调控拟穴青蟹卵巢发育的眼柄转录组学分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第1章 引言 | 第10-21页 |
| ·拟穴青蟹生物学特征 | 第10页 |
| ·激素对虾蟹生殖的调控 | 第10-14页 |
| ·CHH家族在生殖中的作用 | 第10-12页 |
| ·GSFs在虾蟹类生殖中的作用 | 第12-13页 |
| ·类固醇激素在虾蟹类生殖中的作用 | 第13页 |
| ·前列腺素及其他哺乳动物激素在虾蟹类生殖中的作用 | 第13-14页 |
| ·神经递质在虾蟹生殖中的作用 | 第14-15页 |
| ·虾蟹类生殖相关的细胞周期调控 | 第15-16页 |
| ·虾蟹性腺发育调控相关信号通路 | 第16-18页 |
| ·ERK信号通路 | 第16页 |
| ·泛素和类泛素化修饰途径 | 第16-18页 |
| ·第二代高通量测序技术 | 第18-19页 |
| ·454焦磷酸测序的基本原理和方法 | 第18页 |
| ·高通量测序技术在水产生物研究中的应用 | 第18-19页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第19-20页 |
| ·主要研究内容和技术路线 | 第20-21页 |
| ·主要研究内容 | 第20页 |
| ·技术路线 | 第20-21页 |
| 第2章 材料与方法 | 第21-32页 |
| ·材料 | 第21-26页 |
| ·拟穴青蟹 | 第21页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第21页 |
| ·引物序列 | 第21-26页 |
| ·主要应用软件与生物信息学网站 | 第26页 |
| ·方法 | 第26-32页 |
| ·总RNA提取 | 第26-27页 |
| ·454高通量测序及生物信息学分析 | 第27页 |
| ·测序结果的统计分析 | 第27页 |
| ·SMART-RACE技术克隆基因全长 | 第27-30页 |
| ·石蜡切片及HE染色 | 第30页 |
| ·半定量PCR | 第30-31页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第31-32页 |
| 第3章 结果 | 第32-72页 |
| ·转录组分析 | 第32-45页 |
| ·ESTs序列的分析和拼接 | 第32-35页 |
| ·转录子的表达注释 | 第35-36页 |
| ·GO和KEGG分析 | 第36-37页 |
| ·性腺发育调控及免疫相关转录子的分类 | 第37-43页 |
| ·差异表达基因分析 | 第43页 |
| ·半定量PCR验证 | 第43页 |
| ·实时荧光定量PCR验证 | 第43-45页 |
| ·CHH家族神经肽相关基因分析 | 第45页 |
| ·卵巢发育调控相关基因的克隆与序列分析 | 第45-66页 |
| ·Sp-CHH3基因序列分析 | 第45-49页 |
| ·Sp-VIH-like序列分析 | 第49-51页 |
| ·Sp-Gnb1基因序列分析 | 第51-56页 |
| ·Sp143-3ζ 基因序列分析 | 第56-60页 |
| ·Sp-MK2基因序列分析 | 第60-66页 |
| ·ERK信号通路相关基因的表达特征 | 第66-72页 |
| ·各基因在拟穴青蟹雌性个体各组织中的表达水平 | 第66-68页 |
| ·卵巢发育过程中各基因在卵巢和眼柄中的表达变化 | 第68-72页 |
| 第4章 讨论 | 第72-79页 |
| ·转录组 | 第72-74页 |
| ·EST序列 | 第72页 |
| ·转录子注释 | 第72页 |
| ·GO和KEGG | 第72页 |
| ·性腺发育调控及免疫相关转录子的分类 | 第72-73页 |
| ·差异表达基因 | 第73-74页 |
| ·卵巢发育调控相关基因 | 第74-79页 |
| ·Sp-CHH3基因 | 第74-75页 |
| ·Sp-VIH-like基因 | 第75页 |
| ·Sp-Gnb1基因 | 第75-76页 |
| ·Sp143-3ζ 基因 | 第76-77页 |
| ·Sp-MK2基因 | 第77页 |
| ·ERK信号通路在调控卵巢发育中的作用 | 第77-79页 |
| 第5章 结论与展望 | 第79-81页 |
| ·结论 | 第79页 |
| ·展望 | 第79-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-92页 |
| 在学期间发表的学术论文 | 第92页 |
