基于色谱—质谱联用的大肠杆菌代谢特征分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-21页 |
| ·代谢组学与微生物代谢组学 | 第10-11页 |
| ·代谢组学范畴及应用 | 第10页 |
| ·微生物代谢组学相关定义 | 第10-11页 |
| ·微生物代谢组学分析技术 | 第11-14页 |
| ·气相色谱质谱联用技术 | 第12-13页 |
| ·液相色谱质谱联用技术 | 第13-14页 |
| ·多平台整合与其他质谱技术 | 第14页 |
| ·微生物代谢组学分析方法研究进展 | 第14-17页 |
| ·实验方案设计必要性 | 第14-15页 |
| ·数据分析策略 | 第15-16页 |
| ·生物分析原则 | 第16-17页 |
| ·微生物样品采集与预处理 | 第17-19页 |
| ·分析样品的代表性 | 第17-18页 |
| ·微生物生长的重复性 | 第18页 |
| ·样品制备及其快速淬灭 | 第18-19页 |
| ·胞内代谢物的提取 | 第19页 |
| ·问题与展望 | 第19-20页 |
| ·本论文研究的内容和意义 | 第20-21页 |
| 第二章 大肠杆菌代谢指纹分析方法的建立 | 第21-31页 |
| ·前言 | 第21页 |
| ·实验材料 | 第21-23页 |
| ·仪器和试剂 | 第21-22页 |
| ·实验菌株 | 第22页 |
| ·培养基及培养条件 | 第22-23页 |
| ·实验方法 | 第23-26页 |
| ·大肠肝菌胞内代谢物提取条件优化 | 第23-24页 |
| ·淬灭及提取方法 | 第24页 |
| ·流式细胞实验 | 第24页 |
| ·GC-MS衍生方法 | 第24-25页 |
| ·标准溶液配制 | 第25页 |
| ·GC-MS分析条件 | 第25页 |
| ·LC-MS分析条件 | 第25-26页 |
| ·结果与讨论 | 第26-30页 |
| ·微生物代谢物淬灭方法的确定 | 第26-27页 |
| ·能荷变化 | 第27-28页 |
| ·流式细胞试验 | 第28-30页 |
| ·GC-MS指纹图谱的比较 | 第30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第三章 代谢指纹分析揭示菌株氧依赖性 | 第31-40页 |
| ·前言 | 第31页 |
| ·实验材料 | 第31-32页 |
| ·仪器和试剂 | 第31-32页 |
| ·实验菌株 | 第32页 |
| ·培养基及培养条件 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-34页 |
| ·细菌培养条件 | 第32页 |
| ·细胞干重的测定 | 第32-33页 |
| ·样品淬灭和提取 | 第33页 |
| ·衍生方法 | 第33页 |
| ·GC-MS分析条件 | 第33页 |
| ·LC-MS分析条件 | 第33-34页 |
| ·结果与讨论 | 第34-38页 |
| ·胞内代谢物GC-MS与LC-MS指纹图谱 | 第34-35页 |
| ·差异化合物代谢通路分析 | 第35-37页 |
| ·菌株的生长曲线 | 第37-38页 |
| ·本章小结 | 第38-40页 |
| 第四章 大肠杆菌未知功能基因的高通量分析 | 第40-50页 |
| ·前言 | 第40页 |
| ·实验材料 | 第40-42页 |
| ·仪器和试剂 | 第40-41页 |
| ·试验菌株 | 第41-42页 |
| ·培养基 | 第42页 |
| ·实验方法 | 第42-43页 |
| ·细菌培养条件 | 第42页 |
| ·标准品溶液制备及无菌处理 | 第42页 |
| ·样品处理 | 第42页 |
| ·衍生方法 | 第42-43页 |
| ·GC-MS分析条件 | 第43页 |
| ·结果与讨论 | 第43-49页 |
| ·饱和烷烃保留指数建立 | 第43-44页 |
| ·高通量筛选化合物保留指数的计算 | 第44-46页 |
| ·大肠杆菌的高通量分析 | 第46-49页 |
| ·GC-MS分析图谱 | 第46-47页 |
| ·表型区分 | 第47页 |
| ·SAM分析 | 第47-49页 |
| ·本章小结 | 第49-50页 |
| 第五章 液相色谱质谱联用用于大大肠杆菌 | 第50-60页 |
| ·前言 | 第50页 |
| ·实验材料 | 第50-51页 |
| ·菌株、培养基及培养条件 | 第50页 |
| ·仪器和试剂 | 第50-51页 |
| ·实验方法 | 第51-53页 |
| ·培养条件 | 第51-52页 |
| ·样品处理 | 第52页 |
| ·大肠杆菌总RNA提取 | 第52页 |
| ·RNA水解及进样准备 | 第52页 |
| ·LC-MS/MS条件 | 第52-53页 |
| ·标准溶液的配置 | 第53页 |
| ·数据分析 | 第53页 |
| ·结果和讨论 | 第53-59页 |
| ·MRM检测条件确定 | 第53-54页 |
| ·色谱柱选择 | 第54-55页 |
| ·方法的检出限及线性范围 | 第55-56页 |
| ·方法的回收率和精密度 | 第56-57页 |
| ·大肠杆菌中核苷含量的测定 | 第57-59页 |
| ·本章小结 | 第59-60页 |
| 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
