| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-29页 |
| 1.1 HNE及其抑制剂的研究进展 | 第11-19页 |
| 1.1.1 HNE及其生物功能介绍 | 第11-12页 |
| 1.1.2 HNE现有抑制剂的研究进展 | 第12-16页 |
| 1.1.3 HNE现有晶体结构 | 第16-19页 |
| 1.2 蛋白质结构预测的重要意义及其研究方法比较 | 第19-22页 |
| 1.2.1 蛋白质的生理作用及其结构 | 第19-20页 |
| 1.2.2 蛋白质结构预测的重要意义 | 第20页 |
| 1.2.3 现有的多肽或蛋白质结构预测的研究方法 | 第20-21页 |
| 1.2.4 从头预测蛋白质三级结构的动力学研究方法及其比较 | 第21-22页 |
| 1.3 理论研究方法 | 第22-28页 |
| 1.3.1 分子对接 | 第23-24页 |
| 1.3.2 分子动力学 | 第24-25页 |
| 1.3.3 结合自由能计算 | 第25-27页 |
| 1.3.4 虚拟筛选 | 第27-28页 |
| 1.4 本文的研究目的与研究内容 | 第28-29页 |
| 第二章 人源弹性蛋白酶(HNE)的抑制剂的虚拟筛选 | 第29-50页 |
| 2.1 引言 | 第29-33页 |
| 2.2 计算方法 | 第33-37页 |
| 2.2.1 基于配体与基于受体相结合的虚拟筛选策略 | 第33-35页 |
| 2.2.2 结合模式确定方法 | 第35-37页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第37-48页 |
| 2.3.1 虚拟筛选结果 | 第37-40页 |
| 2.3.2 新的抑制剂结合模式分析 | 第40-48页 |
| 2.3.3 计算结果与实验结果比较分析 | 第48页 |
| 2.4 本章小结 | 第48-50页 |
| 第三章 基于模拟退火分子动力学的多肽构象空间搜索 | 第50-64页 |
| 3.1 引言 | 第50-51页 |
| 3.2 计算方法 | 第51-53页 |
| 3.2.1 通过MSA-MD的大规模的结构采样 | 第51-52页 |
| 3.2.2 结构筛选 | 第52-53页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第53-63页 |
| 3.3.1 1AL1的三级结构预测及其结果 | 第53-56页 |
| 3.3.2 1L2Y的三级结构预测及其结果 | 第56-59页 |
| 3.3.3 PolyAla、1UAO等其他结构采样结果比较 | 第59-63页 |
| 3.4 本章小结 | 第63-64页 |
| 全文总结 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-80页 |
| 附录 缩写对照 | 第80-81页 |
| 攻读学位期间发表论文 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
