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土壤中烟草青枯病菌分子检测方法研究

 摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
1 绪论第12-27页
   ·引言第12-13页
   ·病害发生分布与危害第13-14页
   ·病原菌生物学特性第14-15页
     ·R.solanacearum 的分类地位第14页
     ·R.solanacearum 的形态及存活条件第14页
     ·R.solanacearum 的寄主范围第14-15页
     ·R.solanacearum 的侵染途径第15页
   ·R.SOLANACEARUM 检测研究现状第15-20页
     ·常规检测法第15页
     ·指示植物法第15-16页
     ·血清学方法第16-17页
     ·分子生物学方法第17-20页
   ·荧光定量PCR 技术在土壤微生物检测中的应用第20-24页
     ·提取和纯化土壤微生物总DNA 的研究进展第21-23页
     ·荧光定量PCR 技术在土壤病原微生物检测中的应用第23-24页
   ·研究目标与内容第24-25页
     ·研究目标第24页
     ·主要研究内容第24-25页
   ·技术路线第25页
   ·创新点第25-27页
2 烟草青枯病菌常规PCR 检测体系的建立第27-34页
   ·材料与仪器第27-29页
     ·供试菌株第27页
     ·主要培养基第27页
     ·细菌基因组DNA 提取试剂第27-28页
     ·其他主要试剂第28页
     ·主要仪器设备第28-29页
   ·实验方法第29-31页
     ·细菌基因组DNA 的制备(CTAB 法)第29-30页
     ·烟草青枯病菌常规PCR 检测体系的建立第30-31页
   ·结果与分析第31-34页
     ·引物的筛选第31-32页
     ·常规PCR 检测体系的建立和优化第32页
     ·常规PCR 检测体系性能测定第32-34页
3 土壤中烟草青枯病菌常规PCR 检测体系的建立第34-43页
   ·材料与仪器第34页
     ·供试土壤样品第34页
     ·土壤基因组DNA 提取试剂第34页
     ·实验仪器第34页
   ·实验方法第34-37页
     ·土壤样品的采集第34页
     ·土壤基因组总DNA 的制备第34-36页
     ·土壤中烟草青枯病菌常规PCR 体系的优化建立第36页
     ·PCR 扩增产物克隆、转化和鉴定第36-37页
   ·结果与分析第37-43页
     ·土壤样品的采集第37-39页
     ·土壤基因组总DNA 制备方法的比较第39-41页
     ·土壤中烟草青枯病菌常规PCR 体系的优化建立第41-42页
     ·PCR 产物扩增条带正确性的验证第42-43页
4 土壤中烟草青枯病菌荧光定量PCR 检测体系的建立第43-57页
   ·材料与仪器第43页
     ·供试菌株第43页
     ·主要试剂第43页
     ·实验仪器第43页
   ·实验方法第43-46页
     ·烟草青枯病植株根际微生物的分离筛选第43页
     ·SYBR GreenⅠ荧光染料RTi-PCR 检测体系的建立第43-45页
     ·TaqMan 探针RTi-PCR 检测体系的建立第45页
     ·两种RTi-PCR 检测体系的比较与评价第45-46页
   ·结果与分析第46-57页
     ·烟草青枯病植株根际微生物的分离筛选第46页
     ·SYBR GreenⅠ荧光染料RTi-PCR 检测体系的建立第46-50页
     ·TaqMan 探针RTi-PCR 检测体系的建立第50-54页
     ·两种RTi-PCR 检测体系的比较与评价第54-57页
5 烟草青枯病菌检测试剂盒的初步研制第57-59页
   ·材料与仪器第57页
     ·主要试剂第57页
     ·实验仪器第57页
   ·实验方法第57-58页
     ·标准阳性对照品的制备第57页
     ·烟草青枯病菌常规PCR 检测试剂盒的制备和性能测试第57页
     ·烟草青枯病菌RTi-PCR 检测试剂盒的制备和性能测试第57-58页
   ·结果与分析第58-59页
     ·烟草青枯病菌常规PCR 检测试剂盒的制备和性能测试第58页
     ·烟草青枯病菌RTi-PCR 检测试剂盒的制备和性能测试第58-59页
6 讨论第59-62页
   ·引物和探针的设计及其检测特异性第59页
   ·RTI-PCR 中扩增片段长度对检测效果的影响第59页
   ·不同土壤基因组DNA 提取方法对检测结果的影响第59-60页
   ·常规PCR 和RTI-PCR 检测性能对检测结果的影响第60页
   ·两种RTI-PCR 检测体系的比较与评价第60-61页
   ·PCR 检测假阳性与假阴性的排除与降低第61页
   ·烟草青枯病菌分子检测试剂盒的评价第61-62页
7 主要结论与后续工作展望第62-64页
   ·主要结论第62页
   ·后续工作展望第62-64页
致谢第64-65页
参考文献第65-72页
附录第72-76页
 A 烟草青枯病田间危害图第72页
 B PCR 扩增片段测序结果及比对图第72-74页
 C 攻读硕士学位期间参与的科研项目第74页
 D 攻读硕士学位期间发表的论文目录第74页
 E 攻读硕士学位期间撰写的专利第74-76页

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