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自吸分液式数字PCR集成流路芯片的研制及其在单分子核酸和蛋白质分子检测中的应用

致谢第5-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
第一章 绪论第15-63页
    1.1 数字PCR技术第17-34页
        1.1.1 数字PCR技术原理第17-20页
        1.1.2 单分子扩增的理论分析第20-22页
        1.1.3 数字PCR的分类第22-27页
            1.1.3.1 孔板或微反应室数字PCR第22页
            1.1.3.2 大规模集成流路(IFC)数字PCR第22-24页
            1.1.3.3 液滴数字PCR第24-27页
        1.1.4 数字PCR的应用第27-32页
            1.1.4.1 癌症早期诊断第27-28页
            1.1.4.2 产前诊断第28-29页
            1.1.4.3 单细胞基因表达的定量第29-30页
            1.1.4.4 在下一代测序上的应用第30页
            1.1.4.5 环境微生物的检测第30-31页
            1.1.4.6 转基因植物的检测第31-32页
        1.1.5 数字PCR仪器发展现状第32-34页
    1.2 环介导等温扩增(LAMP)方法第34-41页
        1.2.1 环介导等温扩增(LAMP)的原理第34-37页
        1.2.2 环介导等温扩增(LAMP)特点、优势第37-38页
        1.2.3 数字环介导等温扩增(LAMP)方法第38-41页
            1.2.3.1 基于样品自数字化芯片的数字LAMP第38-40页
            1.2.3.2 基于滑动芯片的数字RT-LAMP第40-41页
    1.3 基于PDMS的无动力进样方法第41-44页
        1.3.1 基于PDMS的无动力进样方法原理第41-42页
        1.3.2 基于PDMS的无动力进样方法的应用第42-44页
    1.4 数字ELISA方法检测单分子蛋白质第44-45页
    1.5 本论文的研究概述第45-49页
        1.5.1 本论文的研究思路第45-47页
        1.5.2 本论文的主要创新点和待改进之处第47-49页
    1.6 结论与展望第49-50页
    1.7 参考文献第50-63页
第二章 基于气动微阀的集成流路数字PCR芯片的研制第63-81页
    2.1 引言第63-64页
    2.2 实验部分第64-70页
        2.2.1 试剂第64-65页
        2.2.2 仪器与装置第65页
        2.2.3 数字PCR芯片的制作第65-69页
            2.2.3.1 集成流路数字PCR芯片的设计第65-66页
            2.2.3.2 芯片掩模版设计与制作第66页
            2.2.3.3 芯片模具的制作第66-68页
            2.2.3.4 芯片的制作第68-69页
        2.2.4 实验操作第69-70页
            2.2.4.1 样品准备第69页
            2.2.4.2 数字PCR反应(digital PCR)第69-70页
        2.2.5 图像获取与数据分析第70页
    2.3 结果与讨论第70-77页
        2.3.1 集成流路数字PCR芯片的制作第70-71页
        2.3.2 气动微阀关闭的关键第71页
        2.3.3 气动微阀开关气压的测试第71-73页
        2.3.4 数字PCR检测结果及讨论第73-77页
    2.4 结论与展望第77-78页
    2.5 参考文献第78-81页
第三章 自吸分液式数字LAMP芯片的研制及其应用第81-107页
    3.1 引言第81-82页
    3.2 实验部分第82-93页
        3.2.1 试剂第82-83页
        3.2.2 仪器与装置第83-84页
        3.2.3 自吸分液式数字LAMP芯片的制作第84-88页
            3.2.3.1 无动力、无阀门自吸分液式数字LAMP芯片的设计第84-85页
            3.2.3.2 芯片掩模版设计与制作第85页
            3.2.3.3 芯片模具的制作第85-86页
            3.2.3.4 芯片的制作第86-88页
        3.2.4 实验操作第88-93页
            3.2.4.1 样品准备第88-89页
            3.2.4.2 LAMP引物设计第89页
            3.2.4.3 芯片的操作原理第89-91页
            3.2.4.4 实时荧光定量PCR检测第91页
            3.2.4.5 数字环介导等温扩增反应(digital LAMP)第91-93页
        3.2.5 数据检测与分析第93页
    3.3 结果与讨论第93-100页
        3.3.1 无动力、无阀门、自吸式数字LAMP芯片的操作第93-95页
        3.3.2 芯片样品分配的均一性分析第95-96页
        3.3.3 数字LAMP反应阳性孔的阈值确定第96页
        3.3.4 实时荧光定量PCR结果第96-98页
