| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 1 绪论 | 第16-32页 |
| 1.1 课题背景 | 第16页 |
| 1.2 沙棘及其油脂相关研究进展 | 第16-20页 |
| 1.2.1 沙棘研究概况 | 第16-17页 |
| 1.2.2 沙棘的生物学特性 | 第17页 |
| 1.2.3 沙棘油脂及其他生物活性成分 | 第17-20页 |
| 1.3 分子标记在沙棘种质资源中的应用 | 第20-21页 |
| 1.3.1 亲缘关系及遗传多样性分析 | 第20页 |
| 1.3.2 应用分子标记方法的标记-性状连锁分析 | 第20-21页 |
| 1.4 植物油脂的研究进展 | 第21-27页 |
| 1.4.1 植物油脂概述 | 第21-22页 |
| 1.4.2 油脂和脂肪酸的作用和意义 | 第22-24页 |
| 1.4.3 油脂和脂肪酸的生物合成途径及相关基因 | 第24-27页 |
| 1.5 基于HiSeq平台的转录组测序 | 第27-30页 |
| 1.5.1 转录组测序 | 第28-29页 |
| 1.5.2 小RNA测序 | 第29-30页 |
| 1.6 整合组学鉴定生物合成的分子机制 | 第30-31页 |
| 1.7 研究的主要内容和目的意义 | 第31-32页 |
| 2 沙棘种质含油量及品质性状分析 | 第32-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第32-34页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第32页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第32-34页 |
| 2.2 结果与分析 | 第34-38页 |
| 2.2.1 沙棘果肉和种子含油量分析 | 第34-36页 |
| 2.2.2 其他性状指标分析 | 第36-38页 |
| 2.3 讨论 | 第38-39页 |
| 2.4 本章小结 | 第39-40页 |
| 3 沙棘种质亲缘关系ISSR分析及性状连锁标记鉴定 | 第40-51页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-42页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第40页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第40-42页 |
| 3.2 结果与分析 | 第42-48页 |
| 3.2.1 沙棘种质遗传关系的ISSR分析 | 第42-43页 |
| 3.2.2 聚类分析和多维尺度分析 | 第43-45页 |
| 3.2.3 ISSR标记与含油量性状连锁分析 | 第45-48页 |
| 3.3 讨论 | 第48-50页 |
| 3.3.1 蒙古沙棘亚种与其杂交种的遗传关系 | 第48-49页 |
| 3.3.2 与沙棘含油量性状连锁的ISSR标记 | 第49-50页 |
| 3.4 本章小结 | 第50-51页 |
| 4 沙棘果实发育过程中含油量及脂肪酸组分的动态变化 | 第51-69页 |
| 4.1 材料与方法 | 第51-53页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第51页 |
| 4.1.2 试验方法 | 第51-53页 |
| 4.2 结果与分析 | 第53-65页 |
| 4.2.1 沙棘果实发育过程中油脂积累的动态变化 | 第53-55页 |
| 4.2.2 沙棘果实发育过程中脂肪酸组分的动态变化 | 第55-62页 |
| 4.2.3 沙棘果实发育过程中含油量及脂肪酸组分相关性分析 | 第62-65页 |
| 4.3 讨论 | 第65-68页 |
| 4.3.1 果肉和种子油脂合成积累模式 | 第65-66页 |
| 4.3.2 果肉和种子脂肪酸组分的合成积累模式 | 第66-67页 |
| 4.3.3 油脂和脂肪酸组分相关性分析 | 第67-68页 |
| 4.4 本章小结 | 第68-69页 |
