缩略词表 | 第1-5页 |
摘要 | 第5-6页 |
Summary | 第6-8页 |
第一章 文献综述 | 第8-16页 |
·马铃薯概述 | 第8页 |
·马铃薯抗旱分子机理研究的必要性 | 第8页 |
·植物抗旱分子机理研究进展 | 第8-11页 |
·干旱胁迫信号的感知 | 第9-10页 |
·干旱胁迫信号的转导 | 第10-11页 |
·植物通过干旱胁迫信号诱导基因进行表达 | 第11页 |
·转录后水平上干旱胁迫应答基因的调节和控制 | 第11页 |
·转录组测序和基因表达谱技术概述 | 第11-13页 |
·高通量测序技术的研究现状 | 第11-12页 |
·第二代测序技术 | 第12页 |
·第三代测序技术 | 第12页 |
·数字化基因表达谱(DGE) | 第12-13页 |
·数字化基因表达谱简介 | 第12-13页 |
·数字化基因表达谱的优点 | 第13页 |
·数字基因表达谱的应用 | 第13页 |
·实时荧光定量 PCR 技术的应用 | 第13-14页 |
·本研究的主要内容和研究意义 | 第14-16页 |
第二章 干旱胁迫马铃薯叶片转录组分析 | 第16-29页 |
·前言 | 第16页 |
·材料与方法 | 第16-18页 |
·植物生长条件和胁迫处理 | 第16页 |
·样品总 RNA 提取 | 第16-17页 |
·转录组测序 | 第17页 |
·Reads 质量预处理 | 第17页 |
·参考基因组比对 | 第17-18页 |
·基因表达丰度和差异表达基因分析 | 第18页 |
·GO 和 KEGG 富集分析 | 第18页 |
·结果与分析 | 第18-25页 |
·Reads 质量预处理和参考基因组比对 | 第18-19页 |
·基因表达分析 | 第19-20页 |
·GO 注释 | 第20-22页 |
·KEGG 分析 | 第22-23页 |
·差异表达基因的鉴定 | 第23-25页 |
·讨论 | 第25-29页 |
第三章 干旱胁迫下马铃薯叶片差异表达基因的验证分析 | 第29-37页 |
·前言 | 第29页 |
·材料和方法 | 第29-30页 |
·植物材料和干旱处理 | 第29页 |
·RNA 提取和反转录 | 第29页 |
·实时荧光定量 PCR(qRT-PCR)检测 | 第29-30页 |
·数据分析 | 第30页 |
·结果与分析 | 第30-34页 |
·qRT-PCR 的可靠性和稳定性 | 第30页 |
·干旱诱导的基因表达差异分析 | 第30-34页 |
·干旱处理马铃薯转录因子的表达分析 | 第30-31页 |
·干旱处理马铃薯脯氨酸代谢相关基因的表达分析 | 第31-32页 |
·干旱处理马铃薯抗氧化防御系统基因的表达分析 | 第32-33页 |
·干旱处理马铃薯类黄酮生物合成基因的表达分析 | 第33页 |
·干旱处理马铃薯信号转导相关基因的表达分析 | 第33-34页 |
·讨论 | 第34-37页 |
第四章 结论 | 第37-38页 |
参考文献 | 第38-45页 |
附表 1 干旱处理相对对照叶片的差异表达基因的 GO 富集分析 | 第45-50页 |
附表 2 干旱处理相对对照叶片的差异表达基因的 KEGG 富集分析 | 第50-51页 |
附表 3 qRT-PCR 所用的特异性引物 | 第51-53页 |
致谢 | 第53-54页 |
作者简介 | 第54-55页 |
张宁导师简介 | 第55-56页 |