-133页 |
| 5.2.2 生长适应性综合评价 | 第133-137页 |
| 5.3 讨论 | 第137-143页 |
| 5.3.1 耐热性评价 | 第137页 |
| 5.3.2 将隶属函数法与主成分分析法结合评价的必要性 | 第137-138页 |
| 5.3.3 隶属函数和主成分分析结合评价体系中的两个值得注意的问题 | 第138-140页 |
| 5.3.4 生长适应性综合评价 | 第140-143页 |
| 5.4 小结 | 第143-145页 |
| 第三部分 ‘杭白芍’地下芽休眠解除的需冷量、花期调控和休眠机理研究 | 第145-259页 |
| 6 ‘杭白芍’地下芽休眠解除的需冷量、花期调控和休眠生理代谢 | 第145-185页 |
| 6.1 材料和方法 | 第146-154页 |
| 6.1.1 实验材料 | 第146-147页 |
| 6.1.2 实验设计 | 第147-149页 |
| 6.1.3 自然低温下的芽休眠和生长的形态学观测 | 第149-151页 |
| 6.1.4 自然低温下芽休眠解除的需冷量估测 | 第151-152页 |
| 6.1.5 自然低温下休眠芽的采样和生理生化观测 | 第152-153页 |
| 6.1.6 人工低温处理下的形态学观测 | 第153页 |
| 6.1.7 人工低温处理后的需冷量估测和与自然低温下需冷量之间的验证 | 第153-154页 |
| 6.1.8 本章实验全程的梳理 | 第154页 |
| 6.2 结果与分析 | 第154-175页 |
| 6.2.1 冬季自然低温下‘杭白芍’芽休眠、萌发和生长的全程观测 | 第154-157页 |
| 6.2.2 自然低温结合温室处理的催花效果及相关形态学观测 | 第157-163页 |
| 6.2.3 自然低温下‘杭白芍’芽休眠解除的需冷量 | 第163-165页 |
| 6.2.4 自然低温下的芽休眠相关生理生化代谢 | 第165-167页 |
| 6.2.5 人工低温处理下萌芽与生长形态学观测 | 第167-171页 |
| 6.2.6 人工低温处理下的催花效果与花期形态观测 | 第171-174页 |
| 6.2.7 人工低温与自然低温处理的需冷量对比 | 第174-175页 |
| 6.3 讨论 | 第175-184页 |
| 6.3.1 自然低温下芽休眠的解除与茎的生长 | 第175页 |
| 6.3.2 使用自然低温、5-氮杂胞苷和赤霉素的催花效果 | 第175-177页 |
| 6.3.3 使用人工低温和腐植酸对芍药萌芽和催花的可能影响 | 第177-178页 |
| 6.3.4 ‘杭白芍’芽休眠解除的需冷量 | 第178-180页 |
| 6.3.5 自然低温处理下的休眠相关生理生化代谢 | 第180-184页 |
| 6.4 小结 | 第184-185页 |
| 7 ‘杭白芍’地下芽休眠期间的转录组测序、拼接及注释 | 第185-206页 |
| 7.1 材料与方法 | 第186-189页 |
| 7.1.1 转录组测序材料及采样 | 第186页 |
| 7.1.2 RNA的提取、纯化和质量检验 | 第186-187页 |
| 7.1.3 cDNA文库的构建和深度测序 | 第187-188页 |
| 7.1.4 重头组装 | 第188页 |
| 7.1.5 测序和拼接数据提交 | 第188-189页 |
| 7.1.6 Unigene注释和分类 | 第189页 |
| 7.2 结果与分析 | 第189-202页 |
| 7.2.1 ‘杭白芍’休眠地下芽RNA质量 | 第190页 |
| 7.2.2 测序均一性分布评估 | 第190-191页 |
| 7.2.3 转录组测序概况 | 第191-192页 |
| 7.2.4 六个基因文库的转录组测序和基因比对概况 | 第192-194页 |
| 7.2.5 Unigene注释 | 第194-195页 |
| 7.2.6 Unigene功能分类 | 第195-197页 |
| 7.2.7 转录因子家族和高表达转录本 | 第197-199页 |
| 7.2.8 SSR鉴定 | 第199-200页 |
| 7.2.9 KEGG生理生化代谢途径注释 | 第200-202页 |
| 7.3 讨论 | 第202-205页 |
| 7.4 小结 | 第205-206页 |
| 8 ‘杭白芍’地下芽休眠转录组的差异表达基因功能和休眠阶段划分 | 第206-225页 |
| 8.1 材料与方法 | 第207-208页 |
| 8.1.1 差异表达基因的确定和筛选 | 第207页 |
| 8.1.2 差异表达基因数量对比和休眠状态划分 | 第207页 |
| 8.1.3 差异表达基因GO功能富集 | 第207页 |
| 8.1.4 差异表达基因聚类分析 | 第207-208页 |
