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细菌Novosphingobium sp.B-7和Comamonas sp.B-9降解木质素及其降解基因研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-10页
目录第10-13页
1 文献综述第13-35页
   ·木质素来源、结构和性质第13-22页
     ·木质素来源第13页
     ·木质素结构第13-18页
     ·木质素性质第18-21页
     ·木质素的环境污染问题第21-22页
   ·木质素的生物降解研究进展第22-27页
     ·历史概况第22-23页
     ·降解木质素的微生物种类第23-25页
     ·木质素的生物降解酶系第25-27页
   ·木质素生物降解分子生物学研究进展第27-29页
     ·木质素降解真菌的分子生物学研究第27-28页
     ·木质素降解细菌的分子生物学研究第28-29页
   ·研究意义、目的与思路第29-35页
     ·研究意义第29-31页
     ·研究目的第31-32页
     ·研究思路第32-33页
     ·本论文的创新点第33-35页
2 Novosphingobium sp.B-7和Comamonas sp.B-9木质素降解性能研究第35-47页
   ·引言第35页
   ·材料与方法第35-38页
     ·试剂和菌株第35-36页
     ·菌株的分子鉴定及分类分析第36页
     ·木质素生物降解菌株的筛选第36页
     ·木质素生物降解培养条件及实验过程第36-37页
     ·细菌生长、TC及COD的测定第37页
     ·木质素降解率测定第37页
     ·木质素降解酶活测定第37-38页
   ·Novosphingobium SP.B-7和Comamonas SP.B-9木质素降解性能分析第38-46页
     ·木质素降解菌株的分类鉴定及筛选第38-40页
     ·细菌生长及COD去除第40-41页
     ·木质素降解与TC去除第41-44页
     ·木质素降解酶活第44-46页
   ·小结第46-47页
3 Novosphingobium sp.B-7和Comamonas sp.B-9木质素解聚研究第47-63页
   ·引言第47-48页
   ·材料与方法第48-50页
     ·实验程序及培养条件第48页
     ·扫描电镜(SEM)检测第48页
     ·凝胶渗透色谱(GPC)检测第48-49页
     ·气相色谱-质谱联用(GC-MS)检测第49-50页
   ·Novosphingobium SP.B-7和Comamonas SP.B-9的木质素解聚分析第50-62页
     ·木质素颗粒形貌变化及菌体细胞生长形态第50-53页
     ·细菌处理后木质素的分子量变化第53-55页
     ·木质素降解产物分析第55-62页
   ·小结第62-63页
4 Novosphingobium sp.B-7和Comamonas sp.B-9木质素脱色研究第63-71页
   ·引言第63页
   ·材料与方法第63-64页
     ·菌株培养及实验条件第63-64页
     ·脱色率测定第64页
     ·紫外吸光光谱扫描第64页
     ·傅里叶红外光谱(FTIR)检测第64页
   ·Novosphingobium SP.B-7和Comamonas SP.B-9的木质素脱色分析第64-70页
     ·Novosphingobium sp.B-7和Comamonas sp.B-9的木质素脱色性能第64-66页
     ·紫外吸收光谱分析第66-67页
     ·傅里叶红外吸收光谱分析第67-70页
   ·小结第70-71页
5 Novosphingobium sp.B-7和Comamonas sp.B-9全基因组测序及注释第71-92页
   ·引言第71-72页
   ·材料与方法第72-76页
     ·菌株培养及细胞收集第72页
     ·菌株的全基因组提取第72-73页
     ·菌株的全基因组测序第73-75页
     ·测序数据的组装第75页
     ·基因组注释第75-76页
   ·Novosphingobium SP.B-7和Comamonas SP.B-9全基因组生物信息学分析第76-91页
     ·菌株的基因组组装结果评价第76-80页
     ·菌株基因组基本信息第80-81页
     ·基因预测第81-84页
     ·非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)预测第84-85页
     ·基因功能注释第85-91页
     ·基因组测序数据及基因注释数据提交第91页
   ·小结第91-92页
6 Novosphingobium sp.B-7和Comamonas sp.B-9木质素降解基因克隆与鉴定第92-113页
   ·引言第92-94页
   ·材料与方法第94-100页
     ·菌株培养与基因组提取第94页
     ·木质素降解相关基因挖掘第94页
     ·基因PCR克隆及引物设计第94-96页
     ·逆转录基因扩增(RT-PCR)第96-100页
     ·基因序列nr/nt库BLAST比对第100页
   ·Novosphingobium SP.B-7和Comamonas SP.B-9木质素降解相关基因第100-112页
     ·木质素降解相关基因注释第100-106页
     ·木质素降解相关基因的克隆第106-108页
     ·RT-PCR获取的木质素降解相关基因第108-110页
     ·木质素降解相关基因的nr/nt库BLAST比对第110-112页
   ·小结第112-113页
7 结论与建议第113-116页
   ·结论第113-114页
   ·建议与展望第114-116页
参考文献第116-132页
攻读学位期间主要的研究成果第132-134页
致谢第134-135页

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