| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-12页 |
| 表目录 | 第12-13页 |
| 图目录 | 第13-14页 |
| 缩略词 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-23页 |
| ·传统遗传评估 | 第15页 |
| ·动物育种中的DNA | 第15-16页 |
| ·全基因组关联分析 | 第16-19页 |
| ·QTL定位的传统方法 | 第16-17页 |
| ·全基因组关联分析 | 第17页 |
| ·影响GWAS的因素 | 第17-18页 |
| ·GWAS的应用 | 第18-19页 |
| ·基因组选择 | 第19-21页 |
| ·基因组预测 | 第19-20页 |
| ·基因组预测准确性的影响因素 | 第20-21页 |
| ·多品种分析 | 第21页 |
| ·结合GWAS与GS | 第21页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第21-23页 |
| 第二章 中国荷斯坦牛体型性状全基因组关联分析 | 第23-33页 |
| ·引言 | 第23页 |
| ·试验材料与方法 | 第23-26页 |
| ·表型和基因型数据 | 第23-25页 |
| ·统计方法 | 第25-26页 |
| ·结果 | 第26-29页 |
| ·乳用特征 | 第27页 |
| ·容量 | 第27页 |
| ·尻部 | 第27页 |
| ·肢蹄性状 | 第27-28页 |
| ·泌乳系统 | 第28页 |
| ·总分 | 第28-29页 |
| ·讨论 | 第29-32页 |
| ·结论 | 第32-33页 |
| 第三章 丹麦荷斯坦牛乳房炎性状全基因组关联分析 | 第33-49页 |
| ·引言 | 第33-34页 |
| ·试验材料与方法 | 第34-37页 |
| ·表型和基因型数据 | 第34页 |
| ·统计分析 | 第34-37页 |
| ·结果与分析 | 第37-44页 |
| ·基于两种模型和不同密度芯片的结果分析 | 第37-38页 |
| ·QTL intensity结果分析 | 第38-44页 |
| ·讨论 | 第44-46页 |
| ·两种模型的结果比较 | 第44页 |
| ·三个不同密度标记的比较 | 第44-45页 |
| ·QTL区域 | 第45-46页 |
| ·结论 | 第46-49页 |
| 第四章 参考群和验证群之间的亲缘关系以及参考群内部的亲缘关系对基因组预测可靠性的影响 | 第49-58页 |
| ·前言 | 第49-50页 |
| ·方法 | 第50-51页 |
| ·表型和基因型数据 | 第50页 |
| ·统计分析 | 第50-51页 |
| ·验证 | 第51页 |
| ·结果 | 第51-56页 |
| ·参考群和验证群的亲缘关系对基因组预测可靠性的影响 | 第51-52页 |
| ·参考群内部亲缘关系对基因组预测的影响 | 第52页 |
| ·三种模型基因组预测的比较 | 第52-56页 |
| ·讨论 | 第56-57页 |
| ·参考群和验证群体之间的亲缘关系 | 第56页 |
| ·参考群内部的亲缘关系 | 第56-57页 |
| ·基因组预测模型 | 第57页 |
| ·结论 | 第57-58页 |
| 第五章 结合QTL信息对北欧荷斯坦牛和红牛的基因组预测 | 第58-72页 |
| ·引言 | 第58页 |
| ·材料和方法 | 第58-61页 |
| ·数据 | 第58-59页 |
| ·统计分析模型 | 第59-61页 |
| ·验证 | 第61页 |
| ·结果 | 第61-69页 |
| ·参考群和验证群对基因组预测可靠性的影响 | 第61-63页 |
| ·GBLUP模型与BMIX模型比较 | 第63-64页 |
| ·单品种和多品种基因组预测 | 第64-65页 |
| ·结合QTL信息进行基因组预测 | 第65-69页 |
| ·讨论 | 第69-71页 |
| ·参考群和验证群之间的亲缘关系对基因组预测可靠性的影响 | 第69-70页 |
| ·GBLUP模型和BMIX模型基因组预测结果 | 第70页 |
| ·单品种和多品种基因组预测 | 第70页 |
| ·结合QTL信息进行基因组预测 | 第70-71页 |
| ·结论 | 第71-72页 |
| 第六章 结论 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 个人简介 | 第84页 |
