摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第1章 文献综述及研究意义 | 第10-19页 |
1.1 全球温室效应对蓝藻的影响 | 第10-12页 |
1.1.1 温室效应 | 第10页 |
1.1.2 CO_2浓度升高对浮游藻类的影响 | 第10-11页 |
1.1.3 温度升高对浮游藻类的影响 | 第11页 |
1.1.4 温度和CO_2浓度同步升高对浮游藻类生理的影响 | 第11-12页 |
1.2 集胞藻6803的DNA损伤与修复 | 第12-14页 |
1.2.1 DNA损伤修复基因及其生物学功能 | 第12-14页 |
1.2.2 紫外DNA损伤修复基因的生态学意义 | 第14页 |
1.3 集胞藻6803的基因表达相关研究现状 | 第14-15页 |
1.4 噬藻体 | 第15-17页 |
1.4.1 噬藻体的生长影响因素 | 第15-16页 |
1.4.2 紫外线对病毒的影响 | 第16页 |
1.4.3 藻细胞宿主介导噬藻体的光修复 | 第16-17页 |
1.5 实验研究的内容与方法 | 第17页 |
1.5.1 研究内容 | 第17页 |
1.5.2 研究方法 | 第17页 |
1.6 实验的研究意义 | 第17-19页 |
第2章 海洋聚球藻噬藻体S-ESS1全基因组测序 | 第19-29页 |
2.1 引言 | 第19页 |
2.2 实验材料 | 第19页 |
2.3 主要仪器 | 第19-20页 |
2.4 实验方法 | 第20-21页 |
2.4.1 噬藻体分离纯化 | 第20页 |
2.4.2 电子显微镜观察噬藻体 | 第20页 |
2.4.3 DNA提取,基因组测序和ORF注释 | 第20页 |
2.4.4 基因TerL的亲缘关系树的建立 | 第20-21页 |
2.5 实验结果与分析 | 第21-27页 |
2.5.1 基因内容和ORF(开放阅读框)含量 | 第21-26页 |
2.5.2 基因组的结构 | 第26页 |
2.5.3 TerL进化树 | 第26-27页 |
2.6 讨论 | 第27-29页 |
第3章 pCO_2和温度同步升高对集胞藻6803生长的影响 | 第29-35页 |
3.1 引言 | 第29页 |
3.2 实验装置与材料 | 第29-31页 |
3.2.1 实验装置 | 第29页 |
3.2.2 实验材料 | 第29-31页 |
3.3 实验条件 | 第31页 |
3.4 实验方法 | 第31-32页 |
3.4.1 集胞藻6803的藻细胞生长计数 | 第31页 |
3.4.2 集胞藻6803的PSII光化学效率Fv/Fm | 第31-32页 |
3.5 实验结果与分析 | 第32-34页 |
3.5.1 集胞藻6803的生长量 | 第32页 |
3.5.2 实验条件下集胞藻6803的生长曲线 | 第32-33页 |
3.5.3 各实验条件下藻液pH值的检测 | 第33-34页 |
3.5.4 实验条件下集胞藻6803的光合活性 | 第34页 |
3.6 讨论 | 第34-35页 |
第4章 集胞藻6803转录组差异分析 | 第35-40页 |
4.1 引言 | 第35页 |
4.2 实验材料和方法 | 第35-36页 |
4.2.1 RNA定量和鉴定 | 第35页 |
4.2.2 针对特异性转录组测序的文库制备 | 第35-36页 |
4.2.3 聚类和测序 | 第36页 |
4.3 实验技术路线 | 第36-37页 |
4.4 实验分析方法 | 第37页 |
4.4.1 读取参考基因组的映射 | 第37页 |
4.4.2 基因表达水平的定量 | 第37页 |
4.4.3 差异表达分析 | 第37页 |
4.5 结果与结论 | 第37-39页 |
4.5.1 实验条件组的差异基因表达 | 第37-38页 |
4.5.2 mRNA全转录组的表达 | 第38-39页 |
4.6 小结 | 第39-40页 |
第5章 集胞藻6803的phrA、uvrA、lexA和recA基因引物设计与验证 | 第40-48页 |
5.1 引言 | 第40页 |
5.2 实验材料和方法 | 第40-41页 |
5.2.1 菌株及其生长环境 | 第40页 |
5.2.2 主要实验试剂 | 第40-41页 |
5.2.3 主要实验耗材 | 第41页 |
5.2.4 主要仪器 | 第41页 |
5.3 实验技术路线 | 第41页 |
5.4 实验方法 | 第41-44页 |
5.4.1 集胞藻6803总DNA的提取 | 第41-42页 |
5.4.2 引物的设计 | 第42-43页 |
5.4.3 PCR扩增 | 第43-44页 |
5.4.4 PCR产物测序 | 第44页 |
5.5 结果与分析 | 第44-47页 |
5.5.1 集胞藻6803提取的核酸结果 | 第44页 |
5.5.2 引物PCR扩增结果 | 第44-45页 |
5.5.3 PCR产物序列分析 | 第45-47页 |
5.6 讨论 | 第47-48页 |
第6章 RT-qPCR检测藻细胞DNA紫外损伤修复基因的表达 | 第48-59页 |
6.1 引言 | 第48页 |
6.2 实验材料和方法 | 第48-49页 |
6.2.1 试剂及仪器 | 第48-49页 |
6.3 实验技术路线 | 第49-50页 |
6.4 实验方法 | 第50-52页 |
6.4.1 确定内参基因与目标基因的定量PCR引物 | 第50页 |
6.4.2 集胞藻6803的总RNA提取 | 第50-51页 |
6.4.3 逆转录合成cDNA | 第51页 |
6.4.4 荧光PCR反应体系 | 第51-52页 |
6.4.5 实验数据的处理 | 第52页 |
6.5 实验结果与分析 | 第52-59页 |
6.5.1 RNA提取结果 | 第52-53页 |
6.5.2 实时定量PCR反应 | 第53-54页 |
6.5.3 RT-qPCR检测目标基因的表达量结果 | 第54-59页 |
结论 | 第59-61页 |
总结 | 第61-62页 |
参考文献 | 第62-70页 |
致谢 | 第70-71页 |
附录一 | 第71页 |