| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-28页 |
| ·引言 | 第15-16页 |
| ·动物遗传育种的发展 | 第16-17页 |
| ·分子标记的发展 | 第17-18页 |
| ·SNP分子标记的研究及其在动物育种中的应用 | 第18-22页 |
| ·SNP分子标记的研究进展 | 第18-19页 |
| ·SNP在动物遗传育种中的应用 | 第19-20页 |
| ·候选基因集法 | 第20-22页 |
| ·贝类免疫研究进展 | 第22-23页 |
| ·细胞防御系统 | 第22-23页 |
| ·体液免疫防御系统 | 第23页 |
| ·贝类免疫相关基因研究进展 | 第23-26页 |
| ·巨噬细胞迁移抑制因子(Macrophage migration inhibitory factor , MIF) | 第24页 |
| ·血清淀粉样蛋白A(Serum amyloid A, SAA) | 第24-25页 |
| ·血浆内皮细胞生长因子(Vascular endothelias growth factor, VEGF) | 第25-26页 |
| ·相关基因的调控关系 | 第26页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第26-28页 |
| 第二章 MmMIF基因单体型对文蛤弧菌抗性的相关研究 | 第28-55页 |
| ·材料与方法 | 第28-35页 |
| ·实验群体 | 第28-29页 |
| ·试验引物 | 第29-30页 |
| ·弧菌刺激实验 | 第30页 |
| ·总RNA、基因组DNA的提取与cDNA的合成 | 第30-32页 |
| ·文蛤MmMIF基因的克隆 | 第32页 |
| ·MmMIF基因SNP的挖掘与分析 | 第32页 |
| ·MmMIF基因的定点突变与突变基因重组表达载体的构建 | 第32-33页 |
| ·突变型与野生型MmMIF蛋白的原核重组表达与纯化 | 第33页 |
| ·MmMIF蛋白酶活性的检测 | 第33-34页 |
| ·特定单体型文蛤肝胰脏中MmMIF mRNA在弧菌刺激后的表达变化 | 第34-35页 |
| ·数据分析 | 第35页 |
| ·结果 | 第35-51页 |
| ·MmMIF基因的序列分析 | 第35-39页 |
| ·MmMIF基因中SNP在弧菌抗性群体中的发掘 | 第39-42页 |
| ·MmMIF基因组SNP与文蛤弧菌抗性的关联分析 | 第42-45页 |
| ·MmMIF（wild-type & mutant）重组蛋白的表达与纯化 | 第45-46页 |
| ·SNP g.737(A>T)定点突变对MmMIF融合蛋白酶活性的影响 | 第46-49页 |
| ·Mm MIF 的组织表达分析 | 第49页 |
| ·不同单体型对MmMIF基因响应弧菌刺激的影响 | 第49-51页 |
| ·讨论 | 第51-55页 |
| 第三章 MmSAA基因的克隆及其SNP与文蛤生长性状和弧菌抗性的关联分析 | 第55-76页 |
| ·材料与方法 | 第56-61页 |
| ·试验动物 | 第56页 |
| ·试验引物 | 第56-57页 |
| ·弧菌刺激实验 | 第57-58页 |
| ·总RNA、基因组DNA的提取与cDNA的合成 | 第58页 |
| ·文蛤血清淀粉样蛋白酶A(MmSAA)基因的克隆 | 第58-59页 |
| ·MmSAA基因在文蛤不同组织和弧菌攻毒个体中的表达 | 第59页 |
| ·MmSAA基因的SNP探索与分型 | 第59页 |
| ·MmSAA基因的定点突变和原核重组表达载体的构建 | 第59-60页 |
| ·MmSAA重组蛋白对大肠杆菌生长的影响 | 第60页 |
| ·数据分析 | 第60-61页 |
| ·结果 | 第61-72页 |
| ·MmSAA基因序列分析 | 第61-63页 |
| ·MmSAA的组织表达分析 | 第63-64页 |
| ·副溶血弧菌刺激对文蛤肝胰脏中MmSAA基因mRNA表达的影响 | 第64-65页 |
| ·MmSAA基因中SNP在文蛤群体中的发掘 | 第65-67页 |
| ·MmSAA基因组SNP与文蛤弧菌抗性的关联分析 | 第67-69页 |
| ·MmSAA基因组SNP与文蛤生长相关性状的关联分析 | 第69-71页 |
| ·MmSAA(wild-type & mutant)重组蛋白对大肠杆菌的影响 | 第71-72页 |
| ·讨论 | 第72-76页 |
| 第四章 MmVEGFA基因多态性与文蛤弧菌抗性的关联分析及其与MmMIF基因间的交互作用研究 | 第76-92页 |
| ·材料与方法 | 第77-79页 |
| ·试验动物 | 第77页 |
| ·试验引物 | 第77-78页 |
| ·总RNA、基因组DNA的提取与cDNA的合成 | 第78页 |
| ·文蛤血管内皮生长因子(MmVEGFA)基因的克隆 | 第78-79页 |
| ·MmVEGFA基因的SNP发掘与分型 | 第79页 |
| ·数据分析 | 第79页 |
| ·实验结果 | 第79-90页 |
| ·MmVEGFA基因的序列分析 | 第79-83页 |
| ·MmVEGFA基因中SNP在弧菌抗性群体的分型 | 第83-85页 |
| ·MmVEGFA基因组SNP与文蛤弧菌抗性的关联分析 | 第85-88页 |
| ·tagSNP的选择 | 第88页 |
| ·文蛤弧菌抗性tagSNP的Logistic回归分析 | 第88-90页 |
| ·MDR软件对文蛤弧菌抗性tagSNP的互作分析 | 第90页 |
| ·讨论 | 第90-92页 |
| 结论 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-112页 |
| 作者简历 | 第112-113页 |
| 在学期间发表和完成的文章 | 第113页 |
