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干旱胁迫马铃薯叶片转录组分析

缩略词表第1-5页
摘要第5-6页
Summary第6-8页
第一章 文献综述第8-16页
   ·马铃薯概述第8页
   ·马铃薯抗旱分子机理研究的必要性第8页
   ·植物抗旱分子机理研究进展第8-11页
     ·干旱胁迫信号的感知第9-10页
     ·干旱胁迫信号的转导第10-11页
     ·植物通过干旱胁迫信号诱导基因进行表达第11页
     ·转录后水平上干旱胁迫应答基因的调节和控制第11页
   ·转录组测序和基因表达谱技术概述第11-13页
     ·高通量测序技术的研究现状第11-12页
       ·第二代测序技术第12页
       ·第三代测序技术第12页
     ·数字化基因表达谱(DGE)第12-13页
       ·数字化基因表达谱简介第12-13页
       ·数字化基因表达谱的优点第13页
       ·数字基因表达谱的应用第13页
   ·实时荧光定量 PCR 技术的应用第13-14页
   ·本研究的主要内容和研究意义第14-16页
第二章 干旱胁迫马铃薯叶片转录组分析第16-29页
   ·前言第16页
   ·材料与方法第16-18页
     ·植物生长条件和胁迫处理第16页
     ·样品总 RNA 提取第16-17页
     ·转录组测序第17页
     ·Reads 质量预处理第17页
     ·参考基因组比对第17-18页
     ·基因表达丰度和差异表达基因分析第18页
     ·GO 和 KEGG 富集分析第18页
   ·结果与分析第18-25页
     ·Reads 质量预处理和参考基因组比对第18-19页
     ·基因表达分析第19-20页
     ·GO 注释第20-22页
     ·KEGG 分析第22-23页
     ·差异表达基因的鉴定第23-25页
   ·讨论第25-29页
第三章 干旱胁迫下马铃薯叶片差异表达基因的验证分析第29-37页
   ·前言第29页
   ·材料和方法第29-30页
     ·植物材料和干旱处理第29页
     ·RNA 提取和反转录第29页
     ·实时荧光定量 PCR(qRT-PCR)检测第29-30页
     ·数据分析第30页
   ·结果与分析第30-34页
     ·qRT-PCR 的可靠性和稳定性第30页
     ·干旱诱导的基因表达差异分析第30-34页
       ·干旱处理马铃薯转录因子的表达分析第30-31页
       ·干旱处理马铃薯脯氨酸代谢相关基因的表达分析第31-32页
       ·干旱处理马铃薯抗氧化防御系统基因的表达分析第32-33页
       ·干旱处理马铃薯类黄酮生物合成基因的表达分析第33页
       ·干旱处理马铃薯信号转导相关基因的表达分析第33-34页
   ·讨论第34-37页
第四章 结论第37-38页
参考文献第38-45页
附表 1 干旱处理相对对照叶片的差异表达基因的 GO 富集分析第45-50页
附表 2 干旱处理相对对照叶片的差异表达基因的 KEGG 富集分析第50-51页
附表 3 qRT-PCR 所用的特异性引物第51-53页
致谢第53-54页
作者简介第54-55页
张宁导师简介第55-56页

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