| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第1章 文献综述 | 第9-21页 |
| 1.1 柑橘属植物的起源与栽培历史 | 第9-11页 |
| 1.2 柑橘属植物的分类与进化研究现状 | 第11-14页 |
| 1.2.1 柑橘属植物的分类地位 | 第11-12页 |
| 1.2.2 柑橘属植物的分类系统 | 第12-14页 |
| 1.3 柑橘属植物分类与进化研究方法 | 第14-18页 |
| 1.3.1 细胞学分类 | 第14页 |
| 1.3.2 孢粉学分类 | 第14页 |
| 1.3.3 化学分类 | 第14-15页 |
| 1.3.4 数值学分类 | 第15-16页 |
| 1.3.5 DNA分子标记分类 | 第16-18页 |
| 1.4 基因芯片在植物研究中的应用 | 第18-21页 |
| 第2章 引言 | 第21-25页 |
| 2.1 研究目的及意义 | 第21页 |
| 2.1.1 基于形态学特征对柑橘属植物进行分子身份鉴定 | 第21页 |
| 2.1.2 建立柑橘属植物进化的基本框架 | 第21页 |
| 2.2 研究的主要内容 | 第21-23页 |
| 2.2.1 DArT芯片的构建和评估 | 第21-22页 |
| 2.2.2 柑橘及其近缘属植物叶绿体基因组全测序 | 第22-23页 |
| 2.3 研究的技术路线 | 第23-25页 |
| 第3章 材料方法 | 第25-33页 |
| 3.1 构建DART基因芯片的植物材料与方法 | 第25-29页 |
| 3.1.1 构建DArT基因芯片的植物材料 | 第25-27页 |
| 3.1.2 构建DArT芯片的方法 | 第27-29页 |
| 3.1.3 芯片杂交及数据提取 | 第29页 |
| 3.1.4 进化关系分析 | 第29页 |
| 3.2 叶绿体基因组分析的材料与方法 | 第29-33页 |
| 3.2.1 叶绿体基因组分析材料 | 第29-30页 |
| 3.2.2 叶绿体基因组的测序、组装以及注释 | 第30-31页 |
| 3.2.3 基因间隔区(Intergenic region)比对分析 | 第31-33页 |
| 第4章 结果分析 | 第33-47页 |
| 4.1 DART芯片构建与评估 | 第33-34页 |
| 4.2 基于DART芯片的柑橘及其近缘种进化研究 | 第34-37页 |
| 4.3 基于叶绿体基因组的进化分析 | 第37-47页 |
| 4.3.1 叶绿体基因组基因组比较 | 第37-41页 |
| 4.3.2 进化分析 | 第41-47页 |
| 第5章 讨论 | 第47-51页 |
| 5.1 柑橘属植物的原生种类及数目 | 第47-48页 |
| 5.2 原生种类间的进化关系 | 第48-50页 |
| 5.3 筛选柑橘属条形码 | 第50-51页 |
| 第6章 结论与展望 | 第51-53页 |
| 6.1 结论 | 第51页 |
| 6.2 展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-61页 |
| 附录 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 发表论文和参研课题 | 第63页 |