| 8.1.5 不同休眠阶段差异表达基因的KEGG pathway注释对比 | 第208页 |
| 8.1.6 不同休眠阶段最显著差异表达基因的筛选和注释 | 第208页 |
| 8.2 结果与分析 | 第208-220页 |
| 8.2.1 差异表达基因数量对比 | 第208-209页 |
| 8.2.2 上调与下调差异表达基因的数量对比 | 第209-210页 |
| 8.2.3 差异表达基因的GO功能富集 | 第210-212页 |
| 8.2.4 差异基因表达模式聚类分析 | 第212-214页 |
| 8.2.5 不同休眠阶段差异表达基因的KEGG pathway注释对比 | 第214-215页 |
| 8.2.6 不同休眠阶段最显著差异表达基因的筛选和注释 | 第215-220页 |
| 8.3 讨论 | 第220-223页 |
| 8.3.1 休眠阶段对应时期的解读与划分 | 第220-221页 |
| 8.3.2 不同休眠阶段的差异基因注释 | 第221页 |
| 8.3.3 不同休眠阶段的差异基因表达模式聚类 | 第221-223页 |
| 8.4 小结 | 第223-225页 |
| 9 ‘杭白芍,地下芽休眠的环境响应相关差异基因表达 | 第225-234页 |
| 9.1 材料与方法 | 第226-227页 |
| 9.1.1 差异基因筛选和整理 | 第226-227页 |
| 9.1.2 热图(heatmap)制作 | 第227页 |
| 9.1.3 差异表达分析 | 第227页 |
| 9.2 结果与讨论 | 第227-233页 |
| 9.2.1 环境响应相关基因的表达变化 | 第227-229页 |
| 9.2.2 需冷量相关基因 | 第229-230页 |
| 9.2.3 光响应相关基因 | 第230-231页 |
| 9.2.4 应激蛋白相关基因 | 第231-232页 |
| 9.2.5 生理节律相关基因 | 第232-233页 |
| 9.2.6 其他 | 第233页 |
| 9.3 小结 | 第233-234页 |
| 10 ‘杭白芍’地下芽休眠的生理代谢相关差异基因表达 | 第234-249页 |
| 10.1 材料与方法 | 第234-236页 |
| 10.2 结果与分析 | 第236-248页 |
| 10.2.1 水分代谢和物质转运相关基因 | 第236-239页 |
| 10.2.2 碳水化合物和能量代谢相关基因 | 第239-243页 |
| 10.2.3 激素代谢相关基因 | 第243-246页 |
| 10.2.4 抗氧化代谢相关基因 | 第246-248页 |
| 10.3 小结 | 第248-249页 |
| 11 ‘杭白芍’地下芽休眠的细胞生长发育相关差异基因表达 | 第249-259页 |
| 11.1 材料与方法 | 第249-250页 |
| 11.2 结果与讨论 | 第250-258页 |
| 11.2.1 胞生长发育相关基因 | 第250-256页 |
| 11.2.2 ‘杭白芍’地下芽休眠转化和解除的差异基因表达综合图 | 第256-257页 |
| 11.2.3 有待于进一步鉴定或挖掘的休眠相关基因 | 第257-258页 |
| 11.3 小结 | 第258-259页 |
| 第四部分 南北芍药种质间的杂交育种实践 | 第259-274页 |
| 12 ‘杭白芍’与菏泽芍药的品种间杂交 | 第259-274页 |
| 12.1 材料与方法 | 第259-261页 |
| 12.1.1 ‘杭白芍’花粉生活力测定 | 第259-260页 |
| 12.1.2 2012-2015年的芍药品种间杂交育种实践 | 第260-261页 |
| 12.2 结果与分析 | 第261-271页 |
| 12.2.1 ‘杭白芍’花粉生活力观测 | 第261-265页 |
| 12.2.2 2012-2015年的芍药品种间杂交育种实践 | 第265-271页 |
| 12.3 讨论 | 第271-273页 |
| 12.4 小结 | 第273-274页 |
| 第五部分 总结 | 第274-278页 |
| 13 全文总结、创新点及展望 | 第274-278页 |
| 13.1 主要结论 | 第274-277页 |
| 13.1.1 芍药在杭州的园林应用、引种栽培、耐热性和生长适应性综合评价 | 第274-275页 |
| 13.1.2 ‘杭白芍’芽休眠的需冷量及休眠分子机理 | 第275-276页 |
| 13.1.3 芍药杂交育种实践 | 第276-277页 |
| 13.2 主要创新点 | 第277页 |
| 13.3 不足与展望 | 第277-278页 |
| 13.4 全文结语 | 第278页 |
| 收煞 | 第278-279页 |
| 参考文献 | 第279-295页 |
| 作者简历 | 第295-296页 |