| 5 沙棘不同组织转录组测序及油脂合成相关差异表达基因分析 | 第69-86页 |
| 5.1 材料与方法 | 第69-72页 |
| 5.1.1 植物材料 | 第69页 |
| 5.1.2 总RNA提取 | 第69-70页 |
| 5.1.3 转录组测序及分析 | 第70-72页 |
| 5.2 结果与分析 | 第72-84页 |
| 5.2.1 沙棘总RNA质量评价 | 第72页 |
| 5.2.2 沙棘转录组de novo测序数据分析 | 第72-78页 |
| 5.2.3 沙棘不同组织部位的差异表达基因分析 | 第78-81页 |
| 5.2.4 与沙棘油脂合成相关的差异表达基因 | 第81-84页 |
| 5.3 讨论 | 第84-85页 |
| 5.4 本章小结 | 第85-86页 |
| 6 沙棘油脂和脂肪酸合成相关基因的qRT-PCR分析 | 第86-104页 |
| 6.1 材料与方法 | 第86-93页 |
| 6.1.1 试验材料 | 第86页 |
| 6.1.2 试剂及仪器 | 第86页 |
| 6.1.3 试验方法 | 第86-93页 |
| 6.2 结果与分析 | 第93-100页 |
| 6.2.1 沙棘油脂和脂肪酸合成相关的unigene的获得 | 第93-94页 |
| 6.2.2 沙棘油脂合成相关基因片段的克隆 | 第94页 |
| 6.2.3 沙棘油脂和脂肪酸合成相关基因的表达分析 | 第94-100页 |
| 6.3 讨论 | 第100-103页 |
| 6.3.1 果肉油脂和脂肪酸合成相关基因的表达模式 | 第100-101页 |
| 6.3.2 种子油脂和脂肪酸合成相关基因的表达模式 | 第101-102页 |
| 6.3.3 果肉和种子油脂合成基因表达模式差异 | 第102-103页 |
| 6.4 本章小结 | 第103-104页 |
| 7 基于不同时期的果肉和种子RNA-Seq挖掘油脂合成关键基因 | 第104-122页 |
| 7.1 材料与方法 | 第104-106页 |
| 7.1.1 试验材料 | 第104页 |
| 7.1.2 总RNA样品及检测 | 第104-105页 |
| 7.1.3 cDNA文库构建、纯化及测序 | 第105页 |
| 7.1.4 数据处理及生物信息学分析 | 第105页 |
| 7.1.5 实时定量PCR验证 | 第105-106页 |
| 7.2 结果与分析 | 第106-119页 |
| 7.2.1 RNA质量与评价 | 第106-107页 |
| 7.2.2 测序数据质量评估 | 第107-109页 |
| 7.2.3 转录组de novo组装及基因功能注释 | 第109-112页 |
| 7.2.4 不同生育期沙棘果肉和种子差异表达基因筛选 | 第112-114页 |
| 7.2.5 与沙棘油脂和脂肪酸合成相关的差异表达基因 | 第114-115页 |
| 7.2.6 差异基因的表达模式分析 | 第115-119页 |
| 7.2.7 新发现的油脂合成相关基因qRT-PCR验证 | 第119页 |
| 7.3 讨论 | 第119-121页 |
| 7.4 本章小结 | 第121-122页 |
| 结论 | 第122-124页 |
| 参考文献 | 第124-144页 |
| 附录A 沙棘果肉和种子脂肪酸组分的动态变化 | 第144-147页 |
| 附录B 5种沙棘组织中与脂类代谢途径相关的差异表达基因和pathway富集结果 | 第147-148页 |
| 附录C 果肉vs.种子差异表达基因GO功能分类图 | 第148-149页 |
| 附录D GPD1、KAS Ⅱ、Δ9D和SAD基因同源蛋白序列比对 | 第149-153页 |
| 附录E 不同生育期果肉和种子转录组测序碱基质量统计图 | 第153-154页 |
| 附录F 沙棘果肉和种子中甘油酯代谢通路(ko00561) | 第154-155页 |
| 附录G 沙棘果肉和种子中甘油磷脂代谢通路(ko00564) | 第155-156页 |
| 附录H 沙棘果肉和种子中脂肪酸合成途径(ko00061) | 第156-157页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第157-158页 |
| 致谢 | 第158-159页 |