        3.3.5 无动力、无阀门、自吸式数字LAMP第98-100页
    3.4 结论与展望第100-102页
    3.5 参考文献第102-107页
第四章 超百万集成度自吸分液式数字LAMP芯片系统第107-133页
    4.1 引言第107-108页
    4.2 实验部分第108-117页
        4.2.1 试剂与材料第108-109页
        4.2.2 仪器与装置第109页
        4.2.3 超百万集成度自吸分液式数字LAMP芯片的制作第109-113页
            4.2.3.1 无动力、无阀门超百万集成度自吸分液式数字LAMP芯片的设计第109-111页
            4.2.3.2 芯片掩模版设计与制作第111页
            4.2.3.3 芯片模具的制作第111-112页
            4.2.3.4 芯片的制作第112-113页
        4.2.4 实验操作第113-117页
            4.2.4.1 样品准备第113-114页
            4.2.4.2 LAMP引物设计第114页
            4.2.4.3 常规环介导等温扩增反应第114-115页
            4.2.4.4 实时荧光定量PCR检测第115-116页
            4.2.4.5 数字环介导等温扩增反应(digital LAMP)第116-117页
        4.2.5 数据检测与分析第117页
    4.3 结果与讨论第117-127页
        4.3.1 无动力、无阀门、超百万集成度自吸分液式数字LAMP芯片的制作第117-120页
        4.3.2 HBV样本LAMP反应条件优化第120-122页
        4.3.3 数字LAMP反应阳性孔的判定第122页
        4.3.4 实时荧光定量PCR结果第122-124页
        4.3.5 无动力、无阀门、超百万集成度自吸式数字LAMP第124-127页
    4.4 结论与展望第127-129页
    4.5 参考文献第129-133页
第五章 自吸分液式数字PCR集成流路芯片的研究及其应用第133-165页
    5.1 引言第133-134页
    5.2 实验部分第134-145页
        5.2.1 试剂第134-135页
        5.2.2 仪器与装置第135-136页
        5.2.3 自吸分液式数字PCR芯片的制作第136-141页
            5.2.3.1 无动力、无阀门自吸分液式数字PCR芯片的设计第136-137页
            5.2.3.2 芯片的操作原理第137-138页
            5.2.3.3 芯片掩模版设计与制作第138页
            5.2.3.4 芯片模具的制作第138-140页
            5.2.3.5 芯片的制作第140-141页
        5.2.4 实验操作第141-145页
            5.2.4.1 样品准备第141-142页
            5.2.4.2 PCR引物序列设计第142-143页
            5.2.4.3 实时荧光定量PCR检测第143-144页
            5.2.4.4 数字PCR反应(digital PCR)第144-145页
        5.2.5 数据检测与分析第145页
    5.3 结果与讨论第145-157页
        5.3.1 无动力、无阀门、自吸分液式数字PCR芯片的操作第145-147页
        5.3.2 纳米防水层的制备及其防水效果测定第147-148页
        5.3.3 自吸分液式数字PCR结果的统计理论分析第148-152页
        5.3.4 自吸分液式数字PCR扩增结果第152-155页
        5.3.5 自吸分液式数字PCR检测不确定性分析第155-156页
        5.3.6 自吸分液式数字PCR芯片自吸能力的测定第156-157页
    5.4 结论与展望第157-159页
    5.5 参考文献第159-165页
第六章 数字亲和连接反应(digital PLA)检测单分子蛋白质第165-185页
    6.1 引言第165-166页
    6.2 TaqMan蛋白分析技术的原理第166-168页
    6.3 实验部分第168-175页
        6.3.1 试剂第168-169页
        6.3.2 仪器与装置第169页
        6.3.3 实验操作第169-175页
            6.3.3.1 制作自吸分液式数字PCR芯片第169页
            6.3.3.2 Taqman蛋白实时荧光定量PCR的基本操作步骤第169-174页
            6.3.3.3 数字Proximity ligation assays(digital PLA)检测单个蛋白质分子第174-175页
    6.4 结果与讨论第175-179页
        6.4.1 Taqman蛋白实时荧光定量PCR第175-176页
        6.4.2 数字Proximity ligation assays(digital PLA)检测单个蛋白质分子第176-179页
    6.5 结论与展望第179-181页
    6.6 参考文献第181-185页
作者简历第185-187页
攻读博士学位期间所取得的科研成果第187-188页

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