| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 英文缩写词表 | 第9-14页 |
| 第一篇 文献综述 | 第14-30页 |
| 第一章 牛子宫内膜炎的研究进展 | 第14-22页 |
| 1.1 牛子宫内膜炎的危害 | 第14-15页 |
| 1.2 牛子宫内膜炎的发病原因 | 第15-16页 |
| 1.3 牛子宫内膜炎的诊断 | 第16-18页 |
| 1.3.1 临床诊断 | 第16页 |
| 1.3.2 试验室诊断 | 第16页 |
| 1.3.3 血液生理生化指标辅助诊断 | 第16-17页 |
| 1.3.4 实验室诊断 | 第17-18页 |
| 1.4 牛子宫内膜炎的治疗 | 第18-20页 |
| 1.4.1 子宫内疗法 | 第18页 |
| 1.4.2 全身疗法 | 第18-19页 |
| 1.4.3 生物疗法 | 第19页 |
| 1.4.4 激素疗法 | 第19页 |
| 1.4.5 中医疗法 | 第19-20页 |
| 1.5 牛子宫内膜炎的预防 | 第20-22页 |
| 1.5.1 严格操作规程 | 第20页 |
| 1.5.2 加强饲养管理 | 第20-22页 |
| 第二章 分子标记的发展及在农业中的应用 | 第22-30页 |
| 2.1 SNP标记的优点 | 第22页 |
| 2.2 SNP标记检测方法 | 第22-30页 |
| 2.2.1 经典的检测方法 | 第22-23页 |
| 2.2.2 高通量SNP检测技术 | 第23-27页 |
| 2.2.3 微进化研究进展 | 第27-30页 |
| 第二篇 研究内容 | 第30-80页 |
| 第三章 牛子宫内膜炎的流行病学调查 | 第30-40页 |
| 3.1 材料和方法 | 第30-33页 |
| 3.1.1 材料 | 第30-31页 |
| 3.1.2 仪器设备 | 第31-32页 |
| 3.1.3 实验方法 | 第32-33页 |
| 3.2 结果与分析 | 第33-36页 |
| 3.2.1 牛子宫内膜炎的诊断 | 第33页 |
| 3.2.2 调查地区奶牛场的基本情况 | 第33-34页 |
| 3.2.3 调查地区奶牛子宫内膜炎的发病率 | 第34页 |
| 3.2.4 牛子宫内膜炎发病率与季节相关性分析 | 第34-35页 |
| 3.2.5 子宫内膜炎发病率与胎次相关性 | 第35页 |
| 3.2.6 牛子宫内膜炎发病率与牧场管理水平的相关性 | 第35-36页 |
| 3.3 讨论 | 第36-38页 |
| 3.3.1 牛子宫内膜炎发病率与胎次相关性 | 第36-37页 |
| 3.3.2 牛子宫内膜炎发病率与季节相关性 | 第37页 |
| 3.3.3 牛子宫内膜炎发病率与牧场管理水平的相关性 | 第37-38页 |
| 3.4 小结 | 第38-40页 |
| 第四章 牛子宫内容物病原微生物的分离鉴定 | 第40-48页 |
| 4.1 材料和方法 | 第40-43页 |
| 4.1.1 样品采集 | 第40页 |
| 4.1.2 主要培养基及配制 | 第40-41页 |
| 4.1.3 主要仪器设备 | 第41-42页 |
| 4.1.4 细菌的分离纯化与鉴定 | 第42页 |
| 4.1.5 细菌的实验室鉴定 | 第42页 |
| 4.1.6 病原菌的生化鉴定 | 第42-43页 |
| 4.2 结果与分析 | 第43-46页 |
| 4.3 讨论 | 第46-47页 |
| 4.4 小结 | 第47-48页 |
| 第五章 患子宫内膜炎牛血液生理生化指标分析 | 第48-54页 |
| 5.1 材料和方法 | 第48-49页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第48页 |
| 5.1.2 主要实验器材与试剂 | 第48页 |
| 5.1.3 血液生理生化指标测定参数 | 第48-49页 |
| 5.1.4 数据计算 | 第49页 |
| 5.2 结果与分析 | 第49-50页 |
| 5.3 讨论 | 第50-53页 |
| 5.3.1 血液生理指标变化 | 第50-52页 |
| 5.3.2 血液生化指标变化 | 第52-53页 |
| 5.4 小结 | 第53-54页 |
| 第六章 牛子宫内容物微生物多样性测序分析 | 第54-64页 |
| 6.1 材料和方法 | 第54-55页 |
| 6.1.1 实验材料 | 第54页 |
| 6.1.2 生物试剂 | 第54页 |
| 6.1.3 普通试剂 | 第54页 |
| 6.1.4 牛子宫内容物生物多样性测序分析 | 第54-55页 |
| 6.2 结果与分析 | 第55-62页 |
| 6.2.1 细菌DNA提取 | 第55-56页 |
| 6.2.2 测序数据预处理统计及质控 | 第56-57页 |
| 6.2.3 OTU分析和物种注释 | 第57页 |
| 6.2.5 物种相对丰度展示 | 第57-58页 |
| 6.2.6 特定物种分类树展示 | 第58-60页 |
| 6.2.7 物种丰度聚类热图 | 第60-61页 |
| 6.2.8 基于OTU的Venn图 | 第61-62页 |
| 6.3 讨论 | 第62-63页 |
| 6.4 小结 | 第63-64页 |
| 第七章 郏县红牛和荷斯坦奶牛SNP差异分析 | 第64-78页 |
| 7.1 材料和方法 | 第64-65页 |
| 7.1.1 试验材料 | 第64页 |
| 7.1.2 试验试剂 | 第64页 |
| 7.1.3 主要溶液配制 | 第64页 |
| 7.1.4 试验方法 | 第64-65页 |
| 7.2 结果与分析 | 第65-73页 |
| 7.2.1 DNA提取及检测 | 第65页 |
| 7.2.2 SLAF-seq测序 | 第65-70页 |
| 7.2.3 郏县红牛和荷斯坦奶牛的群体遗传分析 | 第70-71页 |
| 7.2.4 Fst群体选择分析 | 第71-73页 |
| 7.3 讨论 | 第73-76页 |
| 7.3.1 荷斯坦奶牛和郏县红牛子宫内膜炎发病率分析 | 第73页 |
| 7.3.2 荷斯坦奶牛和郏县红牛差异基因分析 | 第73-75页 |
| 7.3.3 荷斯坦奶牛和郏县红牛群体选择分析 | 第75-76页 |
| 7.4 小结 | 第76-78页 |
| 第八章 结论 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-87页 |
| 附录 | 第87-93页 |
| 附录一 各种培养基制备 | 第87-89页 |
| 附录二 细菌革兰氏鉴定方法 | 第89-90页 |
| 附录三 溶液配制 | 第90-91页 |
| 附录四 血样DNA的提取 | 第91-93页 |
| 导师简介 | 第93-94页 |
| 作者简介 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95页 |
