| 致谢 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第14-40页 |
| 1 可变剪接的研究背景及进展 | 第14-28页 |
| 1.1 可变剪接的分析技术及常见模式 | 第15-18页 |
| 1.2 可变剪接的起源和进化 | 第18-23页 |
| 1.3 可变剪接的调控机制 | 第23-25页 |
| 1.4 可变剪接与疾病 | 第25-28页 |
| 1.5 可变剪接的生物学意义 | 第28页 |
| 2 互斥剪接的研究进展 | 第28-31页 |
| 3 黑腹果蝇MRP互斥剪接研究背景及进展 | 第31-33页 |
| 4 果蝇Dscam基因互斥剪接的研究背景及进展 | 第33-36页 |
| 5 蛋白相互作用研究背景及进展 | 第36-37页 |
| 6 本项目研究内容和意义 | 第37-38页 |
| 7 本项目研究技术路线 | 第38-40页 |
| 7.1 实验方案 | 第39-40页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第40-54页 |
| 2.2 主要实验仪器和试剂 | 第40-41页 |
| 2.2.1 主要实验仪器 | 第40-41页 |
| 2.2.2 主要试剂和耗材 | 第41页 |
| 2.3 实验室常用试剂配制 | 第41-42页 |
| 2.4 MRP基因 | 第42-51页 |
| 2.4.1 果蝇相关物种MRP基因序列信息的收集和生物信息学分析 | 第42页 |
| 2.4.2 果蝇MRP引物设计 | 第42-44页 |
| 2.4.3 RCR产物连接 | 第44页 |
| 2.4.4 转化 | 第44-45页 |
| 2.4.5 DNA和RCR产物的回收 | 第45页 |
| 2.4.6 质粒DNA提取 | 第45-46页 |
| 2.4.7 T载体或PMT/V5载体构建的载体的酶切鉴定 | 第46页 |
| 2.4.8 果蝇S2细胞的培养 | 第46-47页 |
| 2.4.9 果蝇S2细胞转染 | 第47-48页 |
| 2.4.10 果蝇材料及果蝇S2细胞的RNA抽提 | 第48-49页 |
| 2.4.11 RNA反转录 | 第49-50页 |
| 2.4.12 目的片段的酶切鉴定 | 第50页 |
| 2.4.13 果蝇物种DNA模板的制备 | 第50-51页 |
| 2.5 Dscam基因 | 第51-54页 |
| 2.5.1 Dscam基因的引物设计 | 第51-52页 |
| 2.5.2 Dscam基因相关目的片段的克隆实验方法同2.4 | 第52页 |
| 2.5.3 DNA的抽提 | 第52-53页 |
| 2.5.4 RNA的抽提 | 第53-54页 |
| 第三章 果蝇MRP互斥可变剪接相关的顺式元件及其二级结构的进化保守性分析 | 第54-79页 |
| 3.1 研究背景和立项依据 | 第54页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第54-77页 |
| 3.2.1 实验室两套果蝇MRP互斥剪接mini基因表达系统 | 第54-58页 |
| 3.2.2 果蝇MRP基因外显子8簇剪接强度分析 | 第58-59页 |
| 3.2.3 果蝇MRP基因外显子8簇内含子上的保守性分析 | 第59-61页 |
| 3.2.4 果蝇MRP基因调控元件的研究 | 第61-66页 |
| 3.2.5 果蝇MRP基因中RNA二级结构介导的互斥可变剪接 | 第66-77页 |
| 3.3 总结与讨论 | 第77-79页 |
| 第四章 Dscam互斥可变剪接相关的顺式元件及其RNA二级结构的进化保守性分析 | 第79-95页 |
| 4.1 Dscam基因外显子4簇互斥可变剪接顺式元件及RNA二级结构的分析 | 第79-82页 |
| 4.2 Dscam基因外显子6簇互斥可变剪接顺式元件及RNA二级结构的分析 | 第82-87页 |
| 4.3 Dscam基因外显子9簇互斥可变剪接顺式元件及RNA二级结构的分析 | 第87-93页 |
| 4.3.1 Dscam基因外显子9簇进化保守性分析 | 第87-88页 |
| 4.3.2 Dscam基因外显子9簇顺式元件及RNA二级结构的分析 | 第88-93页 |
| 4.4 总结与讨论 | 第93-95页 |
| 第五章 果蝇Nc73EF、Srp和Eb1等基因互斥可变剪接相关的顺式元件及其二级结构的进化保守性分析 | 第95-104页 |
| 5.1 研究背景和立项依据 | 第95页 |
| 5.2 结果与分析 | 第95-103页 |
| 5.2.1 果蝇Nc73EF基因互斥可变剪接相关顺式作用元件和RNA二级结构分析 | 第97-99页 |
| 5.2.2 果蝇Eb1基因互斥可变剪接相关顺式作用元件和RNA二级结构分析 | 第99-100页 |
| 5.2.3 果蝇Srp基因互斥可变剪接相关顺式作用元件和RNA二级结构分析 | 第100-103页 |
| 5.3 结论和总结 | 第103-104页 |
| 第六章 RNA互斥可变剪接相关的蛋白的基因进化保守性初步分析 | 第104-126页 |
| 6.0 研究背景与立项依据 | 第104-105页 |
| 6.1 果蝇等模式生物剪接因子蛋白互作网络进化分析 | 第105-111页 |
| 6.2 S.mimosarum在模式生物中的直系同源基因的预测 | 第111-112页 |
| 6.3 S。mimodsrum直系同源基因不同物种中保守基因 | 第112-115页 |
| 6.4 S.mimosarum蛋白相互作用预测 | 第115-120页 |
| 6.5 高节点数分析 | 第120-121页 |
| 6.6 GO分类的分析 | 第121-123页 |
| 6.7 S.mimosarum参与剪接的蛋白相互作用预测 | 第123-124页 |
| 6.8 结论和总结 | 第124-126页 |
| 第七章 结论与展望 | 第126-129页 |
| 7.1 结论 | 第126-127页 |
| 7.2 创新点 | 第127-128页 |
| 7.3 未来的工作展望 | 第128-129页 |
| 参考文献 | 第129-140页 |
