冷胁迫下东乡野生稻表达谱测序分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 缩略词 | 第7-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 第一章 综述 | 第10-19页 |
| ·低温对水稻生长发育期的影响 | 第10-11页 |
| ·水稻芽期和苗期冷害 | 第10页 |
| ·水稻孕穗期冷害 | 第10-11页 |
| ·水稻开花灌浆期冷害 | 第11页 |
| ·水稻对低温胁迫的响应 | 第11-12页 |
| ·细胞膜 | 第11-12页 |
| ·光合作用和激素调节 | 第12页 |
| ·提高水稻的抗寒性的途径 | 第12-13页 |
| ·水稻杂种优势研究进展 | 第13页 |
| ·水稻抗寒基因的研究进展 | 第13-14页 |
| ·新一代测序技术及其应用 | 第14-16页 |
| ·基因组测序和多态性检测 | 第15页 |
| ·转录组测序及小RNA分析 | 第15-16页 |
| ·ChlP-chip和ChlP-Seq | 第16页 |
| ·转录组分析 | 第16-18页 |
| ·基因芯片 | 第17页 |
| ·基因表达系列分析技术与大规模平行测序技术 | 第17页 |
| ·RNA-Seq | 第17-18页 |
| ·研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 材料和方法 | 第19-23页 |
| ·苗期抗寒性鉴定的实验材料和方法 | 第19-20页 |
| ·材料来源 | 第19页 |
| ·水稻培育及低温处理 | 第19页 |
| ·相对电导率测定 | 第19页 |
| ·成苗率测定 | 第19页 |
| ·杂种优势分析 | 第19-20页 |
| ·表达谱分析数据的材料和方法 | 第20-23页 |
| ·材料来源 | 第20页 |
| ·表达谱分析材料处理 | 第20页 |
| ·水稻材料RNA提取 | 第20-21页 |
| ·原始序列数据 | 第21页 |
| ·去除杂质数据 | 第21页 |
| ·基因表达量 | 第21页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第21-22页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第22-23页 |
| 第三章 结果与分析 | 第23-31页 |
| ·水稻苗期抗寒性 | 第23-24页 |
| ·冷处理时间和温度的确定 | 第23页 |
| ·基于相对电导率和成苗率的杂种优势分析 | 第23-24页 |
| ·表达谱分析 | 第24-31页 |
| ·RNA质量报告 | 第24-25页 |
| ·Reads与全基因组比对情况 | 第25-26页 |
| ·基因表达水平比较 | 第26-28页 |
| ·东野的抗寒基因和抗寒机制的研究 | 第28-31页 |
| 第四章 讨论 | 第31-34页 |
| ·苗期抗寒性的鉴定 | 第31页 |
| ·测序数据处理面临的挑战 | 第31-32页 |
| ·水稻抗寒机制分析 | 第32-34页 |
| 参考文献 | 第34-38页 |
| 致谢 | 第38-39页 |
| 作者在学期间主要的学术成果 | 第39页 |